Abstract Shotgun sequencing enables retrieving high resolution information 40 from complex microbial communities. However, the technique is limited by missing information about host-to-microbe ratios observed in different sample types. This makes it challenging to plan sequencing experiments, especially in the context of high sample multiplexing and/or limited sequencing output. We evaluated a qPCR-based assay to predict host-to microbe ratio prior to sequencing. Using a two-target assay aimed at conserved human and bacterial genes, we predicted human-to-microbe ratios in two sample types and validated it on independently collected samples. The assay enabled accurate prediction for a broad range of sample compositions.

Extranodal extension of tumour on histopathology is known to be a negative prognostic factor in head and neck cancer. Compelling evidence suggests that extranodal extension detected on radiological imaging is also a negative prognostic factor. Furthermore, if imaging detected extranodal extension could be identified reliably before the start of treatment, it could be used to guide treatment selection, as patients might be better managed with non-surgical approaches to avoid the toxicity and cost of trimodality therapy (surgery, chemotherapy, and radiotherapy together). There are many aspects of imaging detected extranodal extension that remain unresolved or are without consensus, such as the criteria to best diagnose them and the associated terminology. The Head and Neck Cancer International Group conducted a five-round modified Delphi process with a group of 18 international radiology experts, representing 14 national clinical research groups. We generated consensus recommendations on the terminology and diagnostic criteria for imaging detected extranodal extension to harmonise clinical practice and research. These recommendations have been endorsed by 19 national and international organisations, representing 34 countries. We propose a new classification system to aid diagnosis, which was supported by most of the participating experts over existing systems, and which will require validation in the future. Additionally, we have created an online educational resource for grading imaging detected extranodal extensions.

Abstract Immune checkpoint blockade (ICB) approaches have changed the therapeutic landscape for many tumor types. However, half of cutaneous squamous cell carcinoma (cSCC) patients remain unresponsive or develop resistance. Here, we show that, during cSCC progression in male mice, cancer cells acquire epithelial/mesenchymal plasticity and change their immune checkpoint (IC) ligand profile according to their features, dictating the IC pathways involved in immune evasion. Epithelial cancer cells, through the PD-1/PD-L1 pathway, and mesenchymal cancer cells, through the CTLA-4/CD80 and TIGIT/CD155 pathways, differentially block antitumor immune responses and determine the response to ICB therapies. Accordingly, the anti-PD-L1/TIGIT combination is the most effective strategy for blocking the growth of cSCCs that contain both epithelial and mesenchymal cancer cells. The expression of E-cadherin/Vimentin/CD80/CD155 proteins in cSCC, HNSCC and melanoma patient samples predicts response to anti-PD-1/PD-L1 therapy. Collectively, our findings indicate that the selection of ICB therapies should take into account the epithelial/mesenchymal features of cancer cells.

Background Cisplatin-based chemoradiation is a standard treatment for many patients with human papillomavirus (HPV)-positive oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPSCC), an etiologically distinct subset of head and neck cancer. Although associated with good long-term survival, clinical risk factors for ototoxicity have been understudied in this population. This study aimed to evaluate clinical predictors associated with ototoxicity in HPV-positive OPSCC patients treated with cisplatin chemoradiation. Methods This retrospective case-control study included 201 adult patients (>18 years) with histologically confirmed HPV-positive OPSCC who received cisplatin chemoradiation as their primary treatment from 2001 and 2019 at a single tertiary cancer center. Ototoxicity was determined using baseline and follow-up audiometry and the Common Terminology Criteria for Adverse Events v5.0 grading criteria (Grade ≥2). Multivariable logistic regression [adjusted odds ratio (aOR)] identified significant predictors that increased the odds of ototoxicity. Results A total of 201 patients [165 males; median (IQR) age, 57 (11) years] were included in the study. The incidence of ototoxicity in the worst ear was 56.2%, with the greatest hearing loss occurring at high frequencies (4-8 kHz), resulting in a loss of 12.5 dB at 4 to 6 kHz and 20 dB at 6 to 8 kHz. High-dose cisplatin administration compared to weekly administration [aOR 4.93 (95% CI: 1.84-14.99), P = .003], a higher mean cochlear radiation dose [aOR 1.58 (95% CI: 1.12-2.30), P = .01], smoking history [aOR 2.89 (95% CI: 1.51-5.63), P = .001], and a 10 year increase in age [aOR 2.07 (95% CI: 1.25-3.52), P = .006] were each independently associated with increased odds of ototoxicity. Conclusions Clinical predictors of ototoxicity in HPV-positive OPSCC patients treated with cisplatin-based chemoradiation include the use of a high-dose cisplatin regimen, higher cochlear radiation doses, a history of smoking, and older age. With the rising incidence of this malignancy in Western countries and overall improved survivorship, our research motivates future studies into risk stratification and earlier interventions to mitigate and reduce the risk of ototoxicity.

