Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
DK
D. Kim
Author with expertise in Advancements in Lung Cancer Research
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(50% Open Access)
Cited by:
285
h-index:
3
/
i10-index:
3
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Prevalence and mutational determinants of high tumor mutation burden in breast cancer

Romualdo Barroso‐Sousa et al.Aug 24, 2019
Background: High tumor mutation burden (TMB) has been associated with benefit to immunotherapy in multiple tumor types. However, the prevalence of hypermutated breast cancer is not well described. The aim of this study is to evaluate frequency, mutational patterns, and genomic profile of hypermutated breast cancer. Patients and Methods: We used de-identified data from individuals with primary or metastatic breast cancer from six different publicly available genomic studies. The prevalence of hypermutated breast cancer was determined among 3969 patient samples that underwent whole exome sequencing or gene panel sequencing. Samples were classified as having high TMB if they had ≥ 10 mutations per megabase (mut/Mb). An additional 8 patients were identified from a Dana-Farber Cancer Institute cohort for inclusion in the hypermutated cohort. Among patients with high TMB, the mutational patterns, and genomic profile were determined. A subset of patients was treated with regimens containing PD-1 inhibitors. Results: The median TMB was 2.63 mut/Mb. Median TMB significantly varied according to tumor subtype (HR-/HER2- > HER2+ > HR+/HER2-, p < 0.05) and sample type (metastatic > primary, p 2.2x10-16). Hypermutated tumors were found in 198 patients (5%), with an enrichment in metastatic versus primary tumors (8.4% versus 2.9%, p = 6.5 x 10-14). APOBEC activity (59.2%), followed by mismatch repair deficiency (MMRd; 36.4%), were the most common mutational processes among hypermutated tumors. Three patients with hypermutated breast cancer, including two with a dominant APOBEC activity signature and one with a dominant MMRd signature; treated with pembrolizumab-based therapies derived an objective and durable response to therapy. Conclusion: Hypermutation occurs in 5% of all breast cancers, with an enrichment in metastatic tumors. Different mutational signatures are present in this population, with APOBEC activity being the most common dominant process. Preliminary data suggest that hypermutated breast cancers are more likely to benefit from PD-1 inhibitors.