Abstract Systematic assessments of species extinction risk at regular intervals are necessary for informing conservation action 1,2 . Ongoing developments in taxonomy, threatening processes and research further underscore the need for reassessment 3,4 . Here we report the findings of the second Global Amphibian Assessment, evaluating 8,011 species for the International Union for Conservation of Nature Red List of Threatened Species. We find that amphibians are the most threatened vertebrate class (40.7% of species are globally threatened). The updated Red List Index shows that the status of amphibians is deteriorating globally, particularly for salamanders and in the Neotropics. Disease and habitat loss drove 91% of status deteriorations between 1980 and 2004. Ongoing and projected climate change effects are now of increasing concern, driving 39% of status deteriorations since 2004, followed by habitat loss (37%). Although signs of species recoveries incentivize immediate conservation action, scaled-up investment is urgently needed to reverse the current trends.

Abstract Exploitation of different locomotor substrates in different ecological niches has driven the evolution of specialized morphological structures, and similar ecological demands, such as the structure of the microhabitat, often lead to convergent or parallel evolution. The evolution of adhesive toepads in geckos remains understudied because of the paucity of phylogenetically‐informed investigations of candidate clades exhibiting purported incipient expression of these (i.e. species having evolved some, but not all, parts of the complex adhesive system of pad‐bearing geckos). Using Cyrtodactylus , a speciose genus with well‐established ecotypes, we tested the hypothesis that microhabitats that require more climbing will lead to the acquisition of incipient adhesive morphology. We measured subdigital scale area, a proxy for adhesive toepad evolution, and quantified subdigital scale shape for 77 of the 354 described species, including at least one representative of each ecotype. Subdigital scale area increased from terrestrial through generalist and saxicoline (rock‐dwelling) to arboreal ecotypes, with subdigital scale shape evolving from ancestral conditions for padless lizards to lateromedially expanded lamella‐like scales only in the arboreal ecotypes. This significant link between phenotype and environment supports the contention that scansorial, and particularly arboreal, Cyrtodactylus ecotypes have evolved incipiently expressed adhesive toepads. This highlights the suitability of this genus as a model system for studying the ecology and evolution of adhesive toepads as well as being a promising candidate for research on adaptive radiations. Read the free Plain Language Summary for this article on the Journal blog.

We describe a new species of the genus Scincella Mittleman, 1950 from northwestern Vietnam, based on a new collection of ground skinks from Mount Fansipan of the Hoang Lien Son Range in Lao Cai Province. Scincella fansipanensis sp. nov. is distinguished from other Scincella species in the Indochina region and southern China by body size (SVL), separation of prefrontals, number of midbody scale rows, paravertebral scale rows, nuchals and subdigital lamellae on toe IV, separation of toe from finger when limbs are adpressed along the body, and dorsal color pattern. The new species is further distinguished from its congeners by uncorrected genetic distances of 14.60–21.41% (COI gene). The new species is currently known only from high elevation areas of Mt. Fansipan in Vietnam.

Thanh Hoa Province is located in North Central Vietnam and the Province contains a large area of 393,361.33 hectares of natural forest. A complexity of landforms has given this Province a high level of biodiversity potential. However, the reptile fauna of Thanh Hoa Province is still underestimated. Previous studies documented 111 species of reptiles from this Province. As a result of our field surveys in Pu Luong and Xuan Lien Nature Reserves, we report five species of reptiles for the first time from Thanh Hoa Province, Vietnam, namely Plestiodon tamdaoensis , Scincella devorator (Scincidae), Elaphe taeniura , Pareas macularius and Pseudoxenodon macrops (Colubridae), with novel data about morphological characteristics. In addition, we provide an updated checklist of 116 species of reptiles from Thanh Hoa Province. The reptile fauna of Thanh Hoa Province also contains a number of species of conservation concern: 22 species listed in the Red Data Book of Vietnam, 22 species listed in the IUCN Red List, 18 species listed in the Vietnam Governmental Decree No. 84; and 21 species listed in CITES appendices.

