Abstract Studies on human monocytes historically focused on characterization of bulk responses, whereas functional heterogeneity is largely unknown. Here, we identified an inducible population of CD127-expressing human monocytes under inflammatory conditions and named the subset M127. M127 is nearly absent in healthy individuals yet abundantly present in patients with infectious and inflammatory conditions such as COVID-19 and rheumatoid arthritis. Multiple genomic and functional approaches revealed unique gene signatures of M127 and unified anti-inflammatory properties imposed by the CD127-STAT5 axis. M127 expansion correlated with mild COVID-19 disease outcomes. Thereby, we phenotypically and molecularly characterized a human monocyte subset marked by CD127 that retained anti-inflammatory properties within the pro-inflammatory environments, uncovering remarkable functional diversity among monocytes and signifying M127 as a potential therapeutic target for human inflammatory disorders.

Abstract Background and aims The 2022 European Society of Cardiology/European Respiratory Society (ESC/ERS) guideline has recently revised the hemodynamic definition of pulmonary arterial hypertension. However, there is currently limited research on the prognosis and treatment of system lupus erythematosus-associated pulmonary arterial hypertension (SLE-PAH) patients that have been reclassified by the new hemodynamic definition. This study aims to analyze the prognosis of newly reclassified SLE-PAH patients and provide recommendations for the management strategy. Methods This retrospective study analyzed records of 236 SLE-PAH patients who visited Peking Union Medical College Hospital (PUMCH) from 2011 to 2023, among whom 22 patients were reclassified into mild SLE-PAH (mean pulmonary arterial pressure (mPAP) of 21–24 mmHg, pulmonary vascular resistance (PVR) of 2–3 WU, and PAWP ≤ 15 mmHg) according to the guidelines and 14 were defined as unclassified SLE-PAH patients (mPAP 21–24 mmHg and PVR ≤ 2 WU). The prognosis was compared among mild SLE-PAH, unclassified SLE-PH, and conventional SLE-PAH patients (mPAP ≥ 25 mmHg and PVR > 3WU). Besides, the effectiveness of pulmonary arterial hypertension (PAH)-specific therapy was evaluated in mild SLE-PAH patients. Results Those mild SLE-PAH patients had significantly longer progression-free time than the conventional SLE-PAH patients. Among the mild SLE-PAH patients, 4 did not receive PAH-specific therapy and had a similar prognosis as patients not receiving specific therapy. Conclusions This study supports the revised hemodynamic definition of SLE-PAH in the 2022 ESC/ERS guideline. Those mild and unclassified SLE-PH patients had a better prognosis, demonstrating the possibility and significance of early diagnosis and intervention for SLE-PAH. This study also proposed a hypothesis that IIT against SLE might be sufficient for those reclassified SLE-PAH patients.

Abstract Background Cell‐free long RNAs in human plasma and extracellular vesicles (EVs) have shown promise as biomarkers in liquid biopsy, despite their fragmented nature. Methods To investigate these fragmented cell‐free RNAs (cfRNAs), we developed a cost‐effective cfRNA sequencing method called DETECTOR‐seq (depletion‐assisted multiplexed cell‐free total RNA sequencing). DETECTOR‐seq utilised a meticulously tailored set of customised guide RNAs to remove large amounts of unwanted RNAs (i.e., fragmented ribosomal and mitochondrial RNAs) in human plasma. Early barcoding strategy was implemented to reduce costs and minimise plasma requirements. Results Using DETECTOR‐seq, we conducted a comprehensive analysis of cell‐free transcriptomes in both whole human plasma and EVs. Our analysis revealed discernible distributions of RNA types in plasma and EVs. Plasma exhibited pronounced enrichment in structured circular RNAs, tRNAs, Y RNAs and viral RNAs, while EVs showed enrichment in messenger RNAs (mRNAs) and signal recognition particle RNAs (srpRNAs). Functional pathway analysis highlighted RNA splicing‐related ribonucleoproteins (RNPs) and antimicrobial humoral response genes in plasma, while EVs demonstrated enrichment in transcriptional activity, cell migration and antigen receptor‐mediated immune signals. Our study indicates the comparable potential of cfRNAs from whole plasma and EVs in distinguishing cancer patients (i.e., colorectal and lung cancer) from healthy donors. And microbial cfRNAs in plasma showed potential in classifying specific cancer types. Conclusions Our comprehensive analysis of total and EV cfRNAs in paired plasma samples provides valuable insights for determining the need for EV purification in cfRNA‐based studies. We envision the cost effectiveness and efficiency of DETECTOR‐seq will empower transcriptome‐wide investigations in the fields of cfRNAs and liquid biopsy. Keypoints DETECTOR‐seq (depletion‐assisted multiplexed cell‐free total RNA sequencing) enabled efficient and specific depletion of sequences derived from fragmented ribosomal and mitochondrial RNAs in plasma. Distinct human and microbial cell‐free RNA (cfRNA) signatures in whole Plasma versus extracellular vesicles (EVs) were revealed. Both Plasma and EV cfRNAs were capable of distinguishing cancer patients from normal individuals, while microbial RNAs in Plasma cfRNAs enabled better classification of cancer types than EV cfRNAs.

