Aqueous and methanol extracts of the leaves of Juniperus oxycedrus were investigated for their in vitro antimicrobial properties. The plant was collected from Pelitli Village of Gebze, Kocaeli, in the Marmara region of Turkey. Juniperus oxycedrus is widely used as traditional folk medicine in Turkey for treatment of different infectious diseases. The antimicrobial activity of the extracts against 143 laboratory strains belonging to 56 bacterial species, and 31 isolates of 5 fungi species were evaluated based on the inhibition zone using the disc-diffusion assay, minimal inhibition concentration (MIC) and minimal bactericidal concentration (MBC) values. The aqueous extract of J. oxycedrus had no antimicrobial effect against the test microorganisms whereas the methanol extract had inhibitory effects on the growth of 57 strains of 24 bacterial species in the genera of Acinetobacter, Bacillus, Brevundimonas, Brucella, Enterobacter, Escherichia, Micrococcus, Pseudomonas, Staphylococcus, and Xanthomonas. In addition 11 Candida albicans isolates at a concentration of 31.25–250 μg/ml were also inhibited.

The present study was conducted to evaluate the antimicrobial activities, antioxidant and properties of essential oils and methanol extracts of Origanum vulgare ssp. vulgare plants. The chemical composition of a hydrodistilled essential oil of O. vulgare ssp. vulgare was analyzed by a GC/MS system. A total 62 constituents were identified. Caryophyllene and spathulenol were found to be the main constituents, followed by germacrene-D and α-terpineol. Antioxidant activity was measured employing two methods namely, scavenging of free radical DPPH and the inhibition of linoleic acid oxidation by methanol extracts and the essential oil of O. vulgare ssp. vulgare. Antioxidant studies suggested that methanol extract behaved as a strong free radical scavenger providing IC50 at only 9.9 μg/ml, whereas the oil showed weaker activity with IC50 at 8.9 mg/ml. Total phenolic constituents based on gallic acid equivalents revealed the presence of total soluble phenolics in the extract as 220 μg/mg dry extract (22%, w/w) and, most probably, they are responsible for the radical scavenging activity of methanol extracts. Methanol extract was not effectively able to inhibit linoleic acid oxidation and only 32% inhibition was achieved at 2 mg/ml concentration, far below that of the positive control (butylated hyroxytoluene, BHT) at the same concentration. However, 2.2 mg/ml essential oil solutions provided 50% inhibition in the linoleic acid oxidation test system. The antimicrobial test results showed that the essential oil of O. vulgare ssp. vulgare had great potential of antimicrobial activity against all 10 bacteria, and 15 fungi and yeast species tested. In contrast, the methanol extract from aerial parts of O. vulgare plant showed no antimicrobial activity. The result may suggest that the essential oil O. vulgare ssp. vulgare possesses compounds with antimicrobial properties as well as antioxidant activity, and therefore can be used as a natural preservative ingredient in food and/or pharmaceutical industry.

This study was conducted with sugar beet in greenhouse and field at two soil type with different organic matter (containing 2.4 and 15.9% OM, referred as the low- and high-OM soil) conditions in order to investigate seed inoculation of sugar beet, with five N2-fixing and two phosphate solubilizing bacteria in comparison to control and mineral fertilizers (N and P) application. Three bacterial strains dissolved P; all bacterial strains fixed N2 and significantly increased growth of sugar beet. In the greenhouse, inoculations with PGPR increased sugar beet root weight by 2.8–46.7% depending on the species. Leaf, root and sugar yield were increased by the bacterial inoculation by 15.5–20.8, 12.3–16.1, and 9.8–14.7%, respectively, in the experiment of low- and high-OM soil. Plant growth responses were variable and dependent on the inoculants strain, soil organic matter content, growing stage, harvest date and growth parameter evaluated. The effect of PGPR was greater at early growth stages than at the later. Effective Bacillus species, such as OSU-142, RC07 and M-13, Paenibacillus polymyxa RC05, Pseudomonas putida RC06 and Rhodobacter capsulatus RC04 may be used in organic and sustainable agriculture.

