Promising new drugs are being evaluated for treatment of multiple myeloma (MM), but their impact should be measured against the expected outcome in patients failing current therapies. However, the natural history of relapsed disease in the current era remains unclear. We studied 286 patients with relapsed MM, who were refractory to bortezomib and were relapsed following, refractory to or ineligible to receive, an IMiD (immunomodulatory drug), had measurable disease, and ECOG PS of 0, 1 or 2. The date patients satisfied the entry criteria was defined as time zero (T(0)). The median age at diagnosis was 58 years, and time from diagnosis to T(0) was 3.3 years. Following T(0), 213 (74%) patients had a treatment recorded with one or more regimens (median=1; range 0-8). The first regimen contained bortezomib in 55 (26%) patients and an IMiD in 70 (33%). A minor response or better was seen to at least one therapy after T(0) in 94 patients (44%) including ≥ partial response in 69 (32%). The median overall survival and event-free survival from T(0) were 9 and 5 months, respectively. This study confirms the poor outcome, once patients become refractory to current treatments. The results provide context for interpreting ongoing trials of new drugs.

Abstract F18-fluorodeoxyglucose positron emission tomography (FDG-PET) is a powerful tool to investigate the role of tumor metabolic activity and its suppression by therapy for cancer survival. As part of Total Therapy 3 for newly diagnosed multiple myeloma, metastatic bone survey, magnetic resonance imaging, and FDG-PET scanning were evaluated in 239 untreated patients. All 3 imaging techniques showed correlations with prognostically relevant baseline parameters: the number of focal lesions (FLs), especially when FDG-avid by PET-computed tomography, was positively linked to high levels of β-2-microglobulin, C-reactive protein, and lactate dehydrogenase; among gene expression profiling parameters, high-risk and proliferation-related parameters were positively and low-bone-disease molecular subtype inversely correlated with FL. The presence of more than 3 FDG-avid FLs, related to fundamental features of myeloma biology and genomics, was the leading independent parameter associated with inferior overall and event-free survival. Complete FDG suppression in FL before first transplantation conferred significantly better outcomes and was only opposed by gene expression profiling-defined high-risk status, which together accounted for approximately 50% of survival variability (R2 test). Our results provide a rationale for testing the hypothesis that myeloma survival can be improved by altering treatment in patients in whom FDG suppression cannot be achieved after induction therapy.

Most loci identified by GWAS have been found in populations of European ancestry (EA). In trans-ethnic meta-analyses for 15 hematological traits in 746,667 participants, including 184,535 non-EA individuals, we identified 5,552 trait-variant associations at P<5x10-9, including 71 novel loci not found in EA populations. We also identified novel ancestry-specific variants not found in EA, including an IL7 missense variant in South Asians associated with lymphocyte count in vivo and IL7 secretion levels in vitro. Fine-mapping prioritized variants annotated as functional, and generated 95% credible sets that were 30% smaller when using the trans-ethnic as opposed to the EA-only results. We explored the clinical significance and predictive value of trans-ethnic variants in multiple populations, and compared genetic architecture and the impact of natural selection on these blood phenotypes between populations. Altogether, our results for hematological traits highlight the value of a more global representation of populations in genetic studies.

Background: Smoking and alcohol use behaviors in humans have been associated with common genetic variants within multiple genomic loci. Investigation of rare variation within these loci holds promise for identifying causal variants impacting biological mechanisms in the etiology of disordered behavior. Microarrays have been designed to genotype rare nonsynonymous and putative loss of function variants. Such variants are expected to have greater deleterious consequences on gene function than other variants, and significantly contribute to disease risk. Methods: In the present study, we analyzed ~250,000 rare variants from 17 independent studies. Each variant was tested for association with five addiction-related phenotypes: cigarettes per day, pack years, smoking initiation, age of smoking initiation, and alcoholic drinks per week. We conducted single variant tests of all variants, and gene-based burden tests of nonsynonymous or putative loss of function variants with minor allele frequency less than 1%. Results: Meta-analytic sample sizes ranged from 70,847 to 164,142 individuals, depending on the phenotype. Known loci tagged by common variants replicated, but there was no robust evidence for individually associated rare variants, either in gene based or single variant tests. Using a modified method-of-moment approach, we found that all low frequency coding variants, in aggregate, contributed 1.7% to 3.6% of the phenotypic variation for the five traits (p<.05). Conclusions: The findings indicate that rare coding variants contribute to phenotypic variation, but that much larger samples and/or denser genotyping of rare variants will be required to successfully identify associations with these phenotypes, whether individual variants or gene- based associations.

Body fat distribution is a heritable risk factor for a range of adverse health consequences, including hyperlipidemia and type 2 diabetes. To identify protein-coding variants associated with body fat distribution, assessed by waist-to-hip ratio adjusted for body mass index, we analyzed 228,985 predicted coding and splice site variants available on exome arrays in up to 344,369 individuals from five major ancestries for discovery and 132,177 independent European-ancestry individuals for validation. We identified 15 common (minor allele frequency, MAF ≥ 5%) and 9 low frequency or rare (MAF < 5%) coding variants that have not been reported previously. Pathway/gene set enrichment analyses of all associated variants highlight lipid particle, adiponectin level, abnormal white adipose tissue physiology, and bone development and morphology as processes affecting fat distribution and body shape. Furthermore, the cross-trait associations and the analyses of variant and gene function highlight a strong connection to lipids, cardiovascular traits, and type 2 diabetes. In functional follow-up analyses, specifically in Drosophila RNAi-knockdown crosses, we observed a significant increase in the total body triglyceride levels for two genes (DNAH10 and PLXND1). By examining variants often poorly tagged or entirely missed by genome-wide association studies, we implicate novel genes in fat distribution, stressing the importance of interrogating low-frequency and protein-coding variants.