The hypothesis that the high mortality from coronary heart disease (CHD) in South Asians settled overseas compared with other populations is due to metabolic disturbances related to insulin resistance was tested in a population survey of 3193 men and 561 women aged 40-69 years in London, UK. The sample was assembled from industrial workforces and general practitioners' lists. In comparison with the European group, the South Asian group had a higher prevalence of diabetes (19% vs 4%), higher blood pressures, higher fasting and post-glucose serum insulin concentrations, higher plasma triglyceride, and lower HDL cholesterol concentrations. Mean waist-hip girth ratios and trunk skinfolds were higher in the South Asian than in the European group. Within each ethnic group waist-hip ratio was correlated with glucose intolerance, insulin, blood pressure, and triglyceride. These results confirm the existence of an insulin resistance syndrome, prevalent in South Asian populations and associated with a pronounced tendency to central obesity in this group. Control of obesity and greater physical activity offer the best chances for prevention of diabetes and CHD in South Asian people.

Lighter variations of pigmentation in humans are associated with diminished number, size, and density of melanosomes, the pigmented organelles of melanocytes. Here we show that zebrafish golden mutants share these melanosomal changes and that golden encodes a putative cation exchanger slc24a5 (nckx5) that localizes to an intracellular membrane, likely the melanosome or its precursor. The human ortholog is highly similar in sequence and functional in zebrafish. The evolutionarily conserved ancestral allele of a human coding polymorphism predominates in African and East Asian populations. In contrast, the variant allele is nearly fixed in European populations, is associated with a substantial reduction in regional heterozygosity, and correlates with lighter skin pigmentation in admixed populations, suggesting a key role for the SLC24A5 gene in human pigmentation.

Abstract

 Objective: To establish whether fetal growth rate (as distinct from size at birth) is associated with mortality from ischaemic heart disease. Design: Cohort study based on uniquely detailed obstetric records with 97% follow up over the entire life course and linkage to census data in adult life. Subjects: All 14 611 babies delivered at the Uppsala Academic Hospital, Sweden, during 1915-29 followed up to end of 1995. Main outcome measures: Mortality from ischaemic heart disease and other causes. Results: Cardiovascular disease showed an inverse association with birth weight for both men and women, although this was significant only for men. In men a 1000 g increase in birth weight was associated with a proportional reduction in the rate of ischaemic heart disease of 0.77 (95% confidence interval 0.67 to 0.90). Adjustment for socioeconomic circumstances at birth and in adult life led to slight attenuation of this effect. Relative to the lowest fourth of birth weight for gestational age, mortality from ischaemic heart disease in men in the second, third, and fourth fourths was 0.81 (0.66 to 0.98), 0.63 (0.50 to 0.78), and 0.67 (0.54 to 0.82), respectively. The inclusion of birth weight per se and birth weight for gestational age in the same model strengthened the association with birth weight for gestational age but removed the association with birth weight. Conclusions: This study provides by far the most persuasive evidence of a real association between size at birth and mortality from ischaemic heart disease in men, which cannot be explained by methodological artefact or socioeconomic confounding. It strongly suggests that it is variation in fetal growth rate rather than size at birth that is aetiologically important.

Abstract

 Metabolic disturbances associated with insulin resistance are present in most women with polycystic ovary syndrome. This has led to suggestions that women with polycystic ovary syndrome may be at increased risk of cardiovascular disease in later life. We undertook a long-term follow-up study to test whether cardiovascular mortality is increased in these women. A total of 786 women diagnosed with polycystic ovary syndrome in the United Kingdom between 1930 and 1979 were traced from hospital records and followed for an average of 30 years. Standardized mortality ratios (SMRs) were calculated to compare the death rates of these women with national rates. The SMR for all causes was 0.90 (95% CI, 0.69–1.17), based on 59 deaths. There were 15 deaths from circulatory disease, yielding an SMR of 0.83 (95% CI, 0.46–1.37). Of these 15 deaths, 13 were from ischemic heart disease (SMR 1.40; 95% CI, 0.75–2.40) and two were from other circulatory disease (SMR 0.23; 95% CI, 0.03–0.85). There were six deaths from diabetes mellitus as underlying or contributory cause, compared with 1.7 expected (odds ratio 3.6; 95% CI, 1.5–8.4). Breast cancer was the commonest cause of death (SMR 1.48 based on 13 deaths; 95% CI, 0.79–2.54). We conclude that women with polycystic ovary syndrome do not have markedly higher than average mortality from circulatory disease, even though the condition is strongly associated with diabetes, lipid abnormalities, and other cardiovascular risk factors. The characteristic endocrine profile of women with polycystic ovary syndrome may protect against circulatory disease in this condition.

