Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
DW
David Wylensek
Author with expertise in Diversity and Function of Gut Microbiome
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(100% Open Access)
Cited by:
314
h-index:
2
/
i10-index:
1
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

A collection of bacterial isolates from the pig intestine reveals functional and taxonomic diversity

David Wylensek et al.Dec 15, 2020
Our knowledge about the gut microbiota of pigs is still scarce, despite the importance of these animals for biomedical research and agriculture. Here, we present a collection of cultured bacteria from the pig gut, including 110 species across 40 families and nine phyla. We provide taxonomic descriptions for 22 novel species and 16 genera. Meta-analysis of 16S rRNA amplicon sequence data and metagenome-assembled genomes reveal prevalent and pig-specific species within Lactobacillus, Streptococcus, Clostridium, Desulfovibrio, Enterococcus, Fusobacterium, and several new genera described in this study. Potentially interesting functions discovered in these organisms include a fucosyltransferase encoded in the genome of the novel species Clostridium porci, and prevalent gene clusters for biosynthesis of sactipeptide-like peptides. Many strains deconjugate primary bile acids in in vitro assays, and a Clostridium scindens strain produces secondary bile acids via dehydroxylation. In addition, cells of the novel species Bullifex porci are coccoidal or spherical under the culture conditions tested, in contrast with the usual helical shape of other members of the family Spirochaetaceae. The strain collection, called 'Pig intestinal bacterial collection' (PiBAC), is publicly available at www.dsmz.de/pibac and opens new avenues for functional studies of the pig gut microbiota.
0
Citation314
0
Save
21

Secondary bile acid production by gut bacteria promotes Western diet-associated colorectal cancer

Esther Wortmann et al.Mar 18, 2023
Western diet is an important risk factor for the development of sporadic colorectal cancer (CRC). Dietary fat stimulates bile acid (BA) production by the host and their conversion to secondary BAs by 7α-dehydroxylating (7αDH+) bacteria, but causal proof of their tumor-promoting effects in vivo is lacking. To address this, we performed feeding studies in a genetically engineered pig model of CRC combined with multi-omics analyses and gnotobiotic mouse studies. Western diet worsened the disease phenotype in APC1311/+ pigs. This was accompanied by microbiota changes, increased levels of the secondary bile acid deoxycholic acid (DCA), and higher colonic epithelial cell proliferation. The latter was counteracted by using the BA-scavenging drug colestyramine. Metagenomic analysis across multiple cohorts revealed higher occurrence of bai (BA inducible) operons from Clostridium scindens and close relatives in stool of CRC subjects (n = 1,034). Using two gnotobiotic mouse models of CRC, we demonstrate that colonization with 7αDH+ bacteria (C. scindens or Extibacter muris) increased colonic tumor loads. This work provides clear evidence for the causal role of microbiome-derived DCA production in CRC under detrimental dietary conditions, opening avenues for future preventive strategies.