Sunitinib, a vascular endothelial growth factor pathway inhibitor, is an effective treatment for metastatic renal-cell carcinoma. We sought to determine the efficacy and safety of sunitinib in patients with locoregional renal-cell carcinoma at high risk for tumor recurrence after nephrectomy.

To conduct a phase I clinical trial with a second-generation oncolytic herpes simplex virus (HSV) expressing granulocyte macrophage colony-stimulating factor (Onco VEXGM-CSF) to determine the safety profile of the virus, look for evidence of biological activity, and identify a dosing schedule for later studies.The virus was administered by intratumoral injection in patients with cutaneous or s.c. deposits of breast, head and neck and gastrointestinal cancers, and malignant melanoma who had failed prior therapy. Thirteen patients were in a single-dose group, where doses of 10(6), 10(7), and 10(8) plaque-forming units (pfu)/mL were tested, and 17 patients were in a multidose group testing a number of dose regimens.The virus was generally well tolerated with local inflammation, erythema, and febrile responses being the main side effects. The local reaction to injection was dose limiting in HSV-seronegative patients at 10(7) pfu/mL. The multidosing phase thus tested seroconverting HSV-seronegative patients with 10(6) pfu/mL followed by multiple higher doses (up to 10(8) pfu/mL), which was well tolerated by all patients. Biological activity (virus replication, local reactions, granulocyte macrophage colony-stimulating factor expression, and HSV antigen-associated tumor necrosis), was observed. The duration of local reactions and virus replication suggested that dosing every 2 to 3 weeks was appropriate. Nineteen of 26 patient posttreatment biopsies contained residual tumor of which 14 showed tumor necrosis, which in some cases was extensive, or apoptosis. In all cases, areas of necrosis also strongly stained for HSV. The overall responses to treatment were that three patients had stable disease, six patients had tumors flattened (injected and/or uninjected lesions), and four patients showed inflammation of uninjected as well as the injected tumor, which, in nearly all cases, became inflamed.Onco VEXGM-CSF is well tolerated and can be safely administered using the multidosing protocol described. Evidence of an antitumor effect was seen.

Intravenous infusion of oncolytic reovirus in patients leads to infection of brain tumors, infiltration by cytotoxic T cells, and up-regulation of PD-L1.

Abstract It remains elusive whether some of the associations identified in genome-wide association studies of prostate cancer (PrCa) may be due to regulatory effects of genetic variants on CpG sites, which may further influence expression of PrCa target genes. To search for CpG sites associated with PrCa risk, here we establish genetic models to predict methylation (N = 1,595) and conduct association analyses with PrCa risk (79,194 cases and 61,112 controls). We identify 759 CpG sites showing an association, including 15 located at novel loci. Among those 759 CpG sites, methylation of 42 is associated with expression of 28 adjacent genes. Among 22 genes, 18 show an association with PrCa risk. Overall, 25 CpG sites show consistent association directions for the methylation-gene expression-PrCa pathway. We identify DNA methylation biomarkers associated with PrCa, and our findings suggest that specific CpG sites may influence PrCa via regulating expression of candidate PrCa target genes.

Abstract

 

Objectives

 To develop and validate a genetic tool to predict age of onset of aggressive prostate cancer (PCa) and to guide decisions of who to screen and at what age. 

Design

 Analysis of genotype, PCa status, and age to select single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with diagnosis. These polymorphisms were incorporated into a survival analysis to estimate their effects on age at diagnosis of aggressive PCa (that is, not eligible for surveillance according to National Comprehensive Cancer Network guidelines; any of Gleason score ≥7, stage T3-T4, PSA (prostate specific antigen) concentration ≥10 ng/L, nodal metastasis, distant metastasis). The resulting polygenic hazard score is an assessment of individual genetic risk. The final model was applied to an independent dataset containing genotype and PSA screening data. The hazard score was calculated for these men to test prediction of survival free from PCa. 

Setting

 Multiple institutions that were members of international PRACTICAL consortium. 

Participants

 All consortium participants of European ancestry with known age, PCa status, and quality assured custom (iCOGS) array genotype data. The development dataset comprised 31 747 men; the validation dataset comprised 6411 men. 

Main outcome measures

 Prediction with hazard score of age of onset of aggressive cancer in validation set. 

Results

 In the independent validation set, the hazard score calculated from 54 single nucleotide polymorphisms was a highly significant predictor of age at diagnosis of aggressive cancer (z=11.2, P<10⁻¹⁶). When men in the validation set with high scores (>98th centile) were compared with those with average scores (30th-70th centile), the hazard ratio for aggressive cancer was 2.9 (95% confidence interval 2.4 to 3.4). Inclusion of family history in a combined model did not improve prediction of onset of aggressive PCa (P=0.59), and polygenic hazard score performance remained high when family history was accounted for. Additionally, the positive predictive value of PSA screening for aggressive PCa was increased with increasing polygenic hazard score. 

