SK
Sahil Khanna
Author with expertise in Clostridium difficile Infection and Treatment
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
12
(58% Open Access)
Cited by:
873
h-index:
52
/
i10-index:
138
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

The Epidemiology of Community-Acquired Clostridium difficile Infection: A Population-Based Study

Sahil Khanna et al.Nov 22, 2011
OBJECTIVES: Clostridium difficileinfection (CDI) is a common hospital-acquired infection with increasing incidence, severity, recurrence, and associated morbidity and mortality. There are emerging data on the occurrence of CDI in nonhospitalized patients. However, there is a relative lack of community-based CDI studies, as most of the existing studies are hospital based, potentially influencing the results by referral or hospitalization bias by missing cases of community-acquired CDI. METHODS: To better understand the epidemiology of community-acquiredC. difficileinfection, a population-based study was conducted in Olmsted County, Minnesota, using the resources of the Rochester Epidemiology Project. Data regarding severity, treatment response, and outcomes were compared in community-acquired vs. hospital-acquired cohorts, and changes in these parameters, as well as in incidence, were assessed over the study period. RESULTS: Community-acquired CDI cases accounted for 41% of 385 definite CDI cases. The incidence of both community-acquired and hospital-acquired CDI increased significantly over the study period. Compared with those with hospital-acquired infection, patients with community-acquired infection were younger (median age 50 years compared with 72 years), more likely to be female (76% vs. 60%), had lower comorbidity scores, and were less likely to have severe infection (20% vs. 31%) or have been exposed to antibiotics (78% vs. 94%). There were no differences in the rates of complicated or recurrent infection in patients with community-acquired compared with hospital-acquired infection. CONCLUSIONS: In this population-based cohort, a significant proportion of cases of CDI occurred in the community. These patients were younger and had less severe infection than those with hospital-acquired infection. Thus, reports of CDI in hospitalized patients likely underestimate the burden of disease and overestimate severity.
0

A Novel Microbiome Therapeutic Increases Gut Microbial Diversity and Prevents RecurrentClostridium difficileInfection

Sahil Khanna et al.Feb 8, 2016
Patients with recurrent Clostridium difficile infection (CDI) have a ≥60% risk of relapse, as conventional therapies do not address the underlying gastrointestinal dysbiosis. This exploratory study evaluated the safety and efficacy of bacterial spores for preventing recurrent CDI.Stool specimens from healthy donors were treated with ethanol to eliminate pathogens. The resulting spores were fractionated and encapsulated for oral delivery as SER-109. Following their response to standard-of-care antibiotics, patients in cohort 1 were treated with SER-109 on 2 consecutive days (geometric mean dose, 1.7 × 10(9) spores), and those in cohort 2 were treated on 1 day (geometric mean dose, 1.1 × 10(8) spores). The primary efficacy end point was absence of C. difficile-positive diarrhea during an 8-week follow-up period. Microbiome alterations were assessed.Thirty patients (median age, 66.5 years; 67% female) were enrolled, and 26 (86.7%) met the primary efficacy end point. Three patients with early, self-limiting C. difficile-positive diarrhea did not require antibiotics and tested negative for C. difficile at 8 weeks; thus, 96.7% (29 of 30) achieved clinical resolution. In parallel, gut microbiota rapidly diversified, with durable engraftment of spores and no outgrowth of non-spore-forming bacteria found after SER-109 treatment. Adverse events included mild diarrhea, abdominal pain, and nausea.SER-109 successfully prevented CDI and had a favorable safety profile, supporting a novel microbiome-based intervention as a potential therapy for recurrent CDI.
0
Citation293
0
Save
1

EGFR-to-Src family tyrosine kinase switching in proliferating-DTP TNBC cells creates a hyperphosphorylation-dependent vulnerability to EGFR TKI

Nazia Chaudhary et al.Jul 19, 2023
ABSTRACT Triple-Negative Breast Cancer (TNBC) is the most aggressive type of breast malignancy, with chemotherapy as the only mainstay treatment. TNBC patients have the worst prognoses as a large fraction of them do not achieve complete pathological response post-treatment and develop drug-resistant residual disease. Molecular mechanisms that trigger proliferation in drug-resistant chemo-residual TNBC cells are poorly understood due to the lack of investigations using clinically relevant cellular models. In this study, we have established TNBC subtype-specific cellular models of proliferating drug-tolerant persister (PDTP) cells using different classes of chemotherapeutic agents that recapitulate clinical residual disease with molecular heterogeneity. Analysis of total phospho-tyrosine signals in TNBC PDTPs showed an enhanced phospho-tyrosine content compared to the parental cells (PC). Interestingly, using mass-spectrometry analysis, we identified a dramatic decrease in epidermal growth factor receptor (EGFR) expression in the PDTPs, while the presence of hyper-activated tyrosine phosphorylation of EGFR compared to PC. Further, we show that EGFR has enhanced lysosomal trafficking in PDTPs with a concomitant increase in N-Myc Downstream Regulated-1 expression that co-localizes with EGFR to mediate receptor degradation. More surprisingly, we found that reduced protein levels of EGFR are coupled with a robust increase in Src family kinases, including Lyn and Fyn kinases, that creates a hyper-phosphorylation state of EGFR-Src tyrosine kinases axis in PDTPs and mediates downstream over-activation of STAT3, AKT and MAP kinases. Moreover, paclitaxel-derived PDTPs show increased sensitivity to EGFR TKI Gefitinib and its combination with paclitaxel selectively induced cell death in PDTP-P TNBC cells and 3D spheroids by strongly downregulating phosphorylation of EGFR-Src with concomitant downregulation of Lyn and Fyn tyrosine kinases. Collectively, this study identifies a unique hyper-phosphorylation cellular state of TNBC PDTPs established by switching of EGFR–Src family tyrosine kinases creating a vulnerability to EGFR TKI.
1

GPX4-VIM equates a proliferating DTP state in TNBC subtypes with converged vulnerabilities to autophagy and glutathione inhibition

Nazia Chaudhary et al.May 22, 2023
ABSTRACT Frequent metastatic relapses in Triple-Negative Breast Cancer (TNBC) patients with residual disease is a clinical challenge, largely due to tumor heterogeneity and absence of strategies that target proliferating chemo-tolerant cells. Here, we longitudinally modeled cellular state transitions from dormant drug-tolerant persister (DTP) into proliferating drug-tolerant persister (PDTP) in cells representing all TNBC subtypes. Combining subcellular imaging with phenotypic and biochemical assays, we identified distinct and converged spectrums of alterations in TNBC-PDTPs. We show that PDTPs retain acquired resistance with increased invasion potential. Moreover, Basal-Like DTPs enter into a non-reversible mesenchymal state while luminal androgen receptor-positive gain partial-Epithelial-to-Mesenchymal Transition (EMT) with vimentin upregulation. PDTP state dwells on high autophagy with reduced glutathione and GPX4 levels, rendering it vulnerable to autophagy suppression and ferroptosis. Interestingly, we find that GPX4 negatively regulates EMT and autophagy in TNBC, and an inverse correlation of GPX4-VIM expression along with autophagy genes predicts survival in TNBC patients undergoing chemotherapy.
Load More