EB
Edward Barnes
Author with expertise in Genetics and Treatment of Inflammatory Bowel Disease
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(86% Open Access)
Cited by:
413
h-index:
33
/
i10-index:
79
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Burden and Cost of Gastrointestinal, Liver, and Pancreatic Diseases in the United States: Update 2021

Anne Peery et al.Oct 21, 2021
Gastrointestinal diseases account for considerable health care use and expenditures. We estimated the annual burden, costs, and research funding associated with gastrointestinal, liver, and pancreatic diseases in the United States.We generated estimates using data from the National Ambulatory Medical Care Survey; National Hospital Ambulatory Medical Care Survey; Nationwide Emergency Department Sample; National Inpatient Sample; Kids' Inpatient Database; Nationwide Readmissions Database; Surveillance, Epidemiology, and End Results program; National Vital Statistics System; Centers for Disease Control and Prevention Wide-Ranging Online Data for Epidemiologic Research; MarketScan Commercial Claims and Encounters data; MarketScan Medicare Supplemental data; United Network for Organ Sharing registry; Medical Expenditure Panel Survey; and National Institutes of Health (NIH).Gastrointestinal health care expenditures totaled $119.6 billion in 2018. Annually, there were more than 36.8 million ambulatory visits for gastrointestinal symptoms and 43.4 million ambulatory visits with a primary gastrointestinal diagnosis. Hospitalizations for a principal gastrointestinal diagnosis accounted for more than 3.8 million admissions, with 403,699 readmissions. A total of 22.2 million gastrointestinal endoscopies were performed, and 284,844 new gastrointestinal cancers were diagnosed. Gastrointestinal diseases and cancers caused 255,407 deaths. The NIH supported $3.1 billion (7.5% of the NIH budget) for gastrointestinal research in 2020.Gastrointestinal diseases are responsible for millions of health care encounters and hundreds of thousands of deaths that annually costs billions of dollars in the United States. To reduce the high burden of gastrointestinal diseases, focused clinical and public health efforts, supported by additional research funding, are warranted.
22

Single-cell analysis of colonic epithelium reveals unexpected shifts in cellular composition and molecular phenotype in treatment-naïve adult Crohn’s disease

Matt Kanke et al.Jan 15, 2021
Abstract The intestinal epithelial barrier is comprised of a monolayer of specialized intestinal epithelial cells (IECs) that are critical in maintaining gut mucosal homeostasis. Dysfunction within various IEC fractions can increase intestinal permeability, resulting in a chronic and debilitating condition known as Crohn’s disease (CD). Defining the molecular changes in each IEC type in CD will contribute to an improved understanding of the pathogenic processes and the identification of potential therapeutic targets. Here we performed, for the first time at single-cell resolution, a direct comparison of the colonic epithelial cellular and molecular landscape between treatment-naïve adult CD and non-IBD control patients. Our analysis revealed that in CD patients there is a significant skew in the colonic epithelial cellular distribution away from canonical LGR5 + stem cells, located at the crypt-bottom, and toward one specific subtype of mature colonocytes, located at the crypt-top. Further analysis revealed unique changes to gene expression programs in every major cell type, including a previously undescribed suppression in CD of most enteroendocrine driver genes as well as L-cell markers including GCG . We also dissect a previously poorly understood SPIB + cell cluster, revealing at least four sub-clusters that exhibit unique features. One of these SPIB + sub-clusters expresses crypt-top colonocyte markers and is significantly up-regulated in CD, whereas another sub-cluster strongly expresses and stains positive for lysozyme (albeit no other canonical Paneth cell marker), which surprisingly is greatly reduced in expression in CD. Finally, through integration with data from genome-wide association studies, we show that genes implicated in CD risk exhibit heretofore unknown cell-type specific patterns of aberrant expression in CD, providing unprecedented insight into the potential biological functions of these genes.
22
Citation3
0
Save
7

Increased Colonic Expression of ACE2 Associates with Poor Prognosis in Crohn’s disease

Takahiko Toyonaga et al.Nov 24, 2020
The host receptor for SARS-CoV-2, angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2), is highly expressed in small intestine. Our aim was to study colonic ACE2 expression in Crohn's disease (CD) and non-inflammatory bowel disease (non-IBD) controls. We hypothesized that the colonic expression levels of ACE2 impacts CD course.We examined the expression of colon ACE2 using RNA-seq and quantitative (q) RT-PCR from 69 adult CD and 14 NIBD control patients. In a subset of this cohort we validated ACE2 protein expression and localization in formalin-fixed, paraffin-embedded matched colon and ileal tissues using immunohistochemistry. The impact of increased ACE2 expression in CD for the risk of surgery was evaluated by a multivariate regression analysis and a Kaplan-Meier estimator. To provide critical support for the generality of our findings, we analyzed previously published RNA-seq data from two large independent cohorts of CD patients.Colonic ACE2 expression was significantly higher in a subset of adult CD patients (ACE2-high CD). IHC in a sampling of ACE2-high CD patients confirmed high ACE2 protein expression in the colon and ileum compared to ACE2-low CD and NIBD patients. Notably, we found that ACE2-high CD patients are significantly more likely to undergo surgery within 5 years of diagnosis, with a Cox regression analysis finding that high ACE2 levels is an independent risk factor (OR 2.18; 95%CI, 1.05-4.55; p=0.037).Increased intestinal expression of ACE2 is associated with deteriorated clinical outcomes in CD patients. These data point to the need for molecular stratification that may impact CD disease-related outcomes.
7
Citation3
0
Save
0

