FR
Frank Rudzicz
Author with expertise in Diagnosis and Treatment of Voice Disorders
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
11
(64% Open Access)
Cited by:
1,324
h-index:
41
/
i10-index:
109
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Linguistic Features Identify Alzheimer’s Disease in Narrative Speech

Kathleen Fraser et al.Nov 27, 2015
Background: Although memory impairment is the main symptom of Alzheimer’s disease (AD), language impairment can be an important marker. Relatively few studies of language in AD quantify the impairments in connected speech using computational techniques. Objective: We aim to demonstrate state-of-the-art accuracy in automatically identifying Alzheimer’s disease from short narrative samples elicited with a picture description task, and to uncover the salient linguistic factors with a statistical factor analysis. Methods: Data are derived from the DementiaBank corpus, from which 167 patients diagnosed with “possible” or “probable” AD provide 240 narrative samples, and 97 controls provide an additional 233. We compute a number of linguistic variables from the transcripts, and acoustic variables from the associated audio files, and use these variables to train a machine learning classifier to distinguish between participants with AD and healthy controls. To examine the degree of heterogeneity of linguistic impairments in AD, we follow an exploratory factor analysis on these measures of speech and language with an oblique promax rotation, and provide interpretation for the resulting factors. Results: We obtain state-of-the-art classification accuracies of over 81% in distinguishing individuals with AD from those without based on short samples of their language on a picture description task. Four clear factors emerge: semantic impairment, acoustic abnormality, syntactic impairment, and information impairment. Conclusion: Modern machine learning and linguistic analysis will be increasingly useful in assessment and clustering of suspected AD.
0
Citation588
0
Save
0

Artificial Intelligence and the Implementation Challenge

James Shaw et al.May 31, 2019
Applications of artificial intelligence (AI) in health care have garnered much attention in recent years, but the implementation issues posed by AI have not been substantially addressed.In this paper, we have focused on machine learning (ML) as a form of AI and have provided a framework for thinking about use cases of ML in health care. We have structured our discussion of challenges in the implementation of ML in comparison with other technologies using the framework of Nonadoption, Abandonment, and Challenges to the Scale-Up, Spread, and Sustainability of Health and Care Technologies (NASSS).After providing an overview of AI technology, we describe use cases of ML as falling into the categories of decision support and automation. We suggest these use cases apply to clinical, operational, and epidemiological tasks and that the primary function of ML in health care in the near term will be decision support. We then outline unique implementation issues posed by ML initiatives in the categories addressed by the NASSS framework, specifically including meaningful decision support, explainability, privacy, consent, algorithmic bias, security, scalability, the role of corporations, and the changing nature of health care work.Ultimately, we suggest that the future of ML in health care remains positive but uncertain, as support from patients, the public, and a wide range of health care stakeholders is necessary to enable its meaningful implementation.If the implementation science community is to facilitate the adoption of ML in ways that stand to generate widespread benefits, the issues raised in this paper will require substantial attention in the coming years.
1

DN3: An open-source Python library for large-scale raw neurophysiology data assimilation for more flexible and standardized deep learning

Demetres Kostas et al.Dec 17, 2020
Abstract We propose an open-source Python library, called DN3, designed to accelerate deep learning (DL) analysis with encephalographic data. This library focuses on making experimentation rapid and reproducible and facilitates the integration of both public and private datasets. Furthermore, DN3 is designed in the interest of validating DL processes that include, but are not limited to, classification and regression across many datasets to prove capacity for generalization. We explore the effectiveness of this library by presenting a general scheme for person disambiguation called T-Vectors inspired by speech recognition. These are single vectors created by typically short, though arbitrary in length, electro-encephalographic (EEG) data sequences that uniquely identify users relative to others. T-Vectors were trained by classifying nearly 1000 people using as little as 1 second-long sequences and generalize effectively to users never seen during training. Generalized performance is demonstrated on two commonly used and publicly accessible motor imagery task datasets, which are notorious for intra- and inter-subject signal variability. According to these datasets, subjects can be identified with accuracies as high as 97.7% by simply adopting the label of the nearest neighbouring T-Vectors, with no dependence on task performed and little dependence on recording session, even when sessions are separated by days. Visualization of the T-Vectors from both datasets show no conflation of subjects between datasets, and indicates a T-Vector manifold where subjects cluster well. We first conclude that this is a desirable paradigm shift in EEG-based biometrics and secondly that this manifold deserves further investigation. Our proposed library provides a variety of essential tools that facilitated the development of T-Vectors. The T-vectors codebase serves as a template for future projects using DN3, and we encourage leveraging our provided model for future work. Author summary We present a new Python library to train deep learning (DL) models with brain data. This library is tailored, but not limited, to developing neural networks for brain-computer-interfaces (BCI) applications. There is abundant interest in leveraging DL in the wider neuroscience community, but we have found current solutions limiting. Furthermore both BCI and DL benefit from benchmarking against multiple datasets and sharing parameters. Our library tries to be accessible to DL novices, yet not limiting to experts, while making experiment configurations more easily shareable and flexible for benchmarking. We demonstrated many of the features of our library by developing a deep neural network capable of disambiguating people from arbitrary lengths of electroencephalography data. We identify a variety of future avenues of study for these representations produced by our network, particularly in biometric applications and addressing the variation in BCI classifier performance. We share our model, library and its associated guides and documentation with the community at large.
0

Genetics Navigator: protocol for a mixed methods randomized controlled trial evaluating a digital platform to deliver genomic services in Canadian pediatric and adult populations

Guylaine D’Amours et al.Sep 1, 2024
Introduction Genetic testing is used across medical disciplines leading to unprecedented demand for genetic services. This has resulted in excessive waitlists and unsustainable pressure on the standard model of genetic healthcare. Alternative models are needed; e-health tools represent scalable and evidence-based solution. We aim to evaluate the effectiveness of the Genetics Navigator, an interactive patient-centred digital platform that supports the collection of medical and family history, provision of pregenetic and postgenetic counselling and return of genetic testing results across paediatric and adult settings. Methods and analysis We will evaluate the effectiveness of the Genetics Navigator combined with usual care by a genetics clinician (physician or counsellor) to usual care alone in a randomised controlled trial. One hundred and thirty participants (adults patients or parents of paediatric patients) eligible for genetic testing through standard of care will be recruited across Ontario genetics clinics. Participants randomised into the intervention arm will use the Genetics Navigator for pretest and post-test genetic counselling and results disclosure in conjunction with their clinician. Participants randomised into the control arm will receive usual care, that is, clinician-delivered pretest and post-test genetic counselling, and results disclosure. The primary outcome is participant distress 2 weeks after test results disclosure. Secondary outcomes include knowledge, decisional conflict, anxiety, empowerment, quality of life, satisfaction, acceptability, digital health literacy and health resource use. Quantitative data will be analysed using statistical hypothesis tests and regression models. A subset of participants will be interviewed to explore user experience; data will be analysed using interpretive description. A cost-effectiveness analysis will examine the incremental cost of the Navigator compared with usual care per unit reduction in distress or unit improvement in quality of life from public payer and societal perspectives. Ethics and dissemination This study was approved by Clinical Trials Ontario. Results will be shared through stakeholder workshops, national and international conferences and peer-reviewed journals. Trial registration number NCT06455384 .
Load More