FR
Frank Rooij
Author with expertise in Genomic Studies and Association Analyses
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
29
(72% Open Access)
Cited by:
4,994
h-index:
66
/
i10-index:
126
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Genome-wide association study identifies 74 loci associated with educational attainment

Aysu Okbay et al.May 10, 2016
A genome-wide association study in 293,723 individuals identifies 74 genetic variants associated with educational attainment, which, although only explaining a small proportion of the variation in educational attainment, highlights candidate genes and pathways for further study. The level of educational attainment as measured by years of schooling completed, while strongly influenced by social and environmental factors, has also been shown to have a smaller genetic contribution. Philipp Koellinger, Peter Visscher and colleagues from the Social Science Genetic Association Consortium (SSGAC) now report a genome-wide association study in 293,723 individuals identifying 74 genetic variants associated with level of educational attainment. Although the genetic associations explain only a small proportion of the variation in educational attainment, they highlight candidate genes and pathways for further study. Educational attainment is strongly influenced by social and other environmental factors, but genetic factors are estimated to account for at least 20% of the variation across individuals1. Here we report the results of a genome-wide association study (GWAS) for educational attainment that extends our earlier discovery sample1,2 of 101,069 individuals to 293,723 individuals, and a replication study in an independent sample of 111,349 individuals from the UK Biobank. We identify 74 genome-wide significant loci associated with the number of years of schooling completed. Single-nucleotide polymorphisms associated with educational attainment are disproportionately found in genomic regions regulating gene expression in the fetal brain. Candidate genes are preferentially expressed in neural tissue, especially during the prenatal period, and enriched for biological pathways involved in neural development. Our findings demonstrate that, even for a behavioural phenotype that is mostly environmentally determined, a well-powered GWAS identifies replicable associated genetic variants that suggest biologically relevant pathways. Because educational attainment is measured in large numbers of individuals, it will continue to be useful as a proxy phenotype in efforts to characterize the genetic influences of related phenotypes, including cognition and neuropsychiatric diseases.
0
Citation1,317
0
Save
0

Coronary Calcification Improves Cardiovascular Risk Prediction in the Elderly

Rozemarijn Vliegenthart et al.Jul 12, 2005
Background— Coronary calcification detected by electron beam tomography may improve cardiovascular risk prediction. The technique is particularly promising in the elderly because the predictive power of cardiovascular risk factors weakens with age. We investigated the prognostic value of coronary calcification for cardiovascular events and mortality in a general, asymptomatic population of elderly subjects. Methods and Results— From 1997 to 2000, electron beam tomography scanning to assess coronary calcification was performed in subjects of the population-based Rotterdam Study. Risk factors were measured by standardized procedures. Coronary calcium scores were available for 1795 asymptomatic participants (mean age, 71 years; range, 62 to 85 years). During a mean follow-up of 3.3 years, 88 cardiovascular events, including 50 coronary events, occurred. The risk of coronary heart disease increased with increasing calcium score. The multivariate-adjusted relative risk of coronary events was 3.1 (95% CI, 1.2 to 7.9) for calcium scores of 101 to 400, 4.6 (95% CI, 1.8 to 11.8) for calcium scores of 401 to 1000, and 8.3 (95% CI, 3.3 to 21.1) for calcium scores >1000 compared with calcium scores of 0 to 100. The predictive value in subjects >70 years of age was similar. Risk prediction based on the cardiovascular risk factors improved when coronary calcification was added. Conclusions— Coronary calcification is a strong and independent predictor of coronary heart disease, also in the elderly. Coronary calcification improves prediction of coronary events based on cardiovascular risk factors. Risk stratification by assessment of coronary calcification may have an important role in the primary prevention of coronary heart disease events in the elderly.
0

Disagreement between subjective and actigraphic measures of sleep duration in a population‐based study of elderly persons*

Julia Berg et al.Feb 28, 2008
Summary Sleep duration is an important concept in epidemiological studies. It characterizes a night’s sleep or a person’s sleep pattern, and is associated with numerous health outcomes. In most large studies, sleep duration is assessed with questionnaires or sleep diaries. As an alternative, actigraphy may be used, as it objectively measures sleep parameters and is feasible in large studies. However, actigraphy and sleep diaries may not measure exactly the same phenomenon. Our study aims to determine disagreement between actigraphic and diary estimates of sleep duration, and to investigate possible determinants of this disagreement. This investigation was embedded in the population‐based Rotterdam Study. The study population consisted of 969 community‐dwelling participants aged 57–97 years. Participants wore an actigraph and kept a sleep diary for, on average, six consecutive nights. Both measures were used to determine total sleep time (TST). In 34% of the participants, the estimated TST in the sleep diaries deviated more than 1 h from actigraphically measured TST. The level of disagreement between diary and actigraphic measures decreased with subjective and actigraphic measures of sleep quality, and increased with male gender, poor cognitive function and functional disability. Actigraphically measured poor sleep was often accompanied by longer subjective estimates of TST, whereas subjectively poor sleepers tended to report shorter TST in their diaries than was measured with actigraphy. We recommend, whenever possible, to use multiple measures of sleep duration, to perform analyses with both, and to examine the consistency of the results over assessment methods.
0

