Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
LA
Laetitia Attaiech
Author with expertise in Global Challenge of Antibiotic Resistance in Bacteria
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(80% Open Access)
Cited by:
662
h-index:
12
/
i10-index:
14
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
12

A natural single nucleotide mutation in the small regulatory RNA ArcZ ofDickeya solaniswitches off the antimicrobial activities against yeast and bacteria

Typhaine Brual et al.Jul 19, 2021
ABSTRACT The necrotrophic plant pathogenic bacterium Dickeya solani emerged in the potato agrosystem in Europe. All isolated strains of D. solani contain several large polyketide synthase/non-ribosomal peptide synthetase gene clusters. Analogy with genes described in other bacteria suggests that the clusters ooc and zms are involved in the production of secondary metabolites of the oocydin and zeamine families, respectively. A third cluster that we named ssm for s olani s econdary m etabolite had an unknown function. In this study, we constructed mutants impaired in each of the three secondary metabolite clusters ssm, ooc , and zms to compare first the phenotype of the D. solani wild-type strain D s0432-1 with its associated mutants. We demonstrated the antimicrobial functions of these three PKS/NRPS clusters against bacteria, yeasts or fungi. The secondary metabolite cluster ssm , conserved in several other Dickeya species, produces a secondary metabolite inhibiting yeasts. Phenotyping and comparative genomics of different D. solani wild-type isolates revealed that the small regulatory RNA ArcZ plays a major role in the control of the clusters ssm and zms . A single-point mutation, conserved in some Dickeya wild-type strains, including the type strain IPO 2222, impairs the ArcZ function by affecting its processing into an active form. AUTHOR SUMMARY The development of new antibacterial molecules is critical in tackling the emergence of new pathogens or bacterial strains resistant to already available antibiotics. Bacterial phytopathogens can potentially synthesize novel compounds capable of targeting a specific type of microorganism. Dickeya solani is the only of the twelve described Dickeya species that has the three secondary metabolic pathways ssm, ooc and zms . An investigation of the functions of these three clusters allowed us to identify the anti-yeast activity of the ssm cluster, a potential new molecule of clinical importance. By comparing the antimicrobial activity of several Dickeya solani strains, we identified the small RNA regulator ArcZ as a critical regulator in the activation of the ssm and zms clusters. Our study showed that single-nucleotide polymorphisms of sRNA encoding genes can have huge impacts on bacterial phenotypes. It is thus critical to pay attention to the allele diversity of sRNA genes.
12
Citation3
0
Save
0

Diverse conjugative elements silence natural transformation inLegionellaspecies

Isabelle Durieux et al.Apr 29, 2019
Abstract Natural transformation, i.e. the uptake of DNA and its stable integration in the chromosome, is a major mechanism of horizontal gene transfer and is common in bacteria. The vast majority of bacterial genomes carry the specific genes involved in natural transformation, yet only a fraction of species are deemed naturally transformable. This is typically explained by the inability of standard laboratory conditions to induce this phenotypic trait. However, even when the inducing conditions are known, large intraspecific variations have been reported. In this study, we investigated the conservation and distribution of natural transformability in the human pathogen Legionella pneumophila . Using a panel of 113 clinical isolates, we found that natural transformability is relatively conserved but shows large variations inconsistent with the phylogeny. By conducting a genome-wide association study (GWAS) we identified the conjugative plasmid pLPL as a source of these intraspecific variations. We further show that the plasmid inhibits transformation by simultaneously silencing the genes required for DNA uptake and recombination, comEC, comEA, comF and comM . We identified a plasmid-encoded small RNA (sRNA), RocRp, as solely responsible for the silencing of natural transformation. RocRp is homologous to the highly conserved and chromosome-encoded RocR which controls the transient expression of the DNA uptake system. We show that RocRp can take over the function of RocR, by acting as a substitute, ensuring that the bacterial host of the conjugative plasmid does not become naturally transformable. Distinct homologs of this plasmid-encoded sRNA are found in diverse conjugative elements in other Legionella species, suggesting that silencing natural transformation is beneficial to these genetic elements. We propose that transformation-interfering factors are frequent genetic cargo of mobile genetic elements, accounting for intraspecific variations in natural transformation but also responsible for the apparent non-transformability of some species.
1

Dual control of host actin polymerization by aLegionellaeffector pair

M. Pillon et al.May 15, 2023
ABSTRACT Host actin cytoskeleton is often targeted by pathogenic bacteria through the secretion of effectors. Legionella pneumophila virulence relies on the injection of the largest known arsenal of bacterial proteins, over 300 Dot/Icm Type 4 Secretion System effectors, into the host cytosol. Here we define the functional interactions between VipA and LegK2, two effectors with antagonistic activities towards actin polymerization that have been proposed to interfere with the endosomal pathway. We confirmed the prominent role of LegK2 effector in Legionella infection, as the deletion of legK2 results in defects in the inhibition of actin polymerization at the Legionella Containing Vacuole, as well as in endosomal escape of bacteria and subsequent intracellular replication. More importantly, we observed the restoration of the Î”legK2 mutant defects, upon deletion of vipA gene, making LegK2/VipA the first example of effector-effector suppression pair that targets the actin cytoskeleton and whose functional interaction impacts L. pneumophila virulence. We demonstrated that LegK2 and VipA do not modulate each other’s activity in a â€˜metaeffector’ relationship. Instead, the antagonistic activities of the LegK2/VipA effector pair would target different substrates, Arp2/3 for LegK2 and G-actin for VipA, to temporally control actin polymerization at the LCV and interfere with phagosome maturation and endosome recycling, thus contributing to the intracellular life cycle of the bacterium. Strikingly, the functional interaction between LegK2 and VipA is consolidated by an evolutionary history that has refined the best effector repertoire for the benefit of L. pneumophila virulence.