The exhibition of increasingly intensive and complex niche construction behaviors through time is a key feature of human evolution, culminating in the advanced capacity for ecosystem engineering exhibited by Homo sapiens . A crucial outcome of such behaviors has been the dramatic reshaping of the global biosphere, a transformation whose early origins are increasingly apparent from cumulative archaeological and paleoecological datasets. Such data suggest that, by the Late Pleistocene, humans had begun to engage in activities that have led to alterations in the distributions of a vast array of species across most, if not all, taxonomic groups. Changes to biodiversity have included extinctions, extirpations, and shifts in species composition, diversity, and community structure. We outline key examples of these changes, highlighting findings from the study of new datasets, like ancient DNA (aDNA), stable isotopes, and microfossils, as well as the application of new statistical and computational methods to datasets that have accumulated significantly in recent decades. We focus on four major phases that witnessed broad anthropogenic alterations to biodiversity—the Late Pleistocene global human expansion, the Neolithic spread of agriculture, the era of island colonization, and the emergence of early urbanized societies and commercial networks. Archaeological evidence documents millennia of anthropogenic transformations that have created novel ecosystems around the world. This record has implications for ecological and evolutionary research, conservation strategies, and the maintenance of ecosystem services, pointing to a significant need for broader cross-disciplinary engagement between archaeology and the biological and environmental sciences.

A synthetic history of human land use Humans began to leave lasting impacts on Earth's surface starting 10,000 to 8000 years ago. Through a synthetic collaboration with archaeologists around the globe, Stephens et al. compiled a comprehensive picture of the trajectory of human land use worldwide during the Holocene (see the Perspective by Roberts). Hunter-gatherers, farmers, and pastoralists transformed the face of Earth earlier and to a greater extent than has been widely appreciated, a transformation that was essentially global by 3000 years before the present. Science , this issue p. 897 ; see also p. 865

We assembled genome-wide data from 16 prehistoric Africans. We show that the anciently divergent lineage that comprises the primary ancestry of the southern African San had a wider distribution in the past, contributing approximately two-thirds of the ancestry of Malawi hunter-gatherers ∼8,100–2,500 years ago and approximately one-third of the ancestry of Tanzanian hunter-gatherers ∼1,400 years ago. We document how the spread of farmers from western Africa involved complete replacement of local hunter-gatherers in some regions, and we track the spread of herders by showing that the population of a ∼3,100-year-old pastoralist from Tanzania contributed ancestry to people from northeastern to southern Africa, including a ∼1,200-year-old southern African pastoralist. The deepest diversifications of African lineages were complex, involving either repeated gene flow among geographically disparate groups or a lineage more deeply diverging than that of the San contributing more to some western African populations than to others. We finally leverage ancient genomes to document episodes of natural selection in southern African populations.PaperClip/cms/asset/aff11cbc-5c45-44d9-b580-9e5cd3a522c8/mmc8.mp3Loading ...(mp3, 2.91 MB) Download audio

The Austronesian settlement of the remote island of Madagascar remains one of the great puzzles of Indo-Pacific prehistory. Although linguistic, ethnographic, and genetic evidence points clearly to a colonization of Madagascar by Austronesian language-speaking people from Island Southeast Asia, decades of archaeological research have failed to locate evidence for a Southeast Asian signature in the island's early material record. Here, we present new archaeobotanical data that show that Southeast Asian settlers brought Asian crops with them when they settled in Africa. These crops provide the first, to our knowledge, reliable archaeological window into the Southeast Asian colonization of Madagascar. They additionally suggest that initial Southeast Asian settlement in Africa was not limited to Madagascar, but also extended to the Comoros. Archaeobotanical data may support a model of indirect Austronesian colonization of Madagascar from the Comoros and/or elsewhere in eastern Africa.

