The urban microclimate is essential for accurate simulation-based urban building energy modelling (UBEM). However, a high spatial-resolution microclimate can increase the computational resources demands of UBEM. Surrogate modelling is one of the promising approaches for fast UBEM. This study proposes a bidirectional Long Short-Term Memory (LSTM)-based approach for simulation-based UBEM surrogate modelling. The estimations are aggregated into census tracts using total building floor area. A case study using UBEM to estimate annual hourly building energy use and anthropogenic heat from all existing buildings in Los Angeles County found that most of the surrogate models can complete the annual hourly simulation within 90 minutes with a normalized mean absolute error lower than 10%, and that the bidirectional LSTM outperforms the standard LSTM in accuracy. This study demonstrates the advantages of bidirectional RNN architecture in building energy surrogate modelling and is expected to promote long-term and high-resolution UBEM with detailed microclimates.

Berberine (BBR) is used to treat diarrhea clinically, its reproductive toxicity, however, is poorly documented. This study aims to investigate the impact of BBR on the male reproductive system. Gradient doses of BBR were administered orally to experimental mice for consecutive 14 days. The gut microbiota, sperm concentration of cauda epididymis, and serum testosterone levels were measured after the last dose for assessing the effects of BBR. Moreover, the metabolome and transcriptome of the mice and microbiota were also investigated. Intragastric BBR administration resulted in a significant decrease in serum testosterone levels and epididymal sperm concentration in mice, which was attributed to a dramatic decrease of Muribaculaceae abundance in the gut microbiota of mice. Both fecal microbiota transplantation (FMT) and polyethylene glycol (PEG) treatment experiments also demonstrated that Muribaculaceae is necessary for spermatogenesis. Metabolomic analysis revealed that BBR affected the arginine and proline metabolism pathways, of which ornithine levels were downregulated after BBR administration. Intragastric administration of M. intestinale and its metabolite ornithine to BBR-treated mice achieved a recovery of sperm concentration and testosterone levels. RNA sequencing of testes showed the genes related to the LDLR-mediated cholesterol-synthesis testosterone pathway were downregulated after BBR administration. The levels of testosterone increased and Ldlr gene became more transcriptionally active in TM3 cells cultured in media supplemented with ornithine. This study for the first time revealed an association between BBR-induced gut Muribaculaceae dysbiosis and defects in spermatogenesis via ornithine metabolism, which provided a candidate and strategy for the treatment of infertility caused by a decreased serum testosterone level-induced by gut microbiota dysbiosis.

Objective: To explore the prognostic value of log odds of positive lymph nodes (LODDS) in patients with gastroenteropancreatic neuroendocrine tumors (GEPNET) and to develop nomograms based on LODDS for predicting 1-year, 3-year, and 5-year overall survival (OS) and cancer-specific survival (CSS). Methods: This retrospective cohort study was based on the Surveillance, Epidemiology, and End Results (SEER) Program. Demographic data, clinical data, and survival status were extracted, with endpoints of OS and CSS. Multivariate Cox proportional hazards regression analysis assessed predictors associated with OS and CSS, with hazard ratios (HRs) and 95% confidence intervals (CIs) evaluated. Nomogram performance was assessed by calculating the area under the receiver operating characteristic (ROC) curve (AUC). Results: A total of 1,673 patients were included and divided into a training set (n = 1,172) and a testing set (n = 501). Multivariate Cox proportional hazards regression analyses identified LODDS as an independent prognostic factor for OS (HR = 1.79, 95% CI: 1.44–2.24) and CSS (HR = 1.81, 95% CI: 1.41–2.31). The OS and CSS nomograms, developed from multivariate Cox regression analyses, showed good performance, with AUCs of 0.858, 0.878, and 0.852 for predicting 1-year, 3-year, and 5-year OS, and AUCs of 0.859, 0.887, and 0.865 for 1-year, 3-year, and 5-year CSS in the testing set. The nomograms are accessible online (OS: https://zhmte.shinyapps.io/DynNomapp/; CSS: https://zhmty.shinyapps.io/DynNomapp/). Conclusions: LODDS serves as an independent prognostic factor in GEPNET. Online nomograms based on LODDS demonstrated effective performance in predicting OS and CSS in GEPNET patients, providing a convenient tool for clinical application.