Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
BR
Bhaskar Roy
Author with expertise in Developmental Origins of Adult Health and Disease
Achievements
This user has not unlocked any achievements yet.
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(40% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
33
/
i10-index:
76
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
2

Denaturation resistant P2 tetramer is required to import fatty acids into intraerythrocytic Plasmodium falciparum

Sudipta Das et al.Jun 11, 2022
Abstract The initiation of asymmetric karyokinesis of intraerythrocytic Plasmodium falciparum (Pf) begins without dismantling the nuclear envelope showing the hallmark feature of closed mitosis (1-10). In Pf, karyokinesis precedes cytokinesis and cell body formation (6, 8-10). Regulation at the beginning of nuclear division either through checkpoints or by importing serum components was largely unknown. At the trophozoite stage, PfP2 tetramer trafficked to the infected erythrocyte (IE) surface and the inaccessibility of IE surface PfP2 to its bonafide ligand led to the arrest of nuclear division (11-13). Here we show that PfP2 tetramer localization on the IE surface and the beginning of nuclear division are concomitant in nature. Synthetically induced denaturation resistant PfP2 tetramer interacts with human serum fatty acids and phospholipids for its import into IEs at the beginning of karyokinesis. In the natively folded denaturation resistant PfP2 tetramer cage, the Cys-Cys redox switch regulates the binding and subsequent release of fatty acids on the IE surface. This mechanistic insight of fatty acids import inside IEs using synthetically induced denaturation resistant PfP2 tetramer provides an unique drug screening platform for novel small molecule screening against malaria.
0

The landscape of somatic mutation in sporadic Chinese colorectal cancer

Zhe Liu et al.Jul 10, 2017
Colorectal cancer is the fifth prevalent cancer in China. Nevertheless, a large-scale characterization of Chinese colorectal cancer mutation spectrum has not been carried out. In this study, we have performed whole exome-sequencing analysis of 98 patients' tumor samples with matched pairs of normal colon tissues using Illumina and Complete Genomics high-throughput sequencing platforms. Canonical CRC somatic gene mutations with high prevalence (>10%) have been verified, including TP53, APC, KRAS, SMAD4, FBXW7 and PIK3CA. PEG3 is identified as a novel frequently mutated gene (10.6%). APC and Wnt signaling exhibit significantly lower mutation frequencies than those in TCGA data. Analysis with clinical characteristics indicates that APC gene and Wnt signaling display lower mutation rate in lymph node positive cancer than negative ones, which are not observed in TCGA data. APC gene and Wnt signaling are considered as the key molecule and pathway for colorectal cancer initiation, and these findings greatly undermine their importance in tumor progression for Chinese patients. Taken together, the application of next-generation sequencing has led to the determination of novel somatic mutations and alternative disease mechanisms in colorectal cancer progression, which may be useful for understanding disease mechanism and personalizing treatment for Chinese patients.
0

Genome-wide methylome-based molecular pathologies associated with depression and suicide

Yogesh Dwivedi et al.Dec 7, 2024
Abstract Major depressive disorder (MDD) is a debilitating disorder. Suicide attempts are 5-times higher in MDD patients than in the general population. Interestingly, not all MDD patients develop suicidal thoughts or complete suicide. Thus, it is important to study the risk factors that can distinguish suicidality among MDD patients. The present study examined if DNA methylation changes can distinguish suicidal behavior among depressed subjects. Genome-wide DNA methylation was examined in the dorsolateral prefrontal cortex of depressed suicide (MDD+S; n = 15), depressed non-suicide (MDD−S; n = 17), and nonpsychiatric control (C; n = 16) subjects using 850 K Infinium Methylation EPIC BeadChip. The significantly differentially methylated genes were used to determine the functional enrichment of genes for ontological clustering and pathway analysis. Based on the number of CpG content and their relative distribution from specific landmark regions of genes, 32,958 methylation sites were identified across 12,574 genes in C vs. MDD+/−S subjects, 30,852 methylation sites across 12,019 genes in C vs. MDD−S, 41,648 methylation sites across 13,941 genes in C vs. MDD+S, and 49,848 methylation sites across 15,015 genes in MDD−S vs. MDD+S groups. A comparison of methylation sites showed 33,129 unique methylation sites and 5451 genes in the MDD−S group compared to the MDD+S group. Functional analysis suggested oxytocin, GABA, VGFA, TNFA, and mTOR pathways associated with suicide in the MDD group. Altogether, our data show a distinct pattern of DNA methylation, the genomic distribution of differentially methylated sites, gene enrichment, and pathways in MDD suicide compared to non-suicide MDD subjects.