RN
Rienk Nieuwland
Author with expertise in Exosome Biology and Function in Intercellular Communication
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(86% Open Access)
Cited by:
1,576
h-index:
33
/
i10-index:
59
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

Minimal information for studies of extracellular vesicles (MISEV2023): From basic to advanced approaches

Joshua Welsh et al.Feb 1, 2024
+135
T
A
J
Abstract Extracellular vesicles (EVs), through their complex cargo, can reflect the state of their cell of origin and change the functions and phenotypes of other cells. These features indicate strong biomarker and therapeutic potential and have generated broad interest, as evidenced by the steady year‐on‐year increase in the numbers of scientific publications about EVs. Important advances have been made in EV metrology and in understanding and applying EV biology. However, hurdles remain to realising the potential of EVs in domains ranging from basic biology to clinical applications due to challenges in EV nomenclature, separation from non‐vesicular extracellular particles, characterisation and functional studies. To address the challenges and opportunities in this rapidly evolving field, the International Society for Extracellular Vesicles (ISEV) updates its ‘Minimal Information for Studies of Extracellular Vesicles’, which was first published in 2014 and then in 2018 as MISEV2014 and MISEV2018, respectively. The goal of the current document, MISEV2023, is to provide researchers with an updated snapshot of available approaches and their advantages and limitations for production, separation and characterisation of EVs from multiple sources, including cell culture, body fluids and solid tissues. In addition to presenting the latest state of the art in basic principles of EV research, this document also covers advanced techniques and approaches that are currently expanding the boundaries of the field. MISEV2023 also includes new sections on EV release and uptake and a brief discussion of in vivo approaches to study EVs. Compiling feedback from ISEV expert task forces and more than 1000 researchers, this document conveys the current state of EV research to facilitate robust scientific discoveries and move the field forward even more rapidly.
0

Measuring circulating cell‐derived microparticles

Wenche Jy et al.Sep 28, 2004
+14
J
L
W
Cell-derived microparticles (MPs) are receiving increasing attention in recent years, both as a diagnostic aid and investigative tool [1-4]. Because they carry markers of the parent cell, including those induced by activation or apoptosis, endothelial MPs (EMPs) can provide valuable information on the status of the parent cell, obtainable in no other way. In addition, there is a growing belief that MPs can function as important diffusible vectors of specific adhesins and cytokines promoting cellular interactions and signal transmission [2]. Thus MP analysis constitutes a new avenue for investigation of pathologies in various diseases. Although still considered investigational [1-4], recent results from several laboratories suggest that MP analysis may be poised to enter the mainstream of clinical testing. However, a major impediment to that end is the wide variety of methodologies used by different laboratories in this field, few of which can be directly compared to the others, and results from which are sometimes inconsistent or conflicting. As a first step in addressing that problem, the Editor has organized this Forum article, consisting of a brief description of the preferred methods and rationality from each of six active laboratories in the field, including our own [5-10]. Table 1 lists some key features of the six methodological approaches. It is seen that major differences exist in the preparation of the MP samples (such as centrifugation), whether or not they are first sedimented and resuspended, means of generic MP detection (4 of 6 use annexin V), and cell lineage-specific antigenic markers. These differences probably account for some of the different findings among the groups.
0
Citation402
0
Save
0

EVpedia: a community web portal for extracellular vesicles research

Dae-Kyum Kim et al.Nov 10, 2014
+92
S
J
D
Abstract Motivation: Extracellular vesicles (EVs) are spherical bilayered proteolipids, harboring various bioactive molecules. Due to the complexity of the vesicular nomenclatures and components, online searches for EV-related publications and vesicular components are currently challenging. Results: We present an improved version of EVpedia, a public database for EVs research. This community web portal contains a database of publications and vesicular components, identification of orthologous vesicular components, bioinformatic tools and a personalized function. EVpedia includes 6879 publications, 172 080 vesicular components from 263 high-throughput datasets, and has been accessed more than 65 000 times from more than 750 cities. In addition, about 350 members from 73 international research groups have participated in developing EVpedia. This free web-based database might serve as a useful resource to stimulate the emerging field of EV research. Availability and implementation: The web site was implemented in PHP, Java, MySQL and Apache, and is freely available at http://evpedia.info. Contact: ysgho@postech.ac.kr
0
Paper
Citation345
0
Save
1

