AT
Ai Tan
Author with expertise in Analysis of Brain Functional Connectivity Networks
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(71% Open Access)
Cited by:
6
h-index:
12
/
i10-index:
15
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

In vivo whole-cortex marker of excitation-inhibition ratio indexes cortical maturation and cognitive ability in youth

Shaoshi Zhang et al.May 30, 2024
A balanced excitation-inhibition ratio (E/I ratio) is critical for healthy brain function. Normative development of cortex-wide E/I ratio remains unknown. Here, we noninvasively estimate a putative marker of whole-cortex E/I ratio by fitting a large-scale biophysically plausible circuit model to resting-state functional MRI (fMRI) data. We first confirm that our model generates realistic brain dynamics in the Human Connectome Project. Next, we show that the estimated E/I ratio marker is sensitive to the gamma-aminobutyric acid (GABA) agonist benzodiazepine alprazolam during fMRI. Alprazolam-induced E/I changes are spatially consistent with positron emission tomography measurement of benzodiazepine receptor density. We then investigate the relationship between the E/I ratio marker and neurodevelopment. We find that the E/I ratio marker declines heterogeneously across the cerebral cortex during youth, with the greatest reduction occurring in sensorimotor systems relative to association systems. Importantly, among children with the same chronological age, a lower E/I ratio marker (especially in the association cortex) is linked to better cognitive performance. This result is replicated across North American (8.2 to 23.0 y old) and Asian (7.2 to 7.9 y old) cohorts, suggesting that a more mature E/I ratio indexes improved cognition during normative development. Overall, our findings open the door to studying how disrupted E/I trajectories may lead to cognitive dysfunction in psychopathology that emerges during youth.
1

In-vivo whole-cortex estimation of excitation-inhibition ratio indexes cortical maturation and cognitive ability in youth

Shaoshi Zhang et al.Jun 22, 2023
A balanced excitation-inhibition ratio (E/I ratio) is critical for healthy brain function. Normative development of cortex-wide E/I ratio remains unknown. Here we non-invasively estimate a putative marker of whole-cortex E/I ratio by fitting a large-scale biophysically-plausible circuit model to resting-state functional MRI (fMRI) data. We first confirm that our model generates realistic brain dynamics in the Human Connectome Project. Next, we show that the estimated E/I ratio marker is sensitive to the GABA-agonist benzodiazepine alprazolam during fMRI. Alprazolam-induced E/I changes are spatially consistent with positron emission tomography measurement of benzodiazepine receptor density. We then investigate the relationship between the E/I ratio marker and neurodevelopment. We find that the E/I ratio marker declines heterogeneously across the cerebral cortex during youth, with the greatest reduction occurring in sensorimotor systems relative to association systems. Importantly, among children with the same chronological age, a lower E/I ratio marker (especially in association cortex) is linked to better cognitive performance. This result is replicated across North American (8.2 to 23.0 years old) and Asian (7.2 to 7.9 years old) cohorts, suggesting that a more mature E/I ratio indexes improved cognition during normative development. Overall, our findings open the door to studying how disrupted E/I trajectories may lead to cognitive dysfunction in psychopathology that emerges during youth.
1
Citation1
0
Save
27

Homotopic local-global parcellation of the human cerebral cortex from resting-state functional connectivity

Xiaoxuan Yan et al.Oct 27, 2022
Abstract Resting-state fMRI is commonly used to derive brain parcellations, which are widely used for dimensionality reduction and interpreting human neuroscience studies. We previously developed a model that integrates local and global approaches for estimating areal-level cortical parcellations. The resulting local-global parcellations are often referred to as the Schaefer parcellations. However, the lack of homotopic correspondence between left and right Schaefer parcels has limited their use for brain lateralization studies. Here, we extend our previous model to derive homotopic areal-level parcellations. Using resting-fMRI and task-fMRI across diverse scanners, acquisition protocols, preprocessing and demographics, we show that the resulting homotopic parcellations are as homogeneous as the Schaefer parcellations, while being more homogeneous than five publicly available parcellations. Furthermore, weaker correlations between homotopic parcels are associated with greater lateralization in resting network organization, as well as lateralization in language and motor task activation. Finally, the homotopic parcellations agree with the boundaries of a number of cortical areas estimated from histology and visuotopic fMRI, while capturing sub-areal (e.g., somatotopic and visuotopic) features. Overall, these results suggest that the homotopic local- global parcellations represent neurobiologically meaningful subdivisions of the human cerebral cortex and will be a useful resource for future studies. Multi-resolution parcellations estimated from 1479 participants are publicly available (GITHUB_LINK).
0

