Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
WH
Whitney Heavner
Author with expertise in Olfactory Dysfunction in Health and Disease
Achievements
This user has not unlocked any achievements yet.
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(33% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
10
/
i10-index:
10
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Differential chromatin accessibility in developing projection neurons is correlated with transcriptional regulation of cell fate

Whitney Heavner et al.May 21, 2019
We are only just beginning to catalog the vast diversity of cell types in the cerebral cortex. Such categorization is a first step toward understanding how diversification relates to function. All cortical projection neurons arise from a uniform pool of progenitor cells that lines the ventricles of the forebrain. It is still unclear how these progenitor cells generate the more than fifty unique types of mature cortical projection neurons defined by their distinct gene expression profiles. Here we compare gene expression and chromatin accessibility of two subclasses of projection neurons with divergent morphological and functional features as they develop in the mouse brain between embryonic day 13 and postnatal day 5 in order to identify transcriptional networks that diversity neuron cell fate. We find groups of transcription factors whose expression is correlated with chromatin accessibility, transcription factor binding motifs, and lncRNAs that define each subclass and validate the function of a family of novel candidate genes in vitro. Our multidimensional approach reveals that subclass-specific chromatin accessibility is significantly correlated with gene expression, providing a resource for generating new specific genetic drivers and revealing regions of the genome that are particularly susceptible to harmful genetic mutations by virtue of their correlation with important developmental genes.
0

Widespread Remodeling of Synaptic Protein Interaction Networks Following Homeostatic Plasticity in Cortical Neurons Requires Homer1 and Shank3

Whitney Heavner et al.Mar 28, 2020
Neurons maintain constant levels of excitability using homeostatic scaling, which adjusts relative synaptic strength in response to large changes in overall activity. While previous studies have catalogued the transcriptomic and proteomic changes associated with scaling, the resulting alterations in synaptic protein interaction networks (PINs) are less well understood. Here, we monitor a glutamatergic synapse PIN composed of 380 binary interactions among 21 protein members to identify protein complexes altered by synaptic scaling. In cultured cortical neurons, we observe widespread bidirectional PIN alterations with up- versus downscaling. In the barrel cortex, the PIN response to 48 hours of sensory deprivation exhibits characteristics of both upscaling and downscaling, consistent with emerging models of excitatory/inhibitory balance in cortical plasticity. Mice lacking Homer1 or Shank3B do not undergo normal PIN rearrangements, suggesting that these Autism Spectrum Disorder (ASD)-linked proteins serve as structural hubs for synaptic homeostasis. Our approach demonstrates how previously identified RNA and protein-level changes induced during homeostatic scaling translate into functional PIN alterations.