Vascular endothelial cells regulate their cell cycle as blood vessels remodel and mature, and as they transition from active angiogenesis to quiescence. Mechanical cues provided by fluid shear stress orchestrate this transition, and laminar blood flow instigates a quiescent (G0) state and homeostasis. However, how flow-mediated quiescence is set up and maintained is poorly understood. We found that flow-mediated endothelial cell quiescence has unique properties and temporal regulation of quiescence depth. Flow-exposed endothelial cells had a distinct transcriptome, and quiescent endothelial cells re-entered the cell cycle more rapidly after extended flow exposure compared to contact inhibition, indicating a shallow quiescence depth. The cell cycle inhibitor CDKN1B (p27) was required for endothelial cell flow-mediated quiescence but was not significantly expressed after extended flow exposure. Rather, flow-exposed endothelial cells first established a deep quiescence that subsequently became shallow, and p27 levels positively correlated with these distinct quiescent states. HES1 and ID3, transcriptional repressors of p27 downstream of flow-regulated Notch and BMP signaling, were required for flow-mediated quiescence depth changes and the reduced p27 levels associated with shallow quiescence. These findings are consistent with a model whereby flow-mediated endothelial cell quiescence depth is temporally regulated downstream of transcriptional regulation of p27.

Cell cycle regulation is critical to blood vessel formation and function, but how the endothelial cell cycle integrates with vascular regulation is not well-understood, and available dynamic cell cycle reporters do not precisely distinguish all cell cycle stage transitions in vivo. Here we characterized a recently developed improved cell cycle reporter (PIP-FUCCI) that precisely delineates S phase and the S/G2 transition. Live image analysis of primary endothelial cells revealed predicted temporal changes and well-defined stage transitions. A new inducible mouse cell cycle reporter allele was selectively expressed in postnatal retinal endothelial cells upon Cre-mediated activation and predicted endothelial cell cycle status. We developed a semi-automated zonation program to define endothelial cell cycle status in spatially defined and developmentally distinct retinal areas and found predicted cell cycle stage differences in arteries, veins, and remodeled and angiogenic capillaries. Surprisingly, the predicted dearth of S-phase proliferative tip cells relative to stalk cells at the vascular front was accompanied by an unexpected enrichment for endothelial tip and stalk cells in G2, suggesting G2 stalling as a contribution to tip-cell arrest and dynamics at the front. Thus, this improved reporter precisely defines endothelial cell cycle status in vivo and reveals novel G2 regulation that may contribute to unique aspects of blood vessel network expansion.