SP
Shamsul Prodhan
Author with expertise in Molecular Responses to Abiotic Stress in Plants
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(100% Open Access)
Cited by:
1
h-index:
11
/
i10-index:
15
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
3

Identification, characterization of Apyrase (APY) gene family in rice (Oryza sativa) and analysis of the expression pattern under various stress conditions

Aniqua Chowdhury et al.Aug 15, 2022
Abstract Apyrase ( APY ) is a nucleoside triphosphate (NTP) diphosphohydrolase (NTPDase) which is a member of the superfamily of guanosine diphosphatase 1 (GDA1) - cluster of differentiation 39 (CD39) nucleoside phosphatase. Under various circumstances like stress, cell growth, the extracellular adenosine triphosphate (eATP) level increases, causing a detrimental influence on cells such as cell growth retardation, ROS production, NO burst, and apoptosis. Apyrase hydrolyses eATP accumulated in the extracellular membrane during stress, wounds, into adenosine diphosphate (ADP) and adenosine monophosphate (AMP) and regulates the stress- responsive pathway in plants. This study was designed for the identification, characterization, and for analysis of APY gene expression in Oryza sativa . This investigation discovered nine APY s in rice, including both endo- and ecto-apyrase. According to duplication event analysis, in the evolution of OsAPY s, a significant role is performed by segmental duplication. Their role in stress control, hormonal responsiveness, and the development of cells is supported by the corresponding cis-elements present in their promoter regions. According to expression profiling by RNA-seq data, the genes were expressed in various tissues. Upon exposure to a variety of biotic as well as abiotic stimuli, including anoxia, drought, submergence, alkali, heat, dehydration, salt, and cold, they showed a differential expression pattern. The expression analysis from the RT-qPCR data also showed expression under various abiotic stress conditions, comprising cold, salinity, cadmium, drought, submergence, and especially heat stress. This finding will pave the way for future in-vivo analysis, unveil the molecular mechanisms of APY genes in stress response, and contribute to the development of stress- tolerant rice varieties.
3
Citation1
0
Save
1

Morpho-physiobiochemical dissection reveals insight into salt-induced differential responses in genetically modified Solanum melongena L. (Bt Brinjal) varieties using an indigenous hydroponic system

Mahdi Hasan et al.May 24, 2023
Abstract Salinity is a major abiotic constraint of crop production in many countries, including Bangladesh, where a significant amount of cultivable areas are diversely affected by rising salt concentrations. Therefore, it is of paramount importance to figure out the possible solutions to cope with this abiotic stress. So, the development of tolerant genotypes of various crop species can be the best alternative to enhance crop production as well as to improve the livelihoods of poor marginal farmers. With this in mind, the impact of different NaCl levels (50 mM, 100 mM, and 150 mM) on four different Bt Brinjal (Bacillus thuringiensis) genotypes (BARI Bt Begun-1, BARI Bt Begun-2, BARI Bt Begun-3, and BARI Bt Begun-4) was evaluated using morpho-physicochemical analyses at growth, harvesting, and postharvest stages by establishing a new indigenous cost-effective hydroponic system. Our results show that excess salt (> 100 mM) has a detrimental effect on plant growth and development and most of the traits measured across different growth stages. Based on the different measured traits, BARI Bt Begun-1 and BARI Bt Begun-2 varieties outperformed in terms of better morpho-physiological, biochemical, photosynthetic, and antioxidant capacity under salt stress when compared to BARI Bt Begun-3 and BARI Bt Begun-4. Therefore, we conclude that BARI Bt Begun-1 and BARI Bt Begun-2 are moderately tolerant varieties, while BARI Bt Begun-3 and Begun-4 were susceptible varieties to salinity stress. The identified salt-responsive contrasting varieties can serve as valuable genetic materials in comparative genomics for breeding salt-tolerant Brinjal varieties and the newly established hydroponic system could be utilized in translational research programs.