Abstract Background Vietnam harbours a high species richness of venomous snakes with >60 recognised species but snakebite pathology and treatment are still understudied, particularly in northern Vietnam. Methods A retrospective study from 2008 to 2020 was conducted, focusing on snakebite cases at the Poison Control Center of Bach Mai Hospital, a major centre in northern Vietnam for treating envenoming incidents. Results A total of 5805 snakebite cases were reported over 12 y. The demography of patients was predominantly male snakebite victims (70%), middle-aged (30–59 y) and mostly from rural districts. Cobra (Naja spp.) attacks were the main culprit, accounting for 39% of cases, and most snakebites occurred in the rainy season. The majority of patients were from Hanoi, but the percentage of cases from other provinces increased over the years up to 75% in 2020. The highest number of snakebites were recorded from communes with snake farms. Conclusions Male gender, rainy season, rural residency and snake farming were identified as major risk factors for contracting snakebites. Multicentre hospital studies, cross-sectional community surveys and a central snakebite database are needed to better understand and deal with snakebites in Vietnam.

Abstract Although sex determination is ubiquitous in vertebrates, mechanisms of sex determination vary from environmentally-to genetically-influenced. In vertebrates, genetic sex determination is typically accomplished with sex chromosomes. Groups like mammals maintain conserved sex chromosome systems, while sex chromosomes in most vertebrate clades aren’t conserved across similar evolutionary timescales. One group inferred to have an evolutionarily stable mode of sex determination is Anguimorpha, a clade of charismatic taxa including: monitor lizards, Gila monsters, and crocodile lizards. The common ancestor of extant anguimorphs possessed a ZW system that has been retained across the clade. However, the sex chromosome system in the endangered, monotypic family of crocodile lizards (Shinisauridae) has remained elusive. Here, we analyze genomic data to demonstrate that Shinisaurus has replaced the ancestral anguimorph ZW system on LG7 chromosome with a novel ZW system on LG3. The linkage group LG3 corresponds to chromosome 9 in chicken, and this is the first documented use of this syntenic block as a sex chromosome in amniotes. Additionally, this ∼1Mb region harbors approximately 10 genes, including a duplication of the sex-determining transcription factor, Foxl2 —critical for the determination and maintenance of sexual differentiation in vertebrates, and thus a putative primary sex determining gene for Shinisaurus .

Based on morphological and molecular evidences, we describe a new species of Microhyla (Nanohyla) from Deo Ca Mountain in Vietnam. The new species differs from congeners by high genetic divergences in 12S rRNA and 16S rRNA sequences (9.31–11.28 %), surpassing known genetic distances between other recognized species of the subgenus Nanohyla. The new species revealed to be sister to M. nanapollexa from Kon Tum Province, Vietnam. Based on new findings of the latter species, including the first known males, we provide an extended diagnosis of M. nanapollexa including the first record from Kon Tum Province, Vietnam.

Head motion is a significant source of artifacts in resting-state fMRI (rsfMRI) studies and has been shown to affect resting-state functional connectivity (rsFC) measurements. In many rsfMRI studies, motion parameters estimated from volume registration are used to characterize head motion and to mitigate motion artifacts in rsfMRI data. While prior task-based fMRI studies have shown that task-evoked brain activations may induce temporally correlated bias in the motion estimates, resulting in artificial activations after registration, relatively little is known about neural-related bias in rsfMRI motion parameters. In this study, we demonstrate that neural-related bias exists in rsfMRI motion estimates and characterize the potential effects of the bias on rsFC estimates. Using a public multi-echo rsfMRI dataset, we use the differences between motion estimates from the first echo and second echo data as a measure of neural-induced bias. We show that the resting-state global activity of the brain, as characterized with the global signal (GS), induces bias in the motion estimates in the y- and z-translational axes. Furthermore, we demonstrate that the GS-related bias reflects superior-inferior and anterior-posterior asymmetries in the GS beta coefficient map. Finally, we demonstrate that regression with biased motion estimates can negatively bias rsFC estimates and reduce rsFC differences between young and old subjects.