Abstract Archaeological and environmental research by an international and interdisciplinary team opens new perspectives into the settlement histories of Kansyore, Early Iron Age, and Bigo period peoples in the once forested regions of the Ndali Crater Lakes Region (NCLR) of western Uganda. The research examines the role of Kansyore agropastoralists and their Early Iron Age and Bantu-speaking contemporaries in remaking a once forested environment into a forest-savannah mosaic from circa 500 BC to the end of the first millennium AD. Archaeological settlement and subsistence evidence is examined within a framework of social interaction of Sudanic speakers with Bantu speakers, drawing on historical linguistics and environmental studies to arrive at a new synthesis of late Holocene history in western Uganda. This perspective also unveils the significance and chronology of Boudiné ware, a long enigmatic ceramic tradition that we identify as contemporary to Transitional Urewe and deeply influenced through social interactions with those making Kansyore ceramics and inhabiting the same landscape. Using archaeological evidence from fifteen sites and multiple burials spanning from 400 to 1650 calAD, new views of ceramic histories, lifeways, and symbolic values are revealed, including Bigo period settlements that arose in what was an environmental refugium beginning in the early fourteenth century AD. This research also shows that the Kansyore of the forested region east of the Rwenzori Mountains had greater affinities to late Holocene archaeological evidence from western Equatoria, in the southern South Sudan, and Kansyore Island, Uganda, than it does to the Kansyore in eastern Kenya.

Abstract The distribution of the black rat ( Rattus rattus ) has been heavily influenced by its association with humans. The dispersal history of this non-native commensal rodent across Europe, however, remains poorly understood, and different introductions may have occurred during the Roman and medieval periods. Here, in order to reconstruct the population history of European black rats, we generated a de novo genome assembly of the black rat, 67 ancient black rat mitogenomes and 36 ancient nuclear genomes from sites spanning the 1 st -17 th centuries CE in Europe and North Africa. Analyses of mitochondrial DNA confirm that black rats were introduced into the Mediterranean and Europe from Southwest Asia. Genomic analyses of the ancient rats reveal a population turnover in temperate Europe between the 6 th and 10 th centuries CE, coincident with an archaeologically attested decline in the black rat population. The near disappearance and re-emergence of black rats in Europe may have been the result of the breakdown of the Roman Empire, the First Plague Pandemic, and/or post-Roman climatic cooling.

Justice-oriented climate activism is proliferating. Many scholars aspire to deliver research that supports activism. However, measures of impact for research evaluation and funding purposes place little weight on the use of research by activists. Here we consider how academics and academia might effectively support and enable climate activism. We report outcomes from a series of online deliberative workshops involving both activists and academics from several European countries. The workshops were facilitated to create space for discussion, sharing of experiences and the development of proposals for the future. The outcomes take the form of a set of principles (a “minifesta”) for academic-activist engagement generated by the group. In discussing the process and outputs, we argue that a focus on inclusion can support politically transformative change of the scale and urgency required. We suggest that this also demands a shift in attitudes toward the role of activism and activists in collaborative processes. We further discuss the inevitable incompleteness of this process, arguing that incompleteness is, itself, a feature of inclusive engagement. We conclude that scholars working on climate issues in any discipline could benefit from increasing mutually supportive collaboration with activists; and that such collaboration and inclusion could help liberate democracy from authoritarian tendencies and market influences. Collaborative engagements generate legitimate, rich, and impactful outcomes even with the limitations posed by COVID19. We, therefore, commend both the model of engagement and the principles it generated for our colleagues and peers.

The origin and dispersal of the domestic cat remain elusive despite its importance to human societies around the world. Archaeological evidence for domestication centers in the Near East and in Egypt is contested, and genetic data on modern cats show that Felis silvestris lybica, the subspecies of wild cat inhabiting at present the Near East and Northern Africa, is the only ancestor of the domestic cat. Here we provide the first broad geographic and chronological dataset of ancient cat mtDNA sequences, drawing on archaeological specimens from across western Eurasia and northern and eastern Africa, dating from throughout the Holocene and spanning ~9,000 years. We characterized the ancient phylogeography of F. s. lybica, showing that it expanded up to southeastern Europe prior to the Neolithic, and reconstructed the subsequent movements that profoundly transformed its distribution and shaped its early cultural history. We found that maternal lineages from both the Near East and Egypt contributed to the gene pool of the domestic cat at different historical times, with the Near Eastern population providing the first major contribution during the Neolithic and the Egyptian cat spreading efficiently across the Old World during the Classical period. This expansion pattern and range suggest dispersal along maritime and terrestrial routes of trade and connectivity. Late trait selection is suggested by the first occurrence in our dataset of the major allele for blotched-tabby body marking not earlier than during the Late Middle Ages.