TC
Tiantian Chen
Author with expertise in Effects of Ketogenic Diet on Health
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(50% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
39
/
i10-index:
136
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

SCFAs-induced GLP-1 Secretion Links the Regulation of Gut Microbiome on Hepatic Lipogenesis in Chickens

Jianmei Zhang et al.Feb 14, 2019
Chickens represent a specific case in lipid metabolism that liver is the main site of lipid synthesis. As ovipara, their gut microbiota could be strongly influenced by environment and diets after hatching. The aim of this study is to elucidate the linkage of gut microbiota and fat synthesis in broilers. The broilers were subjected to dietary treatments of combined probiotics (Clostridium butyrate 4x108 cfu/kg, Bifidobacterium 2x108 cfu/kg, Lactobacillus plantarum 2x108 cfu/kg and Lactococcus faecalis 2x108 cfu/kg, PB) and guar gum (1 g/kg, GG). The result showed that dietary supplementation of PB and GG changed the cecal microbiota diversity, altered short chain fatty acids (SCFAs) contents, and suppressed lipogenesis in liver and abdominal fat tissues. In intestinal epithelial cells (IECs), acetate, propionate, and butyrate upregulated the expression of glucagon-like peptide-1 (GLP-1) via MAPK pathways, especially via the ERK and p38 MAPK pathways. GLP-1 suppressed lipid accumulation in primary hepatocytes with the involvement of AMPK/ACC signaling. In conclusion, the result suggests that SCFAs-induced GLP-1 secretion links the regulation of gut microbiome on hepatic lipogenesis in chickens.
4

Comparative genomic and crystal structure analyses identify a collagen glucosyltransferase from Acanthamoeba Polyphaga Mimivirus

Wenhui Wu et al.May 7, 2022
Abstract Humans and Acanthamoeba Polyphaga Mimivirus share numerous homologous genes, including collagens and collagen-modifying enzymes. To explore the homology, we performed a genome-wide comparison between human and mimivirus using DELTA-BLAST (Domain Enhanced Lookup Time Accelerated BLAST) and identified 52 new mimiviral proteins that are homologous with human proteins. To gain functional insights into mimiviral proteins, their human protein homologs were organized into Gene Ontology (GO) and REACTOME pathways to build a functional network. Collagen and collagen-modifying enzymes form the largest subnetwork with most nodes. Further analysis of this subnetwork identified a putative collagen glycosyltransferase R699. Protein expression test suggested that R699 is highly expressed in E coli , unlike the human collagen-modifying enzymes. Enzymatic activity assays showed that R699 catalyzes the conversion of unique galactosylhydroxylysine within the GXXXUG motif (U=galactosylhydroxylysine) to glucosylgalactosylhydroxylysine on collagen using uridine diphosphate glucose (UDP-Glc) as a sugar donor, suggesting R699 is a mimiviral collagen galactosylhydroxylysyl glucosyltransferase (GGT) with defined substrate specificity. Structural study of R699 produced the first crystal structure of a collagen GGT with a visible UDP-Glc. Sugar moiety of the UDP-Glc resides in a previously unrecognized pocket. Mn 2+ coordination and nucleoside-diphosphate binding site are conserved among GGT family members and critical for R699’s collagen GGT activity. To facilitate further analysis of human and mimiviral homologous proteins, we presented an interactive and searchable genome-wide comparison website for quickly browsing human and Acanthamoeba Polyphaga Mimivirus homologs, which is available at RRID Resource ID: SCR_022140 or https://guolab.shinyapps.io/app-mimivirus-publication/ .