Detection of extranodal extension on histopathology in surgically treated head and neck squamous cell carcinoma indicates poor prognosis. However, there is no consensus on the diagnostic criteria, interpretation, and reporting of histology detected extranodal extension, which has contributed to conflicting evidence in the literature, and likely clinical inconsistency. The Head and Neck Cancer International Group conducted a three-round modified Delphi process with a group of 19 international pathology experts representing 15 national clinical research groups to generate consensus recommendations for histology detected extranodal extension diagnostic criteria. The expert panel strongly agreed on terminology and diagnostic features for histology detected extranodal extension and soft tissue metastasis. Moreover, the panel reached consensus on reporting of histology detected extranodal extension and on nodal sampling. These consensus recommendations, endorsed by 19 organisations representing 34 countries, are a crucial development towards standardised diagnosis and reporting of histology detected extranodal extension, and more accurate data collection and analysis.

Objectives Anti-PD-(L)1 agents changed the landscape of recurrent or metastatic head and neck squamous cell carcinoma (R/M HNSCC) treatment. Previous studies showed improved response rates to salvage chemotherapy (SCT) after progression to anti-PD-(L)1 agents. This study aims to evaluate the outcomes of SCT and to identify predictors of response and survival in patients with R/M HNSCC. Materials and methods Retrospective cohort analysis of 63 R/M patients treated with SCT after antiPD-(L1)-based therapy between January 2015 and August 2022. The overall response rate (ORR) was evaluated. Progression-free survival (PFS) and overall survival (OS) were estimated with Kaplan–Meier method. Progression-free survival 2 was calculated from anti-PD-(L)1-therapy start until progression to SCT (PFS2-I). Logistic regression and Cox regression analyses were performed to identify predictors of outcome. Results A total of 63 patients were included: 76% were men, and median age was 60 years. PD-L1 status was available in 68% (61% positive). Up to 71% received SCT as third line or beyond. ORR to SCT was 49% with higher rates in PD-L1 positive tumors, 71% vs. 18% (p=0.001), and cetuximab-containing regimens, 68% vs. 39% (p=0.026). PD-L1 status was the only predictor of ORR in the adjusted model (OR=8.6, 95% CI 1.7–43.0). OS and PFS were 9.3 months (95% CI, 6.5–12.3) and 4.1 months (95% CI, 3.0–5.8) respectively. PFS2-I was 8.6 months (95% CI, 6.6–10.5). In the multivariate analysis, PD-L1 was the only independent factor for OS (HR=0.3; 95% CI, 0.1–0.7), PFS (HR=0.2; 95% CI, 0.1–0.5; p<0.001), and PFS2-I (HR=0.2; 95% CI 0.1–0.5; p<0.001). Conclusion PDL1 status appeared as a strong predictor of response of efficacy for SCT after anti-PD-(L)1 agents. Patients receiving cetuximab-containing regimens trended towards greater benefit. This highlights the importance of treatment sequencing and personalized treatment strategies.