YT
Yi Tao
Author with expertise in Evolution of Cooperation and Altruism in Social Systems
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
10
(50% Open Access)
Cited by:
265
h-index:
31
/
i10-index:
66
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

OsciDrop: A Versatile On-demand Droplet Generator

Shun Ye et al.Jun 15, 2021
ABSTRACT Droplet microfluidics is a powerful tool in many biological and clinical applications. Microfluidic chips, such as flow-focusing droplet generators, have been extensively used to high-throughput encapsulate reactions with single-cell and single-molecular resolutions. However, microfabrication is expensive and precision-demanding, preventing it from widespread use in biomedical laboratories and clinical facilities. Herein, we present a versatile chip-free droplet generator, OsciDrop, for generating size-tunable droplets on demand, with high uniformity. OsciDrop segments the fluid flowing out of the orifice of a micropipette tip into droplets by oscillating the tip under the surface of a continuous oil phase. We investigated the factors influencing droplet generation by examining several control parameters. Results show that flow rate, oscillating amplitude, and frequency are key parameters to generate monodisperse droplets on demand. And OsciDrop is able to generate droplets in a flexible and repeatable manner. Importantly, using an optimal asymmetrical oscillation waveform, OsciDrop can controllably generate monodisperse droplets spanning a wide volume range (200 pL - 2 μL). To demonstrate the ability of OsciDrop for chip-free droplet assays, a digital loop-mediated isothermal amplification (dLAMP) was performed to absolutely quantify African swine fever virus (ASFV). The OsciDrop method opens up a feasible and versatile avenue to perform droplet-based assays, exhibiting full accessibility for chip-free droplet microfluidics.
0

Gubra Amylin‐NASH Diet Induced Nonalcoholic Fatty Liver Disease Associated with Histological Damage, Oxidative Stress, Immune Disorders, Gut Microbiota, and Its Metabolic Dysbiosis in Colon

Zhimin Zhang et al.Jul 5, 2024
Scope The overall changes of colon under nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) remain to be further elucidated. Methods and Results This study establishes a mouse model of NAFLD through a long‐term Gubra Amylin‐nonalcoholic steatohepatitis (NASH) diet (GAN diet). The results show that GAN diet significantly induces weight gain, liver steatosis, colonic oxidative stress, and lipid accumulation in blood, liver, and adipose tissue in mice. GAN feeding reduces the diversity of the gut microbiota, alters the composition and abundance of the gut microbiota, and leads to an increase in microbial metabolites such as long‐chain fatty acids (LCFAs) and secondary bile acids (BAs), as well as a decrease in short‐chain fatty acids (SCFAs). The RNA‐seq and immunofluorescence results reveal that the GAN diet alters the expression of proteins and their coding genes involved in oxidative stress, immune response, and barrier function in colon tissue, such as lipocalin‐2 ( Lcn2 , p < 0.05), heme oxygenase‐1 ( HO‐1/Hmox1 , p < 0.05), interferon‐gamma ( IFN‐γ ), and claudin‐3/7 . In addition, correlation analysis indicates a strong correlation between the changes in gut microbiota and lipid biomarkers. Additionally, the expression of immune related genes in colon tissue is related to the LCFAs produced by microbial metabolism. Conclusion GAN‐induced NAFLD is related to microbiota and its metabolic imbalance, oxidative stress, immune disorders, and impaired barrier function in colon.
0

Spontaneously Blinkogenic Probe for Wash‐Free Single‐Molecule Localization‐Based Super‐Resolution Imaging in Living Cells

