Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
ND
Natasha DeLeón-Rodriguez
Author with expertise in Marine Microbial Diversity and Biogeography
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(50% Open Access)
Cited by:
410
h-index:
3
/
i10-index:
3
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Microbiome of the upper troposphere: Species composition and prevalence, effects of tropical storms, and atmospheric implications

Natasha DeLeón-Rodriguez et al.Jan 28, 2013
The composition and prevalence of microorganisms in the middle-to-upper troposphere (8–15 km altitude) and their role in aerosol-cloud-precipitation interactions represent important, unresolved questions for biological and atmospheric science. In particular, airborne microorganisms above the oceans remain essentially uncharacterized, as most work to date is restricted to samples taken near the Earth’s surface. Here we report on the microbiome of low- and high-altitude air masses sampled onboard the National Aeronautics and Space Administration DC-8 platform during the 2010 Genesis and Rapid Intensification Processes campaign in the Caribbean Sea. The samples were collected in cloudy and cloud-free air masses before, during, and after two major tropical hurricanes, Earl and Karl. Quantitative PCR and microscopy revealed that viable bacterial cells represented on average around 20% of the total particles in the 0.25- to 1-μm diameter range and were at least an order of magnitude more abundant than fungal cells, suggesting that bacteria represent an important and underestimated fraction of micrometer-sized atmospheric aerosols. The samples from the two hurricanes were characterized by significantly different bacterial communities, revealing that hurricanes aerosolize a large amount of new cells. Nonetheless, 17 bacterial taxa, including taxa that are known to use C1–C4 carbon compounds present in the atmosphere, were found in all samples, indicating that these organisms possess traits that allow survival in the troposphere. The findings presented here suggest that the microbiome is a dynamic and underappreciated aspect of the upper troposphere with potentially important impacts on the hydrological cycle, clouds, and climate.
0
Paper
Citation410
0
Save
0

Microbial Diversity in a Military Impacted Lagoon (Vieques, Puerto Rico) as Revealed by Metagenomics

Lizbeth Dávila-Santiago et al.Aug 10, 2018
The Anones Lagoon, located in the island municipality of Vieques, Puerto Rico (PR), received extensive bombing during military practices by the US Navy for decades. After military activities ceased in 2003, the bombing range was designated as part of a larger Superfund site by US EPA. Here, we employed shotgun metagenomic sequencing to investigate how microbial communities responded to pollution by heavy metals and explosives at this lagoon. Sediment samples (0-5 cm) from Anones were collected in 2005 and 2014 and compared to samples from two reference lagoons, i.e., Guaniquilla, Cabo Rojo (a natural reserve) and Condado, San Juan (PR's capital city). Consistent with selection under low anthropogenic impacts, Guaniquilla exhibited the highest degree of diversity with lower frequency of genes related to xenobiotics metabolism among the three lagoons. Notably, a clear shift was observed in Anones, with Euryarchaeota becoming enriched (9% of total) and a concomitant increase in community diversity, by about one order of magnitude, after almost 10 years without bombing activities. In contrast, genes associated with explosives biodegradation and heavy metal transformation significantly decreased in abundance in Anones 2014 (by 91.5%). Five unique population genomes were recovered from the Anones 2005 sample that encoded genetic determinants implicated in biodegradation of contaminants. Collectively, these results provided new insights into the natural attenuation of explosive contaminants by the benthic microbial communities of the Anones lagoon and could serve as reference points to enhance bioremediation actions at this site and for assessing other similarly impacted sites.