MIFlowCyt‐EV: a framework for standardized reporting of extracellular vesicle flow cytometry experiments

Joshua Welsh et al.Feb 3, 2020
+24
S
F
J
ABSTRACT Extracellular vesicles (EVs) are small, heterogeneous and difficult to measure. Flow cytometry (FC) is a key technology for the measurement of individual particles, but its application to the analysis of EVs and other submicron particles has presented many challenges and has produced a number of controversial results, in part due to limitations of instrument detection, lack of robust methods and ambiguities in how data should be interpreted. These complications are exacerbated by the field's lack of a robust reporting framework, and many EV‐FC manuscripts include incomplete descriptions of methods and results, contain artefacts stemming from an insufficient instrument sensitivity and inappropriate experimental design and lack appropriate calibration and standardization. To address these issues, a working group (WG) of EV‐FC researchers from ISEV, ISAC and ISTH, worked together as an EV‐FC WG and developed a consensus framework for the minimum information that should be provided regarding EV‐FC. This framework incorporates the existing Minimum Information for Studies of EVs (MISEV) guidelines and Minimum Information about a FC experiment (MIFlowCyt) standard in an EV‐FC‐specific reporting framework (MIFlowCyt‐EV) that supports reporting of critical information related to sample staining, EV detection and measurement and experimental design in manuscripts that report EV‐FC data. MIFlowCyt‐EV provides a structure for sharing EV‐FC results, but it does not prescribe specific protocols, as there will continue to be rapid evolution of instruments and methods for the foreseeable future. MIFlowCyt‐EV accommodates this evolution, while providing information needed to evaluate and compare different approaches. Because MIFlowCyt‐EV will ensure consistency in the manner of reporting of EV‐FC studies, over time we expect that adoption of MIFlowCyt‐EV as a standard for reporting EV‐ FC studies will improve the ability to quantitatively compare results from different laboratories and to support the development of new instruments and assays for improved measurement of EVs.
12

A compendium of single extracellular vesicle flow cytometry

Joshua Welsh et al.Feb 1, 2023
+21
M
G
J
Flow cytometry (FCM) offers a multiparametric technology capable of characterizing single extracellular vesicles (EVs). However, most flow cytometers are designed to detect cells, which are larger than EVs. Whereas cells exceed the background noise, signals originating from EVs partly overlap with the background noise, thereby making EVs more difficult to detect than cells. This technical mismatch together with complexity of EV-containing fluids causes limitations and challenges with conducting, interpreting and reproducing EV FCM experiments. To address and overcome these challenges, researchers from the International Society for Extracellular Vesicles (ISEV), International Society for Advancement of Cytometry (ISAC), and the International Society on Thrombosis and Haemostasis (ISTH) joined forces and initiated the EV FCM working group. To improve the interpretation, reporting, and reproducibility of future EV FCM data, the EV FCM working group published an ISEV position manuscript outlining a framework of minimum information that should be reported about an FCM experiment on single EVs (MIFlowCyt-EV). However, the framework contains limited background information. Therefore, the goal of this compendium is to provide the background information necessary to design and conduct reproducible EV FCM experiments. This compendium contains background information on EVs, the interaction between light and EVs, FCM hardware, experimental design and preanalytical procedures, sample preparation, assay controls, instrument data acquisition and calibration, EV characterization, and data reporting. Although this compendium focuses on EVs, many concepts and explanations could also be applied to FCM detection of other particles within the EV size range, such as bacteria, lipoprotein particles, milk fat globules, and viruses.
12
Paper
Citation44
2
Save
1

M1-derived extracellular vesicles polarize recipient macrophages into M2 and alter skeletal muscle homeostasis in a hyper-glucose environment

