Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
JH
Jorge Henao-Meija
Author with expertise in Role of Long Noncoding RNAs in Cancer and Development
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(50% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
3
/
i10-index:
1
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

The Firre locus produces a trans-acting RNA molecule that functions in hematopoiesis

Jordan Lewandowski et al.May 24, 2019
RNA has been classically known to play central roles in biology, including maintaining telomeres, protein synthesis, and in sex chromosome compensation in certain species. At the center of these important biological systems are noncoding RNAs. While thousands of long noncoding RNAs (lncRNAs) have been identified in mammalian genomes, attributing RNA-based roles to lncRNA loci requires an assessment of whether the observed effect could be due to DNA regulatory elements, the act of transcription, or the lncRNA transcript. Here, we use the syntenically conserved lncRNA locus, Functional intergenic repeating RNA element (Firre), that is located on the X chromosome as a model to discriminate between DNA- and RNA-mediated effects in vivo. To this end, we generated genetically defined loss-of-function, gain-of-function, and rescue mouse models for Firre and provide genetic evidence that the Firre locus produces a trans-acting RNA. We report that: (i) Firre mutant mice have cell-specific defects during hematopoiesis and changes in gene expression that can be rescued by induction of Firre RNA from a transgene in the Firre knockout background, (ii) mice overexpressing Firre from a transgene exhibit increased levels of pro-inflammatory cytokines and impaired survival upon exposure to lipopolysaccharide, and (iii) deletion of the Firre locus did not result in changes in local gene expression on the X chromosome in 9 different biological contexts, suggesting that Firre does not function by cis-acting RNA or DNA elements. Together, our results provide genetic evidence that the Firre locus produces a trans-acting lncRNA that has physiological roles in hematopoiesis and immune function.
4

Increased activity of IRE1 improves the clinical presentation of EAE

Valerie Bracchi‐Ricard et al.Apr 20, 2023
Activation of the ER stress sensor IRE1α contributes to neuronal development and is known to induce neuronal remodeling in vitro and in vivo. On the other hand, excessive IRE1 activity is often detrimental and may contribute to neurodegeneration. To determine the consequences of increased activation of IRE1α, we used a mouse model expressing a C148S variant of IRE1α with increased and sustained activation. Surprisingly, the mutation did not affect the differentiation of highly secretory antibody-producing cells, but exhibited a strong protective effect in a mouse model of experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE). Significant improvement in motor function was found in IRE1C148S mice with EAE relative to WT mice. Coincident with this improvement, there was reduced microgliosis in the spinal cord of IRE1C148S mice, with reduced expression of pro-inflammatory cytokine genes. This was accompanied by reduced axonal degeneration and enhanced CNPase levels, suggestiing improved myelin integrity. Interestingly, while the IRE1C148S mutation is expressed in all cells, the reduction in proinflammatory cytokines and in the activation of microglial activation marker IBA1, along with preservation of phagocytic gene expression, all point to microglia as the cell type contributing to the clinical improvement in IRE1C148S animals. Our data suggest that sustained increase in IRE1α activity can be protective in vivo, and that this protection is cell type and context dependent. Considering the overwhelming but conflicting evidence for the role of the ER stress in neurological diseases, a better understanding of the function of ER stress sensors in physiological contexts is clearly needed.