LM
Leslie Morales
Author with expertise in Gliomas
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(50% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
4
/
i10-index:
1
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Role of RIPK1 in Diffuse Gliomas pathology

Leslie Morales et al.Jan 1, 2023
Purpose: The aim of the present work was to investigate the role of Receptor-interacting protein kinase 1 (RIPK1) both in mutated and wild type isocitrate dehydrogenase (IDH) Diffuse Gliomas (DG). Patients and Methods: We analyzed RIPK1 mRNA expression in DG databases from The Cancer Genome Atlas (TCGA) containing clinical, genomic and transcriptomic information from 661 patients. Transcriptomic studies (mRNA expression levels, correlation heatmaps, survival plots and Gene Ontology and meta-analysis of immune gene signatures) were performed with USC Xena and R. Statistical significance was set at p-values less than 0.05. Results: The results showed a lower survival probability in patients belonging to the high RIPK1 expression subgroup compared to those samples with low RIPK1 expression. We also observed a higher expression of RIPK1 in wtIDH samples compared to those with mIDH. In order to further characterize the role of RIPK1 in DG, we performed a Gene Ontology and Pathway Enrichment Analysis using the Xena platform differential expression tool. The results showed that RIPK1 is involved in inflammatory and immune responses. Hence, the expression levels of some of the genes involved in the following molecular processes crucial for cancer progression were studied: proliferation, epithelial-mesenchymal transition, immune cell infiltration and cell death pathways. Briefly, the results showed significant differences in genes related to increased cellular dedifferentiation, proinflammatory cell death pathways and tumor infiltrating immune cells gene signatures (Welchs t-test). Conclusion: RIPK1 over-expression is associated with a poor prognosis in DG. This fact, together with our results suggest that RIPK1 may play a crucial role in glioma pathogenesis highlighting the need to take into account RIPK1 expression levels for decision making when choosing or designing therapeutic alternatives.
1

Exploring the metastatic role of the inhibitor of apoptosis BIRC6 in Breast Cancer

Santiago Bergna et al.Apr 10, 2021
Abstract Breast cancer is the most common cancer as well as the first cause of death by cancer in women worldwide. BIRC6 (baculoviral IAP repeat-containing protein 6) is a member of the inhibitors of apoptosis protein family thought to play an important role in the progression or chemoresistance of many cancers. The aim of the present work was to investigate the role of apoptosis inhibitor BIRC6 in breast cancer, focusing particularly on its involvement in the metastatic cascade. We analyzed BIRC6 mRNA expression levels and Copy Number Variations (CNV) in three breast cancer databases from The Cancer Genome Atlas (TCGA) comparing clinical and molecular attributes. Genomic analysis was performed using CBioportal platform while transcriptomic studies (mRNA expression levels, correlation heatmaps, survival plots and Gene Ontology) were performed with USC Xena and R. Statistical significance was set at p-values less than 0.05. Our analyses showed that there was a differential expression of BIRC6 in cancer samples when compared to normal samples. CNV that involve amplification and gain of BIRC6 gene were correlated with negative hormone receptor tumors, higher prognostic indexes, younger age at diagnosis and both chemotherapy and radiotherapy administration. Transcriptomic and gene-ontology analyses showed that, in conditions of high BIRC6 mRNA levels, there are differential expression patterns in apoptotic, proliferation, and metastatic pathways. In summary, our in silico analyses suggest that BIRC6 exhibits an antiapoptotic, pro-proliferative and an apparent pro-metastatic role and could be a relevant molecular target for treatment of Breast Cancer tumors.