To control for hidden population stratification in genetic-association studies, statistical methods that use marker genotype data to infer population structure have been proposed as a possible alternative to family-based designs. In principle, it is possible to infer population structure from associations between marker loci and from associations of markers with the trait, even when no information about the demographic background of the population is available. In a model in which the total population is formed by admixture between two or more subpopulations, confounding can be estimated and controlled. Current implementations of this approach have limitations, the most serious of which is that they do not allow for uncertainty in estimations of individual admixture proportions or for lack of identifiability of subpopulations in the model. We describe methods that overcome these limitations by a combination of Bayesian and classical approaches, and we demonstrate the methods by using data from three admixed populations—African American, African Caribbean, and Hispanic American—in which there is extreme confounding of trait-genotype associations because the trait under study (skin pigmentation) varies with admixture proportions. In these data sets, as many as one-third of marker loci show crude associations with the trait. Control for confounding by population stratification eliminates these associations, except at loci that are linked to candidate genes for the trait. With only 32 markers informative for ancestry, the efficiency of the analysis is ∼70%. These methods can deal with both confounding and selection bias in genetic-association studies, making family-based designs unnecessary. To control for hidden population stratification in genetic-association studies, statistical methods that use marker genotype data to infer population structure have been proposed as a possible alternative to family-based designs. In principle, it is possible to infer population structure from associations between marker loci and from associations of markers with the trait, even when no information about the demographic background of the population is available. In a model in which the total population is formed by admixture between two or more subpopulations, confounding can be estimated and controlled. Current implementations of this approach have limitations, the most serious of which is that they do not allow for uncertainty in estimations of individual admixture proportions or for lack of identifiability of subpopulations in the model. We describe methods that overcome these limitations by a combination of Bayesian and classical approaches, and we demonstrate the methods by using data from three admixed populations—African American, African Caribbean, and Hispanic American—in which there is extreme confounding of trait-genotype associations because the trait under study (skin pigmentation) varies with admixture proportions. In these data sets, as many as one-third of marker loci show crude associations with the trait. Control for confounding by population stratification eliminates these associations, except at loci that are linked to candidate genes for the trait. With only 32 markers informative for ancestry, the efficiency of the analysis is ∼70%. These methods can deal with both confounding and selection bias in genetic-association studies, making family-based designs unnecessary.

The human genome is characterised by many runs of homozygous genotypes, where identical haplotypes were inherited from each parent. The length of each run is determined partly by the number of generations since the common ancestor: offspring of cousin marriages have long runs of homozygosity (ROH), while the numerous shorter tracts relate to shared ancestry tens and hundreds of generations ago. Human populations have experienced a wide range of demographic histories and hold diverse cultural attitudes to consanguinity. In a global population dataset, genome-wide analysis of long and shorter ROH allows categorisation of the mainly indigenous populations sampled here into four major groups in which the majority of the population are inferred to have: (a) recent parental relatedness (south and west Asians); (b) shared parental ancestry arising hundreds to thousands of years ago through long term isolation and restricted effective population size (N(e)), but little recent inbreeding (Oceanians); (c) both ancient and recent parental relatedness (Native Americans); and (d) only the background level of shared ancestry relating to continental N(e) (predominantly urban Europeans and East Asians; lowest of all in sub-Saharan African agriculturalists), and the occasional cryptically inbred individual. Moreover, individuals can be positioned along axes representing this demographic historic space. Long runs of homozygosity are therefore a globally widespread and under-appreciated characteristic of our genomes, which record past consanguinity and population isolation and provide a distinctive record of the demographic history of an individual's ancestors. Individual ROH measures will also allow quantification of the disease risk arising from polygenic recessive effects.

To clarify the type of fetal growth impairment associated with increased blood pressure in adult life, and to establish whether this association is influenced by obesity and is mediated through impairment of insulin action.Cross sectional survey with retrospective ascertainment of size at birth from obstetric archives.1333 men resident in Uppsala, Sweden, who took part in a 1970 study of coronary risk factors at age 50 and for whom birth weight was traced.Systolic and diastolic blood pressure at age 50.In the full study population for a 1000g increase in birth weight there was a small change in systolic blood pressure of -2.2mmHg (95% confidence interval -4.2 to - 0.3mmHg) and in diastolic blood pressure of -1.0mmHg (-2.2 to 0.1mmHg). Much stronger effects were observed among men who were born at term and were in the top third of body mass index at age 50, for whom a 1000g increase in birth weight was associated with a change of -9.1mmHg (-16.4 to-1.9mmHg) systolic and -4.2mmHg (-8.3 to -0.1mmHg) diastolic blood pressure. Men who were light at birth (<3250g) but were above median adult height had particularly high blood pressure. Adjustment for insulin concentrations reduced the associations of birth weight with systolic and diastolic blood pressure.A failure to realise growth potential in utero (as indicated by being light at birth but tall as an adult) is associated with raised adult blood pressure. Impaired fetal growth may lead to substantial increases in adult blood pressure among only those who become obese. Metabolic disturbances, possibly related to insulin resistance, may provide a pathway through which fetal growth affects blood pressure.

To compare mortalities for selected groups of immigrants with the national average.Analysis of mortality for adults aged 20-69 in 1970-2 and 1989-92 using population data from 1971 and 1991 censuses. Mortality of Scottish and Irish immigrants aged 25-74 was also compared with mortality in Scotland and Ireland for 1991.England and Wales.Standardised mortality ratios for deaths from all causes, ischaemic heart disease, cerebrovascular disease, lung cancer, and breast cancer.In 1989-92 mortality from all causes was higher than the national average for Scottish immigrants, by 32% for men and 36% for women; for Irish immigrants it was higher by 39% for men and 20% for women; and for Caribbean born men it was lower by 23%. Ischaemic heart disease and lung cancer accounted for 30-40% of the excess mortality in Scottish and Irish immigrants. For south Asians, excess mortality from circulatory disease was balanced by lower mortality from cancer. Standardised mortality ratios for cerebrovascular disease in 1989-92 were highest for west African immigrants (271 for men and 181 for women).Widening differences in mortality ratios for migrants compared with the general population were not simply due to socioeconomic inequalities. The low mortality from all causes for Caribbean immigrants could largely be attributed to low mortality from ischaemic heart disease, which is unexplained. The excess mortality from cerebrovascular and hypertensive diseases in migrants from both west Africa and the Caribbean suggests that genetic factors underlie the susceptibility to hypertension in people of black African descent.