ABSTRACT Leptospira species colonize a significant proportion of rodent populations worldwide and produce life-threatening infections in accidental hosts, including humans. Complete genome sequencing of Leptospira interrogans serovar Copenhageni and comparative analysis with the available Leptospira interrogans serovar Lai genome reveal that despite overall genetic similarity there are significant structural differences, including a large chromosomal inversion and extensive variation in the number and distribution of insertion sequence elements. Genome sequence analysis elucidates many of the novel aspects of leptospiral physiology relating to energy metabolism, oxygen tolerance, two-component signal transduction systems, and mechanisms of pathogenesis. A broad array of transcriptional regulation proteins and two new families of afimbrial adhesins which contribute to host tissue colonization in the early steps of infection were identified. Differences in genes involved in the biosynthesis of lipopolysaccharide O side chains between the Copenhageni and Lai serovars were identified, offering an important starting point for the elucidation of the organism's complex polysaccharide surface antigens. Differences in adhesins and in lipopolysaccharide might be associated with the adaptation of serovars Copenhageni and Lai to different animal hosts. Hundreds of genes encoding surface-exposed lipoproteins and transmembrane outer membrane proteins were identified as candidates for development of vaccines for the prevention of leptospirosis.

The red algal order Bangiales has been revised as a result of detailed regional studies and the development of expert local knowledge of Bangiales floras, followed by collaborative global analyses based on wide taxon sampling and molecular analyses. Combined analyses of the nuclear SSU rRNA gene and the plastid RUBISCO LSU ( rbc L) gene for 157 Bangiales taxa have been conducted. Fifteen genera of Bangiales, seven filamentous and eight foliose, are recognized. This classification includes five newly described and two resurrected genera. This revision constitutes a major change in understanding relationships and evolution in this order. The genus Porphyra is now restricted to five described species and a number of undescribed species. Other foliose taxa previously placed in Porphyra are now recognized to belong to the genera Boreophyllum gen. nov., Clymene gen. nov., Fuscifolium gen. nov., Lysithea gen. nov., Miuraea gen. nov., Pyropia , and Wildemania . Four of the seven filamentous genera recognized in our analyses already have generic names ( Bangia , Dione , Minerva , and Pseudobangia ), and are all currently monotypic. The unnamed filamentous genera are clearly composed of multiple species, and few of these species have names. Further research is required: the genus to which the marine taxon Bangia fuscopurpurea belongs is not known, and there are also a large number of species previously described as Porphyra for which nuclear SSU ribosomal RNA (nrSSU) or rbc L sequence data should be obtained so that they can be assigned to the appropriate genus.

ABSTRACT Macroalgal (seaweed) genomic resources are generally lacking as compared to other eukaryotic taxa, and this is particularly true in the red algae (Rhodophyta). Understanding red algal genomes is critical to understanding eukaryotic evolution given that red algal genes are spread across eukaryotic lineages from secondary endosymbiosis and red algae diverged early in the Archaeplastids. The Gracilariales are highly diverse and widely distributed order whose species can serve as ecosystem engineers in intertidal habitats, including several notorious introduced species. The genus Gracilaria is cultivated worldwide, in part for its production of agar and other bioactive compounds with downstream pharmaceutical and industrial applications. This genus is also emerging as a model for algal evolutionary ecology. Here, we report new whole genome assemblies for two species ( G. chilensis and G. gracilis ), a draft genome assembly of G. caudata , and genome annotation of the previously published G. vermiculophylla genome. To facilitate accessibility and comparative analysis, we integrated these data in a newly created web-based portal dedicated to red algal genomics ( https://rhodoexplorer.sb-roscoff.fr ). These genomes will provide a resource for understanding algal biology and, more broadly, eukaryotic evolution.

As doenças inflamatórias intestinais (DIIs), incluindo a doença de Crohn e a retocolite ulcerativa, são condições crônicas caracterizadas por inflamação persistente do trato gastrointestinal, com impacto significativo na qualidade de vida dos pacientes. Este estudo teve como objetivo revisar criticamente a literatura sobre o papel da nutrição no manejo das DIIs, explorando intervenções dietéticas específicas, nutrientes imunomoduladores e estratégias nutricionais personalizadas. A metodologia consistiu em uma revisão integrativa de literatura, abrangendo artigos publicados entre 2013 e 2023, obtidos de bases de dados como PubMed, Scopus, Web of Science e LILACS. Foram incluídos estudos que investigaram o impacto de dietas específicas, como a nutrição enteral exclusiva e a dieta pobre em FODMAPs, bem como a suplementação de nutrientes, como ômega-3, vitamina D e compostos bioativos. Os resultados mostraram que intervenções nutricionais podem modular a inflamação e o microbioma intestinal, promovendo remissão clínica e melhorando desfechos clínicos. No entanto, a adesão às dietas, o custo elevado de algumas intervenções e a falta de diretrizes clínicas padronizadas são desafios significativos. A personalização das estratégias nutricionais, aliada à integração de nutricionistas em equipes multidisciplinares, mostrou-se essencial para superar essas barreiras. Ensaios clínicos robustos e estudos de longo prazo são necessários para validar a eficácia das intervenções nutricionais e orientar a prática clínica. Em conclusão, a nutrição representa uma ferramenta promissora e complementar no manejo das DIIs, com potencial para reduzir a inflamação, otimizar o estado nutricional e melhorar a qualidade de vida dos pacientes.