LH
Lin Huang
Author with expertise in RNA Methylation and Modification in Gene Expression
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
8
(50% Open Access)
Cited by:
56
h-index:
31
/
i10-index:
62
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
9

Effects of green tea extract on overweight and obese women with high levels of low density-lipoprotein-cholesterol (LDL-C): a randomised, double-blind, and cross-over placebo-controlled clinical trial

Lin Huang et al.Nov 6, 2018
This study aims to examine the effects of green tea extract (GTE) supplement on overweight and obese women with high levels of low density lipoprotein-cholesterol (LDL-C).The randomized, double-blind, crossover and placebo-controlled clinical trial was conducted from August 2012 to December 2013. Seventy-three out of 90 subjects aged between 18 and 65 years, with body mass index (BMI) ≥ 27 kg/m2 and LDL-C ≥ 130 mg/dl were included in the analysis. The subjects were randomly divided into Groups A and B. Group A received GTE supplement treatment for the first 6 weeks, while Group B received placebo daily. After 6 weeks of treatment and 14 days of washout period, Group A switched to placebo and Group B switched to GTE treatment for 6 weeks. The reduction of LDL-C level between treatments was assessed as the outcome. Additionally, anthropometric measurements, plasma lipoproteins and hormone peptides of both groups were measure at the beginning of weeks 6, 8, and 14 after treatment.Subjects treated with GTE (n = 73) for 6 weeks showed significant differences, with 4.8% (p = 0.048) reduction in LDL-C and 25.7% (p = 0.046) increase in leptin. However, there was no statistical difference in the levels of total cholesterol, triglyceride and high density lipoprotein between the GTE and placebo groups after treatments.This study shows that green tea extract effectively increases leptin and reduces LDL in overweight and obese women after 6 weeks of treatment even though there were no significant changes in other biochemical markers related to overweight.This clinical trial is registered with ClinicalTrials.gov: NCT02116517 on 17 April 2014. Retrospectively registered. The first patient enrolled in October 2012 and the study was completed December 2013.
3

Linking folding dynamics and function of SAM/SAH riboswitches at the single molecule level

Ting‐Wei Liao et al.Mar 11, 2023
Abstract Riboswitches are found in the 5’-UTR of many bacterial mRNAs. They function as cisacting regulatory elements that control downstream gene expression through ligand-induced conformational changes. Here, we used single-molecule FRET to map the conformational landscape of the SAM/SAH riboswitch and probe how co-transcriptional ligand-induced conformational changes of this translational switch alter ribosome accessibility. The folding of the riboswitch is highly heterogenous, indicating a complex and rugged conformational landscape that enables sampling of the ligand-bound conformation even in the absence of the ligand. Upon ligand binding, the landscape shifts towards the ligand-bound conformation. Mutations at key stabilizing structures alter the ligand-free folding behavior and decrease ligand responsiveness. We also explored translational regulation through folding kinetics by utilizing short oligonucleotides to probe the accessibility of the Shine-Dalgarno sequence within the riboswitch. Additionally, we employed a helicase-based vectorial folding assay to simulate co-transcriptional folding. We find that a competition between ligand binding and ribosome binding is fined tuned via the kinetics of folding. During transcription, the riboswitch takes minutes before reaching equilibrated conformations, and such slow equilibration decreases the effective ligand affinity. Overall, our data demonstrate the significance of conformational polymorphism in RNA function, emphasizing the utilization of complex folding landscapes for regulating ribosome accessibility through ligand induction. Furthermore, we provide direct evidence on how folding kinetics modulate this regulation process.
3
Citation1
0
Save
0

Variation in the intestinal bacterial community composition under different water temperature culture conditions in largemouth bass (Micropterus salmoides)

Dongdong Wei et al.Nov 6, 2024
Abstract Aims This study aimed to investigate the impact of temperature on the intestinal microbiota of largemouth bass using 16S rRNA gene amplicon sequencing, focusing on the under-explored role of abiotic factors in shaping the gut microbial community. Methods and Results Five water temperature groups (20.0 ± 0.2 °C, 25.0 ± 0.2 °C, 28.0 ± 0.2 °C, 31.0 ± 0.2 °C, and 35.0 ± 0.2 °C) were established, each with three replicates. Significant variations in intestinal bacterial community composition were observed across these conditions. Elevated temperatures (31.0 ± 0.2 °C and 35.0 ± 0.2 °C) led to an increase in opportunistic pathogens such as OTU180 Vibrio and OTU2015 Vogesella (P &lt; 0.05). Species correlation network analysis showed a shift towards more positive relationships among intestinal microbes at higher temperatures (P &lt; 0.05). Ecological process analysis highlighted a greater role of ecological drift in microbial community structure at 31.0 ± 0.2 °C and 35.0 ± 0.2 °C (P &lt; 0.05). Conclusions The study suggests that higher temperatures may predispose largemouth bass to opportunistic pathogens by altering their intestinal microbiota. Effective water temperature management is crucial for largemouth bass aquaculture to mitigate pathogen risks and maintain a balanced intestinal microbiota. This research provides critical insights into the temperature-microbiota relationship and offers practical recommendations for aquaculture practices.