Qinglong Qiao et al.Nov 13, 2024
Single‐molecule localization super‐resolution fluorescence imaging relies on the fluorescence ON/OFF switching of fluorescent probes to break the diffraction limit. However, the unreacted or nonspecifically bound probes cause non‐targeted ON/OFF switching, resulting in substantial fluorescence background that significantly reduces localization precision and accuracy. Here, we report a blinkogenic probe HM‐DS655‐Halo that remains blinking OFF until it binds to HaloTag, thereby triggering its self‐blinking activity and enabling its application in direct SMLM imaging in living cells without wash‐out steps. We employed the ratio of the duty cycle before and after self‐blinking activation, termed as the parameter "RDC" to characterize blinkogenicity. The covalent binding to HaloTag induces HM‐DS655‐Halo to transition from a fluorescent OFF state to a fluorescence blinking state. This transition also leads to a change in the RDC value, which is calculated to be 12, ensuring super blinkogenicity to effectively suppress background signals in living cells. HM‐DS655‐Halo was successfully applied in dynamic SMLM imaging of diverse intracellular sub‐structures with minimal background noise, including mitochondrial fission and contact, cell migration, and pseudopod growth.
0

U-shaped association between the non-high-density lipoprotein cholesterol to high-density lipoprotein cholesterol ratio and mortality risk in obese adults: evidence from NHANES 1999–2018

Zi Lin et al.Jan 10, 2025
Background Obesity, often accompanied by dyslipidemia and increased cardiovascular risk, poses a significant threat to overall mortality. The non-high-density lipoprotein cholesterol to high-density lipoprotein cholesterol ratio (NHHR) has been identified as a valuable parameter for assessing dyslipidemia. The goal of the study was to elucidate the relationship between NHHR and mortality in obese populations. Methods Data for the study cohort were sourced from the National Health and Nutrition Examination Survey (1999–2018). The association between NHHR and mortality from all causes and cardiovascular disease was examined through multivariable Cox regression and restricted cubic splines (RCS). Segmented multivariable Cox regression and subgroup analyses were conducted when segmented effects were identified. The reliability of the results was confirmed through multiple sensitivity analyses. Results A total of 7,504 participants were included in the analysis. During a median follow-up of 119 months, 866 subjects died for all causes, of which 318 were related to cardiovascular diseases. A U-shaped association was found utilizing RCS analysis, with cardiovascular mortality and all-cause mortality exhibiting the lowest risk points at 3.409 and 3.369, respectively. The fully adjusted model revealed a negative relationship between the risk of cardiovascular mortality (HR = 0.68, 95% CI: 0.49–0.94) and all-cause mortality (HR = 0.82, 95% CI: 0.67–1.00) for per 1 mmol/L increase in NHHR levels below the cut-off value. On the other hand, above the cut-off point, NHHR was positively correlated with cardiovascular mortality (HR = 1.18, 95% CI: 1.02–1.36) and all-cause mortality (HR = 1.13, 95% CI: 1.01–1.28). The sensitivity results of this study were in accordance with earlier findings, and no significant interactions in NHHR levels were discovered across different subgroups. Conclusions In the obese adults, NHHR displayed a U-shaped relationship with cardiovascular and all-cause death. Monitoring and managing NHHR levels in obese population may help mitigate the risk of mortality.
0

Spontaneously Blinkogenic Probe for Wash‐Free Single‐Molecule Localization‐Based Super‐Resolution Imaging in Living Cells

Qinglong Qiao et al.Nov 13, 2024
Single‐molecule localization super‐resolution fluorescence imaging relies on the fluorescence ON/OFF switching of fluorescent probes to break the diffraction limit. However, the unreacted or nonspecifically bound probes cause non‐targeted ON/OFF switching, resulting in substantial fluorescence background that significantly reduces localization precision and accuracy. Here, we report a blinkogenic probe HM‐DS655‐Halo that remains blinking OFF until it binds to HaloTag, thereby triggering its self‐blinking activity and enabling its application in direct SMLM imaging in living cells without wash‐out steps. We employed the ratio of the duty cycle before and after self‐blinking activation, termed as the parameter "RDC" to characterize blinkogenicity. The covalent binding to HaloTag induces HM‐DS655‐Halo to transition from a fluorescent OFF state to a fluorescence blinking state. This transition also leads to a change in the RDC value, which is calculated to be 12, ensuring super blinkogenicity to effectively suppress background signals in living cells. HM‐DS655‐Halo was successfully applied in dynamic SMLM imaging of diverse intracellular sub‐structures with minimal background noise, including mitochondrial fission and contact, cell migration, and pseudopod growth.