Systemic lupus erythematosus (SLE) is becoming a growing public health concern due to increasing disease and economic burdens. Epidemiological information about SLE, especially its incidence rate, is limited in developing countries. In the current study, we sought to investigate the incidence, prevalence, and economic burdens of SLE in urban China. We conducted a nationwide population-based cohort study using databases from Urban Employee Basic Medical Insurance and Urban Resident Basic Medical Insurance between 2013 and 2017, covering approximately 300 million residents in 23 provincial regions in China. Incidence rate and prevalence were standardized by age and gender to China's 2010 national census data. Additionally, we calculated the average annual costs and hospital visit rates. A total of 132,258 SLE patients were identified during the study period, with a mean age of 43.03 years (standard deviation: 15.29 years). Of these patients, 81.33% were women. In 2017, the standardized incidence rate of SLE in China was 14.09 (95% confidence interval (CI), 11.95-16.41) per 100,000 person-years, with a higher incidence in women than in men (26.41 vs. 5.92 per 100,000 person-years). Standardized prevalence in 2017 was 47.61 (41.77-53.83), 94.16 (80.67-108.69), and 17.86 (13.84-22.38) per 100,000 people in the overall, female, and male populations, respectively. The average annual rates of increase in prevalence were 21.50%, 19.72%, and 25.67% from 2013 to 2017 in the overall, female, and male populations, respectively. The age-specific incidence rates peaked at 30-49 years old in women and 40-59 years old in men. SLE incident and prevalent cases were most common in North-West China and less common in southern and eastern China. Distinct variations in incidence rates across different regions are also consistent with the varying levels of ultraviolet radiation exposure in China. Additionally, the average estimated annual per-capita cost was 1599.34 US dollars in SLE patients, with the highest costs observed in adolescent and young adult patients among different age groups. The SLE population in China is rapidly expanding, and younger at onset, especially in women, which has placed significant burdens on China's healthcare system.

This study aimed to evaluate the long-term survival, causes of death, and prognostic factors in Chinese patients with primary Sjögren syndrome (pSS).

Serologically active clinically quiescent (SACQ) is a state within systemic lupus erythematosus (SLE) characterized by elevated serologic markers without clinical activity. The heterogeneity in SACQ patients poses challenges in disease management. This multicenter prospective study aimed to identify distinct SACQ subgroups and assess their utility in predicting organ damage.

