WB
Wesley Baker
Author with expertise in Biomedical Optical Imaging and Spectroscopy
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
12
(33% Open Access)
Cited by:
1,242
h-index:
28
/
i10-index:
40
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Chassis-based fiber-coupled optical probe design for reproducible quantitative diffuse optical spectroscopy measurements

Giselle Matlis et al.Jul 25, 2024
Advanced optical neuromonitoring of cerebral hemodynamics with hybrid diffuse optical spectroscopy (DOS) and diffuse correlation spectroscopy (DCS) methods holds promise for non-invasive characterization of brain health in critically ill patients. However, the methods' fiber-coupled patient interfaces (probes) are challenging to apply in emergent clinical scenarios that require rapid and reproducible attachment to the head. To address this challenge, we developed a novel chassis-based optical probe design for DOS/DCS measurements and validated its measurement accuracy and reproducibility against conventional, manually held measurements of cerebral hemodynamics in pediatric swine (n = 20). The chassis-based probe design comprises a detachable fiber housing which snaps into a 3D-printed, circumferential chassis piece that is secured to the skin. To validate its reproducibility, eight measurement repetitions of cerebral tissue blood flow index (BFI), oxygen saturation (StO2), and oxy-, deoxy- and total hemoglobin concentration were acquired at the same demarcated measurement location for each pig. The probe was detached after each measurement. Of the eight measurements, four were acquired by placing the probe into a secured chassis, and four were visually aligned and manually held. We compared the absolute value and intra-subject coefficient of variation (CV) of chassis versus manual measurements. No significant differences were observed in either absolute value or CV between chassis and manual measurements (p > 0.05). However, the CV for BFI (mean ± SD: manual, 19.5% ± 9.6; chassis, 19.0% ± 10.8) was significantly higher than StO2 (manual, 5.8% ± 6.7; chassis, 6.6% ± 7.1) regardless of measurement methodology (p<0.001). The chassis-based DOS/DCS probe design facilitated rapid probe attachment/re-attachment and demonstrated comparable accuracy and reproducibility to conventional, manual alignment. In the future, this design may be adapted for clinical applications to allow for non-invasive monitoring of cerebral health during pediatric critical care.
1

A Template for Translational Bioinformatics: Facilitating Multimodal Data Analyses in Preclinical Models of Neurological Injury

Hunter Gaudio et al.Jul 19, 2023
Abstract Background Pediatric neurological injury and disease is a critical public health issue due to increasing rates of survival from primary injuries (e.g., cardiac arrest, traumatic brain injury) and a lack of monitoring technologies and therapeutics for the treatment of secondary neurological injury. Translational, preclinical research facilitates the development of solutions to address this growing issue but is hindered by a lack of available data frameworks and standards for the management, processing, and analysis of multimodal data sets. Methods Here, we present a generalizable data framework that was implemented for large animal research at the Children’s Hospital of Philadelphia to address this technological gap. The presented framework culminates in an interactive dashboard for exploratory analysis and filtered data set download. Results Compared with existing clinical and preclinical data management solutions, the presented framework accommodates heterogeneous data types (single measure, repeated measures, time series, and imaging), integrates data sets across various experimental models, and facilitates dynamic visualization of integrated data sets. We present a use case of this framework for predictive model development for intra-arrest prediction of cardiopulmonary resuscitation outcome. Conclusions The described preclinical data framework may serve as a template to aid in data management efforts in other translational research labs that generate heterogeneous data sets and require a dynamic platform that can easily evolve alongside their research.
Load More