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Briana Nixon
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Cytotoxic granzyme C–expressing ILC1s contribute to antitumor immunity and neonatal autoimmunity

Briana Nixon et al.Apr 15, 2022
Innate lymphocytes are integral components of the cellular immune system that can coordinate host defense against a multitude of challenges and trigger immunopathology when dysregulated. Natural killer (NK) cells and innate lymphoid cells (ILCs) are innate immune effectors postulated to functionally mirror conventional cytotoxic T lymphocytes and helper T cells, respectively. Here, we showed that the cytolytic molecule granzyme C was expressed in cells with the phenotype of type 1 ILCs (ILC1s) in mouse liver and salivary gland. Cell fate-mapping and transfer studies revealed that granzyme C-expressing innate lymphocytes could be derived from ILC progenitors and did not interconvert with NK cells, ILC2s, or ILC3s. Granzyme C defined a maturation state of ILC1s. These granzyme C-expressing ILC1s required the transcription factors T-bet and, to a lesser extent, Eomes and support from transforming growth factor-β (TGF-β) signaling for their maintenance in the salivary gland. In a transgenic mouse breast cancer model, depleting ILC1s caused accelerated tumor growth. ILC1s gained granzyme C expression following interleukin-15 (IL-15) stimulation, which enabled perforin-mediated cytotoxicity. Constitutive activation of STAT5, a transcription factor regulated by IL-15, in granzyme C-expressing ILC1s triggered lethal perforin-dependent autoimmunity in neonatal mice. Thus, granzyme C marks a cytotoxic effector state of ILC1s, broadening their function beyond "helper-like" lymphocytes.
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Tumor-intrinsic PRC2 inactivation drives a context-dependent immune-desert tumor microenvironment and confers resistance to immunotherapy

Juan Yan et al.May 27, 2022
Abstract Immune checkpoint blockade (ICB) has demonstrated clinical success in “inflamed” tumors with significant T-cell infiltrates, but tumors with an immune-desert tumor microenvironment (TME) fail to benefit. The tumor cell-intrinsic molecular mechanisms of the immune-desert phenotype remain poorly understood. Here, we demonstrate that inactivation of the Polycomb-repressive complex 2 (PRC2) core components, EED or SUZ12, a prevalent genetic event in malignant peripheral nerve sheath tumor (MPNST) and sporadically in other cancer types, drives a context-dependent immune-desert TME. PRC2 inactivation reprograms the chromatin landscape that leads to a cell-autonomous shift from primed baseline signaling-dependent cellular responses (e.g., interferon γ) to PRC2-regulated development and cellular differentiation transcriptional programs. Further, PRC2 inactivation reprograms the TME, leads to diminished tumor immune infiltrates and immune evasion through reduced chemokine production and impaired antigen presentation and T-cell priming, and confers ICB primary resistance through blunted T-cell recruitment in vivo . We demonstrate that strategies that enhancing innate immunity via intratumoral delivery of inactivated modified vaccinia virus Ankara (MVA) leads to increased tumor immune infiltrates and sensitizes PRC2-loss tumors to ICB. Our results provide novel molecular mechanisms of context-dependent dysfunctional epigenetic reprogramming that underline the immune-desert phenotype in MPNST and other cancers with PRC2 inactivation. Importantly, our findings highlight genetic-inactivation of PRC2 as a novel context-dependent ICB therapeutic resistance biomarker in cancer, and caution that therapeutic strategies that non-selectively target PRC2 in the host may lead to undesirable context-dependent immune evasion and ICB resistance in tumors. Our studies also point to intratumoral delivery of immunogenic therapeutic viruses as an initial strategy to modulate the immune-desert TME and capitalize on the clinical benefit of ICB.