Conclusions

 Polygenic hazard scores can be used for personalised genetic risk estimates that can predict for age at onset of aggressive PCa.

Abstract Breast, ovarian, and prostate cancers are hormone-related and may have a shared genetic basis, but this has not been investigated systematically by genome-wide association (GWA) studies. Meta-analyses combining the largest GWA meta-analysis data sets for these cancers totaling 112,349 cases and 116,421 controls of European ancestry, all together and in pairs, identified at P &lt; 10−8 seven new cross-cancer loci: three associated with susceptibility to all three cancers (rs17041869/2q13/BCL2L11; rs7937840/11q12/INCENP; rs1469713/19p13/GATAD2A), two breast and ovarian cancer risk loci (rs200182588/9q31/SMC2; rs8037137/15q26/RCCD1), and two breast and prostate cancer risk loci (rs5013329/1p34/NSUN4; rs9375701/6q23/L3MBTL3). Index variants in five additional regions previously associated with only one cancer also showed clear association with a second cancer type. Cell-type–specific expression quantitative trait locus and enhancer–gene interaction annotations suggested target genes with potential cross-cancer roles at the new loci. Pathway analysis revealed significant enrichment of death receptor signaling genes near loci with P &lt; 10−5 in the three-cancer meta-analysis. Significance: We demonstrate that combining large-scale GWA meta-analysis findings across cancer types can identify completely new risk loci common to breast, ovarian, and prostate cancers. We show that the identification of such cross-cancer risk loci has the potential to shed new light on the shared biology underlying these hormone-related cancers. Cancer Discov; 6(9); 1052–67. ©2016 AACR. This article is highlighted in the In This Issue feature, p. 932

Abstract Cytoplasmic pattern recognition receptors (PRRs) for double-stranded RNA (RIG-I/MDA5) are key mediators of anti-viral responses. PRR agonists, such as dsRNA oncolytic Reovirus type 3 Dearing (Rt3D), potently activate RNA sensors. We used an unbiased cytotoxicity screen to reveal synergistic drug-virotherapy combinations and found potent effects of Rt3D combined with the CDK4/6 inhibitor, palbociclib. The combination augmented oncolytic virus-induced endoplasmic reticulum (ER) stress/unfolded protein response (UPR) and the expression and activation/signaling of RNA sensors. Combined Rt3D-palbociclib treatment potently increased interferon production and signaling, and knockdown studies implicated key UPR proteins and the RNA sensor, RIG-I, as essential to the phenotype observed. Further experiments, using canonical RIG-I agonists and an ER stress inducer, thapsigargin, confirmed cross-talk between RNA sensing and ER stress pathways that augmented cancer cell death and interferon production. Combined Rt3D-palbociclib also increased innate immune activation within tumour cells and IFN-induced HLA expression. Analysis of the immunopeptidome revealed changes to HLA-captured peptides with Rt3D-palbociclib, including altered expression of peptides from cancer/testis antigens (CTA) and endogenous retroviral elements (ERVs). Our findings highlight cross-talk between UPR signaling and RNA-mediated PRR activation as a means of enhancing anti-cancer efficacy with potential pro-immunogenic consequences. This has implications for future clinical development of PRR agonists and oncolytic viruses, and broadens the therapeutic remit of CDK4/6 inhibitors to include roles as both ER stress and dsRNA PRR sensitizers.

We aimed to determine the effect of sample size on performance of polygenic hazard score (PHS) models in predicting the age at onset of prostate cancer. Age and genotypes were obtained for 40,861 men from the PRACTICAL consortium. The dataset included 201,590 SNPs per subject, and was split into training (34,444 samples) and testing (6,417 samples) sets. Two PHS model-building strategies were investigated. Established-SNP model considered 65 SNPs that had been associated with prostate cancer in the literature. A stepwise SNP selection was used to develop Discovery-SNP models. The performance of each PHS model was calculated for random sizes of the training set (1 to 30 thousand). The performance of a representative Established-SNP model was estimated for random sizes of the testing set (0.5 to 6 thousand). Mean HR98/50 (hazard ratio of top 2% to the average in the test set) of the Established-SNP model increased from 1.73[95%CI: 1.69-1.77] to 2.41[2.40-2.43] when the number of training samples was increased from 1 to 30 thousand. The corresponding HR98/50 of the Discovery-SNP model increased from 1.05[0.93-1.18] to 2.19[2.16-2.23]. HR98/50 of a representative Established-SNP model using testing set sample sizes of 0.6 and 6 thousand observations were 1.78[1.70-1.85] and 1.73[1.71-1.76], respectively. We estimate that a study population of 20 to 30 thousand men is required to develop Discovery-SNP PHS models for prostate cancer. The required sample size could be reduced to 10 thousand samples, if a set of SNPs associated with the disease has already been established.