MK
Mika Kaakinen
Author with expertise in Mechanosensitive Ion Channels in Physiology and Disease
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(100% Open Access)
Cited by:
210
h-index:
16
/
i10-index:
25
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
5

Characterization of nucleic acids from extracellular vesicle-enriched human sweat

Geneviève Bart et al.Jun 9, 2021
Abstract Background The human sweat is a mixture of secretions from three types of glands: eccrine, apocrine, and sebaceous. Eccrine glands open directly on the skin surface and produce high amounts of water-based fluid in response to heat, emotion, and physical activity, whereas the other glands produce oily fluids and waxy sebum. While most body fluids have been shown to contain nucleic acids, both as ribonucleoprotein complexes and associated with extracellular vesicles (EVs), these have not been investigated in sweat. In this study we aimed to explore and characterize the nucleic acids associated with sweat particles. Results We used next generation sequencing (NGS) to characterize DNA and RNA in pooled and individual samples of EV-enriched sweat collected from volunteers performing rigorous exercise. In all sequenced samples, we identified DNA originating from all human chromosomes, but only the mitochondrial chromosome was highly represented with 100% coverage. Most of the DNA mapped to unannotated regions of the human genome with some regions highly represented in all samples. Approximately 5 % of the reads were found to map to other genomes: including bacteria (83%), archaea (3%), and virus (13%), identified bacteria species were consistent with those commonly colonizing the human upper body and arm skin. Small RNA-seq from EV-enriched pooled sweat RNA resulted in 74% of the trimmed reads mapped to the human genome, with 29% corresponding to unannotated regions. Over 70% of the RNA reads mapping to an annotated region were tRNA, while misc. RNA (18,5%), protein coding RNA (5%) and miRNA (1,85%) were much less represented. RNA-seq from individually processed EV-enriched sweat collection generally resulted in fewer percentage of reads mapping to the human genome (7–45%), with 50–60% of those reads mapping to unannotated region of the genome and 30–55% being tRNAs, and lower percentage of reads being rRNA, LincRNA, misc. RNA, and protein coding RNA. Conclusions Our data demonstrates that sweat, as all other body fluids, contains a wealth of nucleic acids, including DNA and RNA of human and microbial origin, opening a possibility to investigate sweat as a source for biomarkers for specific health parameters.
5
Citation24
1
Save
1

Blood pressure lowering enhances cerebrospinal fluid efflux primarily via the lymphatic vasculature

Jari Jukkola et al.Jul 12, 2023
Abstract Background Inside the incompressible cranium, the volume of cerebrospinal fluid (CSF) is directly linked to blood volume: a change in either will induce a compensatory change in the other. Vasodilatory lowering of blood pressure has been shown to result in an increase of intracranial pressure, which, in normal circumstances should return to equilibrium by increased fluid efflux. In this study, we investigated the effect of blood pressure lowering (BPL) on fluorescent CSF tracer absorption into the systemic blood circulation. Methods BPL was performed by an i.v. administration of nitric oxide donor sodium nitroprusside (5 µg kg -1 min -1 ) or the Ca 2+ -channel blocker nicardipine hydrochloride (0.5 µg kg -1 min -1 ) for 10 and 15 to 40 mins, respectively. The effect of BPL on CSF clearance was investigated by measuring the efflux of fluorescent tracers (40 kDa FITC-dextran, 45 kDa Texas Red-conjugated ovalbumin) into blood and deep cervical lymph nodes. Results Nicardipine and sodium nitroprusside reduced blood pressure by 32.0 ± 19.6% and 22.0 ± 2.5%, while temporarily elevating in intracranial pressure by 14.0 ± 6.0% and 11.6 ± 2.0%, respectively. BPL significantly increased tracer accumulation into deep cervical lymph nodes and systemic circulation, but reduced perivascular inflow along penetrating arteries in the brain. The enhanced tracer efflux by BPL into the systemic circulation was markedly reduced (-66.7%) by ligation of lymphatic vessels draining into deep cervical lymph nodes. Conclusions This is the first study showing that CSF clearance can be improved with acute hypotensive treatment and that the effect of the treatment is reduced by ligation of a lymphatic drainage pathway. Enhanced CSF clearance by BPL may have therapeutic potential in diseases with dysregulated CSF flow.