Abstract Rift Valley fever (RVF) is a mosquito-borne viral zoonosis caused by the RVF virus (RVFV) that can infect domestic and wild animals. Although the RVFV transmission cycle has been well documented across Africa in savanna ecosystems, little is known about its transmission in tropical rainforest settings, particularly in Central Africa. We therefore conducted a survey in northeastern Gabon to assess RVFV circulation among wild and domestic animals. Among 163 wildlife samples tested using RVFV-specific RT-qPCR, four ruminants belonging to subfamily Cephalophinae were detected positive. The phylogenetic analysis revealed that the four RVFV sequences clustered together with a virus isolated in Namibia within the well-structured Egyptian clade. A cross-sectional survey conducted on sheep, goats and dogs living in villages within the same area determined the IgG RVFV-specific antibody prevalence using cELISA. Out of the 306 small ruminants tested (214 goats, 92 sheep), an overall antibody prevalence of 15.4% (95% CI [11.5–19.9]) was observed with a higher rate in goats than in sheep (20.1% versus 3.3%). RVFV-specific antibodies were detected in a single dog out 26 tested. Neither age, sex of domestic animals nor season was found to be significant risk factors of RVFV occurrence. Our findings highlight sylvatic circulation of RVFV for the first time in Gabon. These results stress the need to develop adequate surveillance plan measures to better control the public health threat of RVFV. Author summary Rift Valley fever (RVF) is a mosquito-borne viral zoonosis caused by the RVF virus (RVFV) that can affect wild and domestic animals. Although the RVFV transmission cycle has been well documented across Africa in savanna ecosystems, little is known about its transmission in tropical rainforests, especially in Central Africa. We thus conducted a survey in northeastern Gabon to assess RVFV circulation among wild and domestic animals. In this study, we demonstrated for the first time in Gabon the presence of the RVFV in two wildlife species (Peter’s duiker Cephalophus callipygus and the blue duiker Philantomba monticola ). In addition, we detected RVFV-specific antibodies in small domestic ruminants (sheep and goats) with an overall antibody prevalence of 15.4%, with a much higher seroprevalence rate in goats than sheep (20.1% versus 3.3%). Furthermore, RVFV-specific antibodies were also observed in a single (hunting) dog out of the 26 tested. These results stress the need to develop adequate surveillance plan measures to better control the public health threat of RVFV.

The protozoan Toxoplasma gondii is a ubiquitous and highly prevalent parasite that can theoretically infect all warm-blooded vertebrates. In humans, toxoplasmosis causes infections in both immunodeficient and immunocompetent patients, congenital toxoplasmosis, and ocular lesions. These manifestations have different degrees of severity. Clinical severity is determined by multiple factors, including the genotype of the T. gondii strain involved in the infection. T. gondii exhibits remarkable genetic diversity, which varies according to geography and ecotype (domestic or wild). Previous studies have demonstrated that wild strains of T. gondii are of particular epidemiological interest, as they have been associated with more severe forms of toxoplasmosis in different regions of the world. However, no data on wild strains of T. gondii are available from Africa. In this study, we describe for the first time a wild T. gondii strain from Africa. Wild animals from the forest environment of Gabon, Central Africa, were screened for chronic infection with T. gondii using quantitative PCR. The infecting T. gondii strains were genotyped whenever possible by the analysis of 15 microsatellite markers and by whole-genome sequencing. A new T. gondii genotype was identified in the DNA extract from a heart sample of a duiker ( Cephalophus sp.) and was found to be highly divergent from previously described T. gondii populations worldwide, including those from domestic environments in Gabon. This discovery suggests the existence of a wild T. gondii population in Africa. The role of wild T. gondii strains in the incidence of severe toxoplasmosis in Africa remains unclear and requires further investigation.