SK
Sunil Kumar
Author with expertise in Male Reproductive Health
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(100% Open Access)
Cited by:
2
h-index:
17
/
i10-index:
25
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

AtERF60, negatively regulatesABR1to modulate basal resistance response in Arabidopsis

Ashutosh Joshi et al.Dec 29, 2021
Abstract APETALA2 (AP2)/ERF family transcription factors (TFs) contribute an important function against various external cues. Our study reports AtERF60 , an AP2/ERF TF, which plays a key role in regulating the ABR1 gene, leading to an altered basal resistance response in Arabidopsis. AtERF60 is induced in response to drought, salt, abscisic acid (ABA), salicylic acid (SA), and bacterial pathogen Pst DC3000 infection. AtERF60 interacts with DEHYDRATION RESPONSE ELEMENTS and GCC box, indicating its ability to regulate multiple responses. The overexpressing lines of AtERF60 demonstrated increased resistance to Pst DC3000 infection, whereas erf60 mutant lines showed increased susceptibility. Complementation of the erf60 mutant background exhibits no significant difference towards Pst DC3000 infection compared with the WT Col-0. Microarray and qRT-PCR analysis of overexpression and mutant lines indicated that AtERF60 regulates stress-inducible genes. The induction of these differentially expressed transcripts was significantly increased in erf60 mutant lines, whereas it was reversed in wild-type lines when AtERF60 was complemented. ABR1 was one of the differentially expressed transcripts, and we discovered that AtERF60 interacts with the DRE cis -elements in the ABR1 promoter. Further, qRT-PCR expression analysis after infection with Pst DC3000 in AtERF60-OX , erf60 and its complementation background suggest that the mutation in AtERF60 upregulates ABR1 activity, leading to the enhanced susceptibility towards Pst DC3000. Conversely, AtERF60 overexpression suppresses ABR1 activity, strengthening the basal resistance responses of Arabidopsis.
1
Citation1
0
Save
1

Knockdown of a novel ATPase domain of capsid protein inhibits genome packaging in potato leaf roll virus

Jitesh Kumar et al.May 24, 2021
Abstract Potato leaf roll virus (PLRV) uses powerful molecular machines to package its genome into a viral capsid employing ATP as fuel. Although, recent bioinformatics and structural studies have revealed detailed mechanism of DNA packaging, little is known about the mechanochemistry of genome packaging in small plant viruses such as PLRV. We have identified a novel P-loop-containing ATPase domain with two Walker A-like motifs, two arginine fingers, and two sensor motifs distributed throughout the polypeptide chain of PLRV capsid protein (CP). The composition and arrangement of the ATP binding and hydrolysis domain of PLRV CP is unique and rarely reported. The discovery of the system sheds new light on the mechanism of viral genome packaging, regulation of viral assembly process, and evolution of plant viruses. Here, we used the RNAi approach to suppress CP gene expression, which in turn prevented PLRV genome packaging and assembly in Solanum tuberosum cv. Khufri Ashoka. Potato plants agroinfiltrated with siRNA constructs against the ATPase domain of CP exhibited no rolling symptoms upon PLRV infection, indicating that the silencing of CP gene expression is an efficient method for generating PLRV-resistant potato plants. Moreover, our findings provide a robust approach to generate PLRV-resistant potato plants, which can be further extended to other species. Finally, we propose a new mechanism of genome packaging and assembly in plant viruses.
1
Citation1
0
Save
4

Mass spectrometric analysis and biostimulatory effects of boar seminal gel, saliva and semen in pigs

Sunil Kumar et al.Feb 8, 2023
ABSTRACT The present study aimed to identify novel biostimulatory compounds in boar seminal gel (SG), saliva and semen using Gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS). SG alone and its combined application with saliva (SG+saliva) and semen (SG+semen) also studied to train young boars. SG alone and SG+Saliva investigated for estrus induction in gilts and sows. Distilled water (DW) exposure was kept as control. SG, saliva and semen screened for total 105, 96 and 89 compounds. The highest concentration was of alkanes followed by sugar alcohols, then hydrocarbons, amino acids and fatty acids. Elaidic acid is the novel compound identified in pigs. Other compounds were tridecenol, undecane, hexadecone, eicosane, tetracosane etc. Further, young males (64.86%) were able to get trained. Significant higher (p<0.05) number of males got trained in exposure to SG (80%), SG+saliva (75%) and SG+semen (75%) than control. The time (hrs) taken by young boars to get trained on exposure to combination of SG+saliva (244±22.19) and SG+semen (216±13.14) was lesser (p<0.05) than SG (356±61.85) alone. Interval (hrs) for exhibition of different sexual behaviour by males on exposure to SG, saliva and semen was lesser (p<0.05) than control. Estrus was induced in 61.25% of females. Significant (p<0.05) higher number of females showed estrus response to exposure of SG (72.72%) and SG+saliva (69.23%) than control. Interval taken to exhibit estrus was lesser (p<0.05) in females exposed to SG+saliva (201.88±12.66) than SG (262.14±20.06) alone. Interval (hrs) for exhibition of different sexual behaviour by females on exposure to SG+saliva was lesser (p<0.05) than control. In conclusion, novel compounds with biostimulatory properties have been identified in boar SG, saliva and semen. The combined exposure of SG with saliva and semen have more intense biostimulation effect than SG alone. Such compounds and biostimulatory effects can be exploited for augmenting reproductive efficiency in pigs.