ABSTRACT The highly embryogenic and transformable maize inbred line A188 is an attractive model for analyzing maize gene function. Here we constructed a chromosome-level genome assembly of A188 using long reads and optical maps. Genome comparison of A188 with the reference line B73 identified pervasive structural variation, including a 1.8 Mb duplication on the Gametophyte factor1 locus for unilateral cross-incompatibility and six inversions of 0.7 Mb or greater. Increased copy number of the gene, carotenoid cleavage dioxygenase 1 ( ccd1 ) in A188 is associated with elevated expression during seed development. High ccd1 expression together with low expression of yellow endosperm 1 ( y1 ) condition reduced carotenoid accumulation, which accounts for the white seed phenotype of A188 that contrasts with the yellow seed of B73 that has high expression of y1 and low expression of the single-copy ccd1 . Further, transcriptome and epigenome analyses with the A188 reference genome revealed enhanced expression of defense pathways and altered DNA methylation patterns of embryonic callus.

Anticancer activity has been extensively studies. In this article, three ligands 2-(6-bromobenzo[d][1,3]dioxol-5-yl)-1H-imidazo[4,5-f][1,10]phenanthroline (BDIP), 2-(7-methoxybenzo[d][1,3]dioxol-5-yl)-1H-imidazo[4,5-f][1,10]phenanthroline (MDIP), 2-(6-nitrobenzo[d][1,3]dioxol-5-yl)-1H-imidazo[4,5-f][1,10]phenanthroline (NDIP) and their iridium(III) complexes: [Ir(ppy)2(BDIP)](PF6) (ppy = deprotonated 2-phenylpyridine, 3a), [Ir(ppy)2(MDIP)](PF6) (3b) and [Ir(ppy)2(NDIP)](PF6) (3c) were synthesized. The cytotoxicity of 3a, 3b, 3c against Huh7, A549, BEL-7402, HepG2, HeLa, and non-cancer NIH3T3 was tested using 3-(4,5-dimethylthiazole-2-yl)-2,5-diphenyl tetrazolium bromide (MTT) method. The results obtained from the MTT test stated clearly that these complexes demonstrated moderate or non-cytotoxicity toward Huh7, BEL-7402, HepG2 and HeLa except A549 cells. To improve the anticancer efficacy, we used white light to irradiate the mixture of cells and complexes for 30 min, the anticancer activity of the complexes was greatly enhanced. Particularly, 3a and 3b exhibited heightened capability to inhibit A549 cells proliferation with IC50 (half maximal inhibitory concentration) values of 0.7 ± 0.3 μM and 1.8 ± 0.1 μM, respectively. Cellular uptake has shown that 3a and 3b can be accumulated in the cytoplasm. Wound healing and colony forming showed that 3a and 3b significantly hinder the cell migration and growth in the S phase. The complexes open mitochondrial permeability transition pore (MPTP) channel and cause the decrease of membrane potential, release of cytochrome C, activation of caspase 3, and finally lead to apoptosis. In addition, 3a and 3b cause autophagy, increase the lipid peroxidation and lead to ferroptosis. Also, 3a and 3b increase the expression of calreticulin (CRT), high mobility group box 1 (HMGB1), heat shock protein 70 (HSP70), thereby inducing immunogenic cell death.