IP
Irina Polejaeva
Author with expertise in Transgenic Animal Research
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(67% Open Access)
Cited by:
3,201
h-index:
23
/
i10-index:
41
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

Chromatin Reprogramming of In Vitro Fertilized and Somatic Cell Nuclear Transfer Bovine Embryos During Embryonic Genome Activation

Edward Grow et al.Apr 11, 2023
Reprogramming of the gamete into a developmentally competent embryo identity is a fundamental aspect of preimplantation development. One of the most important processes of this reprogramming is the transcriptional awakening during embryonic genome activation (EGA), which robustly occurs in fertilized embryos but is defective in most somatic cell nuclear transfer (SCNT) embryos. However, little is known about the genome-wide underlying chromatin landscape during EGA in SCNT embryos and how it differs from a fertilized embryo. By profiling open chromatin genome-wide in both types of bovine embryos, we find that SCNT embryos fail to reprogram a subset of the EGA gene targets that are normally activated in fertilized embryos. Importantly, a small number of transcription factor (TF) motifs explain most chromatin regions that fail to open in SCNT embryos suggesting that over-expression of a limited number of TFs may provide more robust reprogramming. One such TF, the zygotically-expressed bovine gene DUXC which is a homologue of EGA factors DUX/DUX4 in mouse/human, is alone capable of activating âˆ¼84% of all EGA transcripts that fail to activate normally in SCNT embryos. Additionally, single-cell chromatin profiling revealed low intra-embryo heterogeneity but high inter-embryo heterogeneity in SCNT embryos and an uncoupling of cell division and open chromatin reprogramming during EGA. Surprisingly, our data also indicate that transcriptional defects may arise downstream of promoter chromatin opening in SCNT embryos, suggesting additional mechanistic insights into how and why transcription at EGA is dysregulated. We anticipate that our work will lead to altered SCNT protocols to increase the developmental competency of bovine SCNT embryos.
1
Citation1
0
Save
0

Cytokine-Supplemented Maturation Medium Enhances Cytoplasmic and Nuclear Maturation in Bovine Oocytes

R. Blocher et al.Jun 20, 2024
Bovine in vitro oocyte maturation (IVM) is an easy way to obtain oocytes for subsequent assisted reproductive techniques but is inefficient compared to in vivo maturation. Supplementation of three cytokines, fibroblast growth factor 2 (FGF2), leukemia inhibitory factor (LIF), and insulin-like growth factor 1 (IGF1), or FLI, has increased oocyte maturation and embryo development in multiple species, but studies have not explored the oocyte differences caused by FLI IVM supplementation. This study aimed to assess important nuclear and cytoplasmic maturation events in high-quality oocytes. FLI-supplemented oocytes had a decreased GV (3.0% vs. 13.7%, p < 0.01) and increased telophase I incidence (34.6% vs. 17.6%, p < 0.05) after IVM, increased normal meiotic spindles (68.8% vs. 50.0%, p < 0.001), and an increased nuclear maturation rate (75.1% vs. 66.8%, p < 0.001). Moreover, in metaphase II oocytes, the percentage of FLI-treated oocytes with a diffuse mitochondrial distribution was higher (87.7% vs. 77.5%, p < 0.05) and with a cortical mitochondrial distribution was lower (11.6% vs. 17.4%, p < 0.05). Additionally, FLI-supplemented oocytes had more pattern I cortical granules (21.3% vs. 14.4%, p < 0.05). These data suggest that FLI supplementation in bovine in vitro maturation medium coordinates nuclear and cytoplasmic maturation to produce higher-quality oocytes.