The present study was conducted to evaluate the in vitro antimicrobial and antioxidant properties of essential oil and methanol extracts from a unique and endemic plant, Thymus spathulifolius (Hausskn. and Velen.). The antimicrobial test results showed that the essential oil of T. spathulifolius strongly inhibited the growth of test microorganisms studied, except for 4 fungi species while polar and non-polar subfractions of the methanol extract had moderate antibacterial, but not antifungal and anticandidal activity. The antioxidative potential of the samples was evaluated using two separate methods, inhibition of free radical 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH) and β-carotene–linoleic acid systems. The polar subfraction of the methanol extract was able to reduce the stable free radical 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH) with an IC50 of 16.15 ± 0.5 μg/ml, which was lower than that of synthetic antioxidant, BHT, (19.8 ± 0.5 μg/ml). Inhibition values of linoleic acid oxidation were calculated as 92% and 89% for the oil and the polar subfraction, respectively. Gallic acid equivalent total phenolic constituent of the polar subfraction was 141.00 ± 0.90 μg/mg (14.1%, w/w). The chemical composition of a hydrodistilled essential oil of T. spathulifolius was analyzed by a GC and GC/MS system. A total of 28 constituents representing 99.2% of the oil were identified; thymol (36.5%), carvacrol (29.8%), p-cymene (10.0%) and γ-terpinene (6.3%) were the main components comprising 82.6% of the oil. Results presented here may suggest that the essential oil and extracts of T. spathulifolius possess antimicrobial and antioxidant properties, and therefore, they can be used as a natural preservative ingredient in food and/or pharmaceutical industry.

The present study was designated to evaluate the antimicrobial and antioxidant activities of the essential oil, obtained by using a Clevenger distillation apparatus, water soluble (polar) and water insoluble (nonpolar) subfractions of the methanol extracts from aerial parts of Satureja hortensis L. plants, and methanol extract from calli established from the seeds using Gamborg's B5 basal media supplemented with indole-3-butyric acid (1.0 ppm), 6-benzylaminopurine (N6-benzyladenine) (1.0 ppm), and sucrose (2.5%). The antimicrobial test results showed that the essential oil of S. hortensis had great potential antimicrobial activities against all 23 bacteria and 15 fungi and yeast species tested. In contrast, the methanol extract from callus cultures and water soluble subfraction of the methanol extract did not show antimicrobial activities, but the nonpolar subfraction had antibacterial activity against only five out of 23 bacterial species, which were Bacillus subtilis, Enterococcus fecalis, Pseudomonas aeruginosa, Salmonella enteritidis, and Streptococcus pyogenes. Antioxidant studies suggested that the polar subfractions of the methanol extract of intact plant and methanol extract of callus cultures were able to reduce the stable free radical 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl to the yellow-colored diphenylpicrylhydrazine. In this assay, the strongest effect was observed for the tissue culture extract, with an IC50 value of 23.76 ± 0.80 μg/mL, which could be compared with the synthetic antioxidant agent butylated hydroxytoluene. On the other hand, linoleic acid oxidation was 95% inhibited in the presence of the essential oil while the inhibition was 90% with the chloroform subfraction of the intact plant. The chemical composition of a hydrodistilled essential oil of S. hortensis was analyzed by gas chromatography (GC)/flame ionization detection (FID) and a GC-mass spectrometry system. A total 22 constituents representing 99.9% of the essential oil were identified by GC-FID analaysis. Thymol (29.0%), carvacrol (26.5%), γ-terpinene (22.6%), and p-cymene (9.3%) were the main components. Keywords: Antimicrobial activity; antioxidant activity; Satureja hortensis; GC-FID analysis; callus cultures

Two novel series of 4-thiazolidinone derivatives, namely 2-substituted-3-([4-(4-methoxybenzoylamino)benzoyl]amino)-4-thiazolidinones (7a-e) and 2-[4-(4-methoxybenzoylamino)benzoylhydrazono]-3-alkyl-4-thiazolidinones (5a-c) together with 2-[4-(4-methoxybenzoylamino)phenyl]-5-(substituted phenyl)amino-1,3,4-oxadiazoles (6a-c) have been synthesised as title compounds. N(1)-[4-(4-methoxybenzoylamino)benzoyl]-N(2)-substituted methylene hydrazines (3a-e) and 1-[4-(4-methoxybenzoylamino)benzoyl]-4-substituted phenyl thiosemicarbazides (4a-f) were also prepared and used as intermediate to give the title compounds. All synthesised compounds were screened for their antimycobacterial activity against Mycobacterium tuberculosis H37Rv and antimicrobial activities against various bacteria and fungi. Compounds 7a and 7b were found as the most active derivatives demonstrating 90 and 98% inhibition of mycobacterial growth of M. tuberculosis H37Rv in the primary screen at 6.25 microg mL(-1), respectively. However, level II assay revealed that the MIC values were not less than 6.25 microg mL(-1). None of the compounds showed significant antimicrobial activity against the microorganisms used whereas 3a and 7a inhibited the growth of several bacteria and fungi.