Efficacy and Safety of Mirikizumab in the Treatment of Moderately to Severely Active Ulcerative Colitis Regardless of Baseline Modified Mayo Score: Results From the Phase 3 LUCENT Trials

Bincy Abraham et al.Jan 8, 2025
Abstract Background The modified Mayo score (mMS) is a measure for ulcerative colitis (UC) disease activity. Recent US Food and Drug Administration guidance for moderately to severely active UC trials suggests that patients should have baseline mMS of 5–9 including an endoscopy score of at least 2, opposed to the previous range of 4–9. This disclosure reports results from patients with UC with baseline mMS of 5–9 who received mirikizumab, a monoclonal antibody directed against the interleukin-23 p19 subunit, or placebo in the phase 3 LUCENT trials. Methods Mirikizumab was evaluated in the randomized, double-blind, placebo-controlled LUCENT-1 (NCT03518086) and LUCENT-2 (NCT03524092) trials, and the ongoing long-term LUCENT-3 (NCT03519945) trial, which use mMS 4-9. Analyses for patients with baseline mMS of 5-9 (excluding patients with mMS of 4) were conducted according to LUCENT trial statistical analysis plans. Categorical efficacy endpoints were summarized using proportions and confidence intervals. Continuous efficacy endpoints are presented as least-squares mean (standard error) changes from baseline. Results Mirikizumab demonstrated efficacy for the primary endpoint of clinical remission and major secondary endpoints including clinical response, endoscopic improvement, histologic–endoscopic mucosal improvement/remission, bowel urgency remission, and corticosteroid-free remission. Importantly, mirikizumab exhibited greater improvements versus placebo in the Inflammatory Bowel Disease Questionnaire, fatigue, symptomatic remission, and work productivity. Finally, mirikizumab demonstrated long-term (104-week) sustained, durable efficacy across all studied endpoints. No new safety signals were identified during 2-year follow-up. Conclusions Mirikizumab delivered significant clinical benefit for patients with baseline mMS of 5-9 and demonstrated a favorable safety profile.
0

S121 Crohn’s Disease and Small Bowel Adenocarcinoma: An Unexpected Finding

Brahma Natarajan et al.Dec 1, 2024
Background: Small bowel adenocarcinomas (SBA) are rare, comprising about 1-3% of all malignant GI tumors. Evidence suggests that patients with Crohn's disease (CD) are at increased risk of SBA compared to the general population; however, the diagnosis can be challenging as symptoms and imaging findings can mimic inflammatory bowel disease (IBD). Methods: We present a case of SBA in a patient with CD to highlight the difficulties in diagnosis of this rare entity that was further delayed by barriers to healthcare access. Case Report A 38-year-old man with CD presented to clinic with severe right-sided abdominal pain, nausea/vomiting, and weight loss (BMI 15). Exam showed a palpable, tender right-lower-quadrant mass. Labs revealed leukocytosis (WBC 14.2 cells/mm3), anemia (Hgb 9.0 g/dL), thrombocytosis (platelets 651 cells/mm3), elevated inflammatory markers (ESR 116 mm/h; CRP 239 mg/L), and hypoalbuminemia (1.7 g/dL). He was subsequently admitted to the hospital. The patient was originally diagnosed with CD 5 years prior while incarcerated, based on mild colonic inflammation on colonoscopy. Capsule endoscopy was recommended but never performed. CT enterography showed multifocal strictures as well as a distal ileal inflammatory stricture with intramural collection queried to represent early penetrating disease. Adalimumab was initiated with clinical response, although occasional gaps in therapy arose due to barriers accessing care. In the past year, weight loss and hypoalbuminemia raised concern for an alternate etiology. Colonoscopy was recommended, but the patient was lost to follow-up. At the time of his current presentation, MRI enterography showed long-segment distal ileal inflammation with a 6-cm abscess and hepatic lesions thought to be benign hemangiomas. Colonoscopy showed a non-traversable stricture at the ileocecal valve. The abscess was percutaneously drained, and TPN was initiated. He underwent planned ileocolonic resection 1 month later, which showed extensive inflammation requiring resection of 60 cm of small bowel. Liver lesions were also noted intra-operatively, initially suspected to be abscesses. Surgical pathology of the terminal ileum stricture showed poorly differentiated invasive adenocarcinoma with sarcomatoid components. Results: Biopsy of the liver lesions confirmed metastatic SBA, and the patient was referred to oncology. Conclusions: SBA is a rare but aggressive malignancy that can present with non-specific symptoms. Early detection leads to improved outcomes, but diagnosis is challenging in patients with underlying pathology such as CD as highlighted by this case. Moreover, patients with CD have an 8-fold increased risk of SBA likely due to chronic inflammation with the vast majority arising from an affected bowel segment. On imaging, these cancers can appear indistinguishable from CD-related fibrosis and inflammation. Thus, SBA are often found incidentally during surgery at more advanced stages. Compared to imaging, capsule endoscopy and/or small bowel enteroscopy may increase diagnostic yield in patients with a higher index of suspicion for SBA. In addition to underlying penetrating CD complicating diagnosis, social determinants of health further impacted this patient's clinical course. His difficulties accessing care resulted in lapses in treatment and delay in outpatient endoscopy. Overall, the absolute risk of SBA in CD is quite low and thus, routine surveillance would not be cost-effective. However, further work is needed to improve early detection.