Stefano Tacconi et al.Oct 3, 2023
+14
C
F
S
ABSTRACT Background Macrophages release not only cytokines but also extracellular vesicles (EVs). EVs are small lipid-derived vesicles with virus-like properties transferring lipids, RNA and proteins between cells. Until now, the consequences of macrophage plasticity on the release and the composition of EVs have been poorly explored. In this study, we determined the impact of high-glucose (HG) concentrations on macrophage metabolism, and characterized their derived EV subpopulations. Finally, we determined whether HG-treated macrophage-derived EVs participate in immune responses and in metabolic alterations of skeletal muscle cells. Methods THP1-macrophages (M0) were treated with 15mM (MG15) or 30mM (MG30) glucose. M1 or M2 canonical markers, pro– and anti-inflammatory cytokines and lactate production were evaluated. Macrophage-derived EVs were characterized by TEM, flow cytometry, and 1H-Nuclear magnetic resonance spectroscopy for lipid composition. M0 macrophages or C2C12 muscle cells were used as recipients of MG15 and MG30-derived EVs. The lipid profiles of recipient cells were determined, as well as protein and mRNA levels of relevant genes for macrophage polarization or muscle metabolism. Results M0 released 2 populations of small and large EVs (sEVs, lEVs) with specific lipid profiles. Proportionally to the glucose concentration, glucose-treatment induced glycolysis in M0 macrophages which consequently shifted into a pro-inflammatory M1 phenotype, containing increased triacylglycerol and cholesterol content. Glucose also affected macrophage sphingolipid and phospholipid compositions. The lipid profile differences between sEVs and lEVs were abolished and represented the lipid profile alterations of MG15 and MG30 macrophages. Both sEVs and lEVs from M15 and M30 macrophages polarized M0 into anti-inflammatory M2, with increased contents of triacylglycerol and cholesterol. MG15 lEVs and sEVs induced insulin-induced AKT hyper-phosphorylation and accumulation of triacylglycerol in muscle cells, a state observed in pre-diabetes. Conversely, MG30 lEVs and sEVs induced insulin resistance in myotubes. Conclusions As inflammation involves first M1 macrophages, then the activation of M2 macrophages to attenuate inflammation, this study demonstrates that the dialog between macrophages through the EV route is an intrinsic part of the inflammatory response. In a hyperglycemic context, EV macrophages could participate in the development of muscle insulin-resistance and chronic inflammation.
0

Leukocyte Extracellular Vesicles Predict Progression of Systolic Dysfunction in Heart Failure with Mildly Reduced Ejection Fraction (LYCHEE) – A Prospective, Multicentre Cohort Study

Aleksandra Gąsecka et al.Sep 24, 2024
+17
P
A
A
Abstract Risk stratification in heart failure with mildly-reduced ejection fraction (HFmrEF) remains challenging. We evaluated the predictive value of advanced glycation end products (AGEs) and plasma concentrations of extracellular vesicles (EVs) for the systolic and diastolic dysfunction progression in HFmrEF patients. Skin AGE accumulation was measured using AGE Reader. Plasma EV concentrations were measured using flow cytometry. Among 74 patients enrolled, 13 (18%) had systolic dysfunction progression and 5 (7%) had diastolic dysfunction progression during 6.5 months follow-up. Leukocyte EVs concentrations were higher in patients with systolic dysfunction progression ( p = 0.002) and predicted the progression with 75.0% sensitivity and 58.3% specificity, independent of other clinical variables (OR 4.72, 95% CI 0.99–22.31). Skin AGE levels and concentrations of other EV subtypes were not associated with systolic or diastolic dysfunction progression. Increased leukocyte EVs concentrations are associated with 4.7-fold higher odds of systolic dysfunction progression in HFmrEF patients. Graphical Abstract AGE – advanced glycation end products, HFmrEF – heart failure with mildly reduced ejection fraction, ECHO – echocardiography, EV – extracellular vesicles