Abstract Zinc transporter 8 (ZnT8) is mainly expressed in pancreatic islet β cells and is responsible for H + -coupled uptake (antiport) of Zn 2+ into the lumen of insulin secretory granules. Structures of human ZnT8 and its prokaryotic homolog YiiP have provided structural basis for constructing a plausible transport cycle for Zn 2+ . However, the mechanistic role that protons play in the transport process remains unclear. Here we present a lumen-facing cryo-EM structure of ZnT8 from Xenopus tropicalis (xtZnT8) in the presence of Zn 2+ at a luminal pH (5.5). Compared to a Zn 2+ -bound xtZnT8 structure at a cytosolic pH (7.5), the low-pH structure displays an empty transmembrane Zn 2+ -binding site with a disrupted coordination geometry. Combined with a Zn 2+ -binding assay our data suggest that protons may disrupt Zn 2+ coordination at the transmembrane Zn 2+ -binding site in the lumen-facing state, thus facilitating Zn 2+ release from ZnT8 into the lumen.

Abstract CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6 (CMTM6) is a master regulator of PD-L1. By binding PD-L1 at the plasma membrane and recycling endosomes, CMTM6 prevents the lysosomal degradation of PD-L1 and maintains its cell surface expression, thus stabilizing the inhibitory PD-1/PD-L1 axis. However, the mechanism of CMTM6/PD-L1 interaction is unknown. Here we report the first experimentally determined structure of CMTM6 from bovine. Combined with a low-resolution cryo-EM map, computational docking analysis and a protein binding assay an interaction model between CMTM6 and PD-L1 was proposed, providing a structural framework for the CMTM6 regulation on PD-L1.