Investigating the validity and interpretability of longitudinal brain age underlying cognition in Asian children and older adults

Shu-Huei Cheng et al.Jan 1, 2023
Brain age has emerged as a powerful tool to understand neuroanatomical aging and its link to health outcomes like cognition. However, most brain age models are trained and tested on cross-sectional data from primarily Caucasian, adult participants. It is thus unclear how well these models generalize to non-Caucasian participants, especially children. Furthermore, there is a lack of studies investigating the longitudinal change in brain age gap and its relationship to cognition. Here, we tested a previously published deep learning model on Singaporean elderly participants (55-88 years old) and children (4-11 years old). We found that the model directly generalized to the elderly participants, but model finetuning was necessary for children. After finetuning, we found that the longitudinal change in brain age gap was associated with future executive function performance in both elderly participants and children. We further found that lateral ventricles and frontal areas contributed to brain age prediction in elderly participants, while white matter and posterior brain regions were more important in predicting brain age of children. Taken together, our results suggest that there is potential for generalizing brain age models to diverse populations. Moreover, the longitudinal change in brain age gap reflects developing and aging processes in the brain, relating to future cognitive function.
0

Subregion‐specific thalamocortical functional connectivity, executive function, and social behavior in children with autism spectrum disorders

Jasmine Chuah et al.Dec 5, 2024
Abstract The thalamus has extensive cortical connections and is an integrative hub for cognitive functions governing social behavior. This study examined (1) associations between thalamocortical resting‐state functional connectivity (RSFC) and social behavior in children and (2) how various executive function (EF) subdomains mediate the association between thalamocortical RSFC and social behavior. Children from the autism brain imaging data exchange (ABIDE) initiative with neuroimaging, behavioral, and demographic data were included in our study (age < 14, ASD; n = 207, typically developing; n = 259). Thalamocortical RSFC was examined for associations with social communication and interaction (SCI) scores (SRS; social responsiveness scale) using Spearman's rank‐order correlation, first in ASD children and then in typically developing children. This was followed by a more granular analysis at the thalamic subregion level. We then examined the mediating roles of eight EF subdomains in ASD children ( n = 139). Right thalamus‐default mode network (DMN) RSFC was significantly associated with SCI scores in ASD children ( ρ = 0.23, p FDR = 0.012), primarily driven by the medial ( ρ = 0.22, p FDR = 0.013), ventral ( ρ = 0.17, p FDR = 0.036), and intralaminar ( ρ = 0.17, p FDR = 0.036) thalamic subregions. Cognitive flexibility (ACME = 0.13, p unc = 0.016) and emotional control (ACME = 0.08, p unc = 0.020) significantly mediated the association between right thalamus‐DMN RSFC and SCI scores. This study provided novel insights into the association between thalamocortical RSFC and social behavior in ASD children at the thalamic subregion level, providing higher levels of precision in brain‐behavior mapping. Cognitive flexibility and emotion regulation were highlighted as potential targets to ameliorate the downstream effects of altered thalamocortical connectivity to improve social outcomes in ASD children.
0

Social Behavior in ASD Males: The Interplay between Cognitive Flexibility, Working Memory, and Functional Connectivity Deviations

Shi Chan et al.Nov 25, 2024
Autism spectrum disorder (ASD) is highly heterogeneous in presentation. While abnormalities in brain functional connectivity are consistently observed in autistic males, the neurobiological basis underlying the different domains of autism symptoms is unclear. In this study, we evaluated whether individual variations in functional connectivity deviations map to social behavior in ASD males. Using neuroimaging data from the Autism Brain Imaging Data Exchange (ABIDE), we modeled normative trajectories of between-network resting-state functional connectivity (rsFC) in non-ASD males across childhood (n = 321). These normative charts were then applied to ASD males (n = 418) to calculate individual deviation scores (z-scores) that reflect the degree of rsFC atypicality. Deviations in rsFC patterns among the default mode network (DMN), ventral attention network (VAN), frontoparietal network (FPN), and somatomotor network (SMN) were associated with distinct dimensions of social behavior. Cognitive flexibility and working memory mediated the association between VANxDMN z-scores and social behavioral problems. Our findings underscore the potential of normative models to identify atypical brain connectivity at an individual level, revealing the neurobiological patterns associated with social behavioral problems in ASD that are critical for precision diagnosis and intervention. Social outcomes in ASD males may be improved by targeting cognitive flexibility and working memory.