Abstract Purpose: mTOR and P70 S6 kinase (S6K) play a key role in regulating protein translation. The role of mTOR and S6K in hepatocellular carcinoma has not been investigated, but this pathway is of particular interest because an effective inhibitor, rapamycin, is available. This study was undertaken to determine the prevalence and clinicopathological correlates of mTOR pathway activation in hepatocellular carcinoma and to determine whether rapamycin inhibits the pathway in cell culture. Experimental Design: Total and phosphorylated mTOR and S6K protein expression were studied by immunohistochemistry in hepatocellular carcinomas (n = 73), fibrolamellar carcinomas (n = 13), and hepatic adenomas (n = 15). Results were correlated with tumor growth pattern as defined by the WHO (trabecular, pseudoglandular/acinar, compact, and scirrhous), tumor size, Ki-67 proliferation index, and the modified Edmondson nuclear grade, which has a scale of 1 to 4. HepG2 and Hep3B cell lines were treated with rapamycin to see the effect on proliferation and S6K phosphorylation. Results: Increased expression of total mTOR was seen in 5% of hepatocellular carcinoma, whereas overexpression of phospho-mTOR was evident in 15% of hepatocellular carcinoma. Phospho-mTOR positivity correlated with increased expression of total S6K, which was found in 45% of cases. Total S6K overexpression was positively correlated with tumor nuclear grade, inversely with tumor size, and was unassociated with the proliferation index or WHO growth pattern. Rapamycin treatment of HepG2 and Hep3B cell lines markedly inhibited cell proliferation and reduced S6K phosphorylation in both cell lines. Conclusions: The mTOR pathway is activated in a subset of hepatocellular carcinoma. Rapamycin can inhibit proliferation of neoplastic hepatocytes in cell culture.

During 2003 and 2005, plant growth promoting effects of two Bacillus strains OSU-142 (N2-fixing) and M3 (N2-fixing and phosphate solubilizing) were tested alone or in combinations on organically grown primocane fruiting raspberry (cv. Heritage) plants in terms of yield, growth, nutrient composition of leaves and variation of soil nutrient element composition in the province of Erzurum, Turkey. The results showed that Bacillus M3 treatment stimulated plant growth and resulted in significant yield increase. Inoculation of raspberry plant roots and rhizosphere with M3 and/or OSU-142 + M3, significantly increased yield (33.9% and 74.9%), cane length (13.6% and 15.0%), number of cluster per cane (25.4% and 28.7%) and number of berries per cane (25.1% and 36.0%) compared with the control, respectively. In addition, N, P and Ca contents of raspberry leaves with OSU-142 + M3 treatment, and Fe and Mn contents of the leaves of raspberry with M3 and OSU-142 + M3 applications significantly improved under organic growing conditions. Bacterial applications also significantly effected soil total N, available P, K, Ca, Mg, Fe, Mn, Zn contents and pH. Available P contents in soil was determined to be increased from 1.55 kg P2O5/da at the beginning of the study to 2.83 kg P2O5/da by OSU-142, to 5.36 kg P2O5/da by M3 and to 4.71 kg P2O5/da by OSU-142 + M3 treatments. The results of this study suggest that Bacillus M3 alone or in combination with Bacillus OSU-142 have the potential to increase the yield, growth and nutrition of raspberry plant under organic growing conditions.

Abstract The SARS-CoV-2 virus caused the most severe pandemic around the world, and vaccine development for urgent use became a crucial issue. Inactivated virus formulated vaccines such as Hepatitis A, oral polio vaccine, and smallpox proved to be reliable approaches for immunization for prolonged periods. During the pandemic, we produced an inactivated SARS-CoV-2 vaccine candidate, having the advantages of being manufactured rapidly and tested easily in comparison with recombinant vaccines. In this study, an inactivated virus vaccine that includes a gamma irradiation process for the inactivation as an alternative to classical chemical inactivation methods so that there is no extra purification required has been optimized. The vaccine candidate (OZG-38.61.3) was then applied in mice by employing the intradermal route, which decreased the requirement of a higher concentration of inactivated virus for proper immunization, unlike most of the classical inactivated vaccine treatments. Hence, the novelty of our vaccine candidate (OZG-38.61.3) is that it is a non-adjuvant added, gamma-irradiated, and intradermally applied inactive viral vaccine. Efficiency and safety dose (either 10 13 or 10 14 viral copy per dose) of OZG-38.61.3 was initially determined in Balb/c mice. This was followed by testing the immunogenicity and protective efficacy of OZG-38.61.3. Human ACE2-encoding transgenic mice were immunized and then infected with a dose of infective SARS-CoV-2 virus for the challenge test. Findings of this study show that vaccinated mice have lower SARS-CoV-2 viral copy number in oropharyngeal specimens along with humoral and cellular immune responses against the SARS-CoV-2, including the neutralizing antibodies similar to those shown in Balb/c mice without substantial toxicity. Subsequently, plans are being made for the commencement of Phase 1 clinical trial of the OZG-38.61.3 vaccine for the COVID-19 pandemic.