AJ
Animesh Jain
Author with expertise in Pancreatic Cancer Research and Treatment
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(80% Open Access)
Cited by:
6
h-index:
19
/
i10-index:
34
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
7

Increased Colonic Expression of ACE2 Associates with Poor Prognosis in Crohn’s disease

Takahiko Toyonaga et al.Nov 24, 2020
The host receptor for SARS-CoV-2, angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2), is highly expressed in small intestine. Our aim was to study colonic ACE2 expression in Crohn's disease (CD) and non-inflammatory bowel disease (non-IBD) controls. We hypothesized that the colonic expression levels of ACE2 impacts CD course.We examined the expression of colon ACE2 using RNA-seq and quantitative (q) RT-PCR from 69 adult CD and 14 NIBD control patients. In a subset of this cohort we validated ACE2 protein expression and localization in formalin-fixed, paraffin-embedded matched colon and ileal tissues using immunohistochemistry. The impact of increased ACE2 expression in CD for the risk of surgery was evaluated by a multivariate regression analysis and a Kaplan-Meier estimator. To provide critical support for the generality of our findings, we analyzed previously published RNA-seq data from two large independent cohorts of CD patients.Colonic ACE2 expression was significantly higher in a subset of adult CD patients (ACE2-high CD). IHC in a sampling of ACE2-high CD patients confirmed high ACE2 protein expression in the colon and ileum compared to ACE2-low CD and NIBD patients. Notably, we found that ACE2-high CD patients are significantly more likely to undergo surgery within 5 years of diagnosis, with a Cox regression analysis finding that high ACE2 levels is an independent risk factor (OR 2.18; 95%CI, 1.05-4.55; p=0.037).Increased intestinal expression of ACE2 is associated with deteriorated clinical outcomes in CD patients. These data point to the need for molecular stratification that may impact CD disease-related outcomes.
7
Citation3
0
Save
22

Single-cell analysis of colonic epithelium reveals unexpected shifts in cellular composition and molecular phenotype in treatment-naïve adult Crohn’s disease

Matt Kanke et al.Jan 15, 2021
Abstract The intestinal epithelial barrier is comprised of a monolayer of specialized intestinal epithelial cells (IECs) that are critical in maintaining gut mucosal homeostasis. Dysfunction within various IEC fractions can increase intestinal permeability, resulting in a chronic and debilitating condition known as Crohn’s disease (CD). Defining the molecular changes in each IEC type in CD will contribute to an improved understanding of the pathogenic processes and the identification of potential therapeutic targets. Here we performed, for the first time at single-cell resolution, a direct comparison of the colonic epithelial cellular and molecular landscape between treatment-naïve adult CD and non-IBD control patients. Our analysis revealed that in CD patients there is a significant skew in the colonic epithelial cellular distribution away from canonical LGR5 + stem cells, located at the crypt-bottom, and toward one specific subtype of mature colonocytes, located at the crypt-top. Further analysis revealed unique changes to gene expression programs in every major cell type, including a previously undescribed suppression in CD of most enteroendocrine driver genes as well as L-cell markers including GCG . We also dissect a previously poorly understood SPIB + cell cluster, revealing at least four sub-clusters that exhibit unique features. One of these SPIB + sub-clusters expresses crypt-top colonocyte markers and is significantly up-regulated in CD, whereas another sub-cluster strongly expresses and stains positive for lysozyme (albeit no other canonical Paneth cell marker), which surprisingly is greatly reduced in expression in CD. Finally, through integration with data from genome-wide association studies, we show that genes implicated in CD risk exhibit heretofore unknown cell-type specific patterns of aberrant expression in CD, providing unprecedented insight into the potential biological functions of these genes.
22
Citation3
0
Save
0

Morbidity Pattern and Usage of Swimming Gear among Swimmers in South India

Nitin Joseph et al.Jun 1, 2024
Swimming is recommended for its several health benefits.However, swimmers are at risk of acquiring several diseases.This could be both due to constant exposure to water and non-usage of swimming gear.This study was hence done to study the morbidities, the usage patterns of swimming gear and its determinant among swimming pool users.This cross-sectional study was conducted among 162 swimmers visiting eight public swimming pools in Mangalore.The minimum sample size of 122 was calculated using the formula Z α 2 pq/d 2 , at 95% CI and 15% relative precisions.Data were collected using a semi-structured interview schedule.Chi-square test and Fisher's Exact test were used to test association.A p value less than 0.05 was considered a statistically significant association.Swimming caps, goggles, ear plugs, and nose clips were always worn by 121(74.7%),104(64.2%),19(11.7%),and 2(1.2%) participants respectively over the past year.The most common self-reported morbidities related to swimming reported in nearly half of the participants were redness and burning sensation in the eyes over the past year.These were significantly more among swimmers who did not always wear goggles, and among occasional swimmers.Burning sensation in the eyes was seen more among those who started swimming ≤1 year ago while redness of the eyes was seen more among those who were swimming for more than 5 years.There was a statistically significant association between not always wearing swimming cap and males, not always wearing goggles, swimming for more than 5 years, occasional swimmers, and swimming for half an hour or less on each occasion in a day over the past year.There was a statistically significant association between not always wearing goggles and occasional swimmers and swimming for half an hour or less on each occasion in a day over the past year.Several participants in this study did not always wear the personal protective swimming gear.This was associated with certain common morbidities and various swimming-related characteristics among the swimmers.Hence there is a need to periodically screen swimmers for various morbidities and to educate them and encourage them to wear swimming gear on every occasion.