Abstract In biofluid, long RNAs are more informative than microRNAs in terms of gene number and variation type. Therefore, cell-free long RNAs have shown promising potential as biomarkers in liquid biopsy, while they are mostly fragmented. In order to investigate these fragmented cell-free RNAs (cfRNAs), we developed a cost-effective cfRNA sequencing method, DETECTOR-seq (depletion-assisted multiplexing cell-free total RNA sequencing). It utilized a set of customized guide RNAs to remove large amounts of unwanted RNAs (i.e., fragmented ribosomal and mitochondrial RNAs) in human plasma. Early barcoding was also incorporated to save cost and plasma volume. After demonstrating its superior performance to other methods, we used DETECTOR-seq to investigate cell-free transcriptomes in whole human plasma and extracellular vesicles (EVs) it contains. We first observed different type distributions: structured circular RNAs, tRNAs, Y RNAs, and virus RNAs were enriched in plasma, while mRNAs and srpRNAs were enriched in EVs. We also uncovered distinct functional pathways: RNA splicing-related ribonucleoproteins (RNPs) and antimicrobial humoral response genes were enriched in plasma, while transcriptional activity, cell migration, and antigen receptor-mediated immune signals were enriched in EVs. Subsequently, we compared the performances of these distinct cfRNAs in whole plasma versus EVs on classifying cancer patients. The accuracies were comparable when discriminating cancer patients from healthy donors (AUCs: 0.936 versus 0.953). Meanwhile, cancer types (i.e., colorectal versus lung cancer) were better classified with microbial cfRNAs in plasma than in EV (AUCs: 0.898 versus 0.772). Overall, by investigating total and EV cfRNAs in the pairwise plasma samples, our work provides practical guidance for the proper decision of EV purification when launching a cfRNA-based study. Furthermore, as a cost-effective method, DETECTOR-seq would facilitate transcriptome-wide studies in the fields of extracellular RNA biology and clinical liquid biopsy. Key Points DETECTOR-seq enables efficient and specific depletion of sequences derived from fragmented ribosomal and mitochondrial RNAs in plasma. Distinct cfRNA signatures in whole plasma versus EVs were revealed. Both Plasma and EV cfRNAs were capable of distinguishing cancer patients from normal individuals. Microbial RNAs in Plasma cfRNAs enabled better classification of cancer types than EV cfRNAs.

To investigate the impact of intraoperative hypothermia on postoperative outcome in neonatal patients undergoing non-cardiac surgery.

Patients with systemic lupus erythematosus (SLE) suffered from an increasing risk of cardiovascular diseases. In this multi-center prospective study, we aimed to determine the association between antiphospholipid antibodies (aPLs) and future atherosclerotic cardiovascular disease (ASCVD) in SLE. In total, 1573 SLE patients were recruited based on the Chinese SLE Treatment and Research group (CSTAR) registry. aPLs profile, including anticardiolipin antibodies (aCL) IgG/IgM, anti-β2 glycoprotein I antibodies (aβ2GPI) IgG/IgM, and lupus anticoagulant (LA), were measured in each center. Future ASCVD events were defined as new-onset myocardial infarction, stroke, artery revascularization, or cardiovascular death. Among the 1573 SLE patients, 525 (33.4%) had positive aPLs. LA had the highest prevalence (324 [20.6%]), followed by aCL IgG (249 [15.8%]), aβ2GPI IgG (199 [12.7%]). 116 (7.37%) patients developed ASCVD during the mean follow-up of 4.51 ± 2.32 years and 92 patients were aPLs positive. In univariate Cox regression analysis, both aPLs (HR = 7.81, 95% CI 5.00–12.24, p < 0.001) and traditional risk factors of cardiovascular disease were associated with future ASCVD events. In multiple Cox regression analysis, aCL IgG (HR = 1.95, 95% CI 1.25–3.00, p = 0.003), aCL IgM (HR = 1.83, 95% CI 1.03–3.20, p = 0.039), and LA (HR = 5.13, 95% CI 3.23–8.20, p < 0.001) positivity remained associated with ASCVD; traditional risk factors for ASCVD, including smoking, gender, age and hypertension, also play an independent role in SLE patients. More importantly, Aspirin can reduce ASCVD risk in SLE patients with positive aPLs (HR = 0.57 95% CI, 0.25–0.93, P = 0.026). SLE patients with positive aPLs, especially positive aCL IgG/IgM and LA, warrant more care and surveillance of future ASCVD events during follow-up. Aspirin may have a protective effect on future ASCVD.