Abstract The association between pediatric high-grade gliomas (HGG) and cancer predisposition syndromes (CPS) remains inadequately elucidated in the existing literature, while next-generation sequencing (NGS) is increasingly utilized for diagnostic support. In this retrospective analysis, we evaluated a cohort of 95 consecutive pediatric patients with HGG reclassified according to the latest 2021 WHO classification, diagnosed and treated at the Bambino Gesù Children’s Hospital between 2011 and 2023. All patients underwent genetic germline testing with NGS technology to detect the presence of germline variants predisposing to cancer and were included in this study. Diagnosis of pHGG H3-IDH wild-type was performed in 23 patients (24.2%), diffuse midline glioma in 46 patients (48.4%), astrocytoma IDH-mutant in 7 patients (7.4%), anaplastic pleomorphic xanthoastrocytoma in 4 patients (4.2%), adult type HGG in 4 patients (4.2%), neuroepithelial tumor PATZ1 fusion-positive in 3 patients (3.2%), diffuse hemispheric glioma H3 G34-mutant in 2 patients (2.1%), infant-type hemisheric glioma in 2 patients (2.1%), other rare histologies in 4 patients (4.2%). Oncological family history was investigated up to the third generation for all patients and was positive in 43/95 (45.3%) cases. We identified a total of 65 variants in 95 patients, distributed as follows: 48 variants of uncertain significance (73.8%), 10 likely pathogenic (15.4%), and 7 pathogenic variants (10.8%). Notably, our findings reveal that pathogenic/likely pathogenic variants were detected in about 17% of the entire study population, higher than the 10% incidence reported in the existing literature. The high rate of mutations in CPS associated genes described in our work, leads to consider performing NGS even in the absence of clinical or anamnestic criteria suggestive of it. However, ethical and social issues are to be considered when we propose and investigate patients for CPS. Moreover, further research are needed to determine the role of variants of uncertain significance.

ADNP syndrome, also known as Helsmoortel-van Der Aa syndrome, is a neurodevelopmental condition associated with intellectual disability/developmental delay, autism spectrum disorder, and multiple medical comorbidities. ADNP syndrome is caused by mutations in the activity-dependent neuroprotective protein (ADNP). A recent study identified genome-wide DNA methylation changes in 22 individuals with ADNP syndrome, adding to the group of neurodevelopmental disorders with an epigenetic signature. This methylation signature segregated those with ADNP syndrome into two groups, based on the location of the mutations. Here, we conducted an independent study on 24 individuals with ADNP syndrome and replicated the existence of the two, mutation-dependent ADNP episignatures. To probe whether the two distinct episignatures correlate with clinical outcomes, we used deep behavioral and neurobiological data from two prospective cohorts of individuals with a genetic diagnosis of ADNP syndrome. We found limited phenotypic differences between the two ADNP groups, and no evidence that individuals with more widespread methylation changes are more severely affected. Also, in spite of the methylation changes, we observed no profound alterations in the blood transcriptome of individuals with ADNP syndrome. Our data warrant caution in harnessing methylation signatures in ADNP syndrome as a tool for clinical stratification, at least with regards to behavioral phenotypes.

ABSTRACT Turner‐type X‐linked syndromic intellectual developmental disorder (MRXST) is a neurodevelopmental disorder associated with variants in the HUWE1 gene on chromosome Xp11. The condition is characterized by variable phenotypes, including global developmental delay, intellectual disability, and distinctive facial dysmorphisms, with inheritance patterns ranging from X‐linked recessive to de novo mutations in females. Here, we describe five probands in two families, highlighting their clinical features and genetic findings. Trio whole‐exome sequencing identified a de novo variant in HUWE1 in the proband in one family and a maternally inherited hemizygous variant in three boys in a second family. A comprehensive review of HUWE1 ‐associated cases from the literature assisted genotype–phenotype correlations, revealing consistent features such as intellectual disability, skeletal anomalies, and facial dysmorphisms as well as instances of intrafamilial variability. Our findings confirm the phenotypic variability of MRXST and underscore the significance of the HUWE1 gene product in neurodevelopment. We propose a baseline monitoring protocol to aid in diagnosis and management, contributing to the development of specific guidelines for patient follow‐up.

Background/Objectives: The nuclear factor (NF)-kB essential modulator (NEMO) has a crucial role in the NFκB pathway. Hypomorphic IKBKG pathogenic variants cause ectodermal dysplasia with immunodeficiency (EDA-ID) in affected males. However, heterozygous amorphic IKBKG variants could be responsible for Incontinentia Pigmenti (IP) in female carriers. Typically, IP patients do not exhibit immunodeficiency, although hypomorphic variants might lead to immunodeficiency in female IP patients. Here, we report the case of an IKBKG female carrier, with no IP but an unexpected picture of immunodeficiency. She had a positive family history for the same genetic condition. Methods: We performed immunological, molecular, and functional analysis to evaluate NEMO contribution. Results: The patient was healthy until the age of 25 when severe asthma and Hashimoto thyroiditis occurred. She had HLAB27-positive ankylosing spondylitis, non-tubercular mycobacteriosis, and pulmonary aspergillosis infections. We found CD19+ B cell lymphopenia and T cell subset alterations. Sanger sequencing revealed a heterozygous IKBKG variant at position +1 of the 5′ UTR of the gene which disrupted the normal pre-mRNA splicing. We observed a decreased NEMO protein expression, a reduced level of mRNA, and a defective NF-κB pathway. Conclusions: These findings suggest a possible correlation between the partial loss of NEMO function and the immunodeficiency observed in this patient. This case could expand our understanding of NEMO deficiency in female carriers.