Coronary Calcium Score Improves Classification of Coronary Heart Disease Risk in the Elderly

Suzette Elias-Smale et al.Oct 1, 2010
The purpose of this study was to examine the effect of coronary artery calcium (CAC) on the classification of 10-year hard coronary heart disease (CHD) risk and to empirically derive cut-off values of the calcium score for a general population of elderly patients. Although CAC scoring has been found to improve CHD risk prediction, there are limited data on its impact in clinical practice. The study comprised 2,028 asymptomatic participants (age 69.6 ± 6.2 years) from the Rotterdam Study. During a median follow-up of 9.2 years, 135 hard coronary events occurred. Persons were classified into low (<10%), intermediate (10% to 20%), and high (>20%) 10-year coronary risk categories based on a Framingham refitted risk model. In a second step, the model was extended by CAC, and reclassification percentages were calculated. Cutoff values of CAC for persons in the intermediate-risk category were empirically derived based on 10-year hard CHD risk. Reclassification by means of CAC scoring was most substantial in persons initially classified as intermediate risk. In this group, 52% of men and women were reclassified, all into more accurate risk categories. CAC values above 615 or below 50 Agatston units were found appropriate to reclassify persons into high or low risk, respectively. In a general population of elderly patients at intermediate CHD risk, CAC scoring is a powerful method to reclassify persons into more appropriate risk categories. Empirically derived CAC cutoff values at which persons at intermediate risk reclassified to either high or low risk were 615 and 50 Agatston units, respectively.
0

Dietary Antioxidants and Long-term Risk of Dementia

Elizabeth Devore et al.Jul 1, 2010

Background

 The Rotterdam Study previously found that higher dietary intakes of vitamins E and C related to lower risk of dementia and Alzheimer disease (AD) over 6 years of follow-up. 

Objective

 To study consumption of major dietary antioxidants relative to long-term risk of dementia. 

Design

 Population-based prospective cohort study. 

Setting

 The Rotterdam Study in the Netherlands. 

Participants

 A total of 5395 participants, 55 years and older, who were free of dementia and provided dietary information at study baseline. 

Main Outcome Measures

 Incidence of dementia and AD, based on internationally accepted criteria, relative to dietary intake of vitamin E, vitamin C, beta carotene, and flavonoids. 

Results

 During a mean follow-up period of 9.6 years, dementia developed in 465 participants, of whom 365 were diagnosed as having AD. In multivariate models adjusted for age, education, apolipoprotein E ε4 genotype, total energy intake, alcohol intake, smoking habits, body mass index, and supplement use, higher intake of vitamin E at study baseline was associated with lower long-term risk of dementia (P = .02 for trend). Compared with participants in the lowest tertile of vitamin E intake, those in the highest tertile were 25% less likely to develop dementia (hazard ratio, 0.75; 95% confidence interval, 0.59-0.95 with adjustment for potential confounders). Dietary intake levels of vitamin C, beta carotene, and flavonoids were not associated with dementia risk after multivariate adjustment (P > .99 for trend for vitamin C and beta carotene andP = .60 for trend for flavonoids). Results were similar when risk for AD was specifically assessed. 

Conclusion

 Higher intake of foods rich in vitamin E may modestly reduce long-term risk of dementia and AD.
0

Methods of data collection and definitions of cardiac outcomes in the Rotterdam Study

Maarten Leening et al.Mar 1, 2012
The prevalence of cardiovascular diseases is rising. Therefore, adequate risk prediction and identification of its determinants is increasingly important. The Rotterdam Study is a prospective population-based cohort study ongoing since 1990 in the city of Rotterdam, The Netherlands. One of the main targets of the Rotterdam Study is to identify the determinants and prognosis of cardiovascular diseases. Case finding in epidemiological studies is strongly depending on various sources of follow-up and clear outcome definitions. The sources used for collection of data in the Rotterdam Study are diverse and the definitions of outcomes in the Rotterdam Study have changed due to the introduction of novel diagnostics and therapeutic interventions. This article gives the methods for data collection and the up-to-date definitions of the cardiac outcomes based on international guidelines, including the recently adopted cardiovascular disease mortality definitions. In all, detailed description of cardiac outcome definitions enhances the possibility to make comparisons with other studies in the field of cardiovascular research and may increase the strength of collaborations.
Load More