WB
Wolfgang Brandt
Author with expertise in Plant Nutrient Uptake and Signaling Pathways
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(83% Open Access)
Cited by:
1,557
h-index:
42
/
i10-index:
138
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Virtual screening for plant PARP inhibitors – what can be learned from human PARP inhibitors?

Peter-Paul Heym et al.May 1, 2012
The functions of Poly(ADP-ribose) polymerase enzymes (PARPs) in general are best studied based on human PARP-1 (HsPARP-1). HsPARP-1 is well investigated because pharmacological modulation of its activity modulates DNA-binding of antitumor drugs [1]. In contrast to human PARP enzymes, the exact role of PARPs in plants remains to be elucidated. Different stresses activate plant PARP enzymes to mediate DNA repair and (programmed) cell death whereas the addition of PARP inhibitors decreases the degree of cell death [2]. Therefore, the development of plant PARP inhibitors might be a way to increase the tolerance against abiotic stress. Initial to searches in commercial databases for potential plant PARP inhibitors, a virtual screening route had to be established for human PARP-1 inhibitors. Simultaneously, every step in that procedure was applied on a plant PARP enzyme to investigate the differences of both active sites. All differences have been evaluated statistically, e.g. using receiver-operator characteristics (ROC) and power analyses. At the end of that parallel screening route, a docking threshold for Arabidopsis thaliana L. PARP-1 (AtPARP-1) could be derived by knowledge transfer from the corresponding human receptor and its inhibitors. Figure 1 Key steps in virtual screening routes for human and Arabidopsis thaliana L. PARP-1. The results have been used to successfully apply the screening process for AtPARP-1 on a commercial database. Knowing the differences of the human and plant screening routes, predictions of the applicability of that multi-step process on a commercial database have been explored. Finally, the developed virtual screening route has been applied to screen a commercial database for AtPARP-1 inhibitors. From 20 compounds tested so far in vitro, 13 show inhibitory effects.
0

Two novel 7-epi-zingiberene derivatives with biological activity from Solanum habrochaites are produced by a single cytochrome P450 monooxygenase

Sebastian Zabel et al.Apr 23, 2020
Abstract Secretions from glandular trichomes potentially protect the plant against a variety of aggressors. In the tomato genus, wild species constitute a rich source of chemical diversity produced at the leaf surface by glandular trichomes. Previously, 7- epi -zingiberene produced in several accessions of Solanum habrochaites was found to confer resistance to whiteflies ( Bemisia tabaci ) and other insect pests. Here, we identify two derivatives of 7- epi -zingiberene from S. habrochaites that had not been reported as yet. We identified them as 9-hydroxy-zingiberene and 9-hydroxy-10,11-epoxyzingiberene. Using a combination of genetics and transcriptomics we identified a single cytochrome P450 oxygenase, ShCYP71D184 that carries out two successive oxidations to generate the two sesquiterpenoids. Bioactivity assays showed that only 9-hydroxy-10,11-epoxyzingiberene exhibits substantial toxicity against B. tabaci . In addition, both 9-hydroxy-zingiberene and 9-hydroxy-10,11-epoxyzingiberene display substantial growth inhibitory activities against a range of microorganisms, including Bacillus subtilis , Phytophtora infestans and Botrytis cinerea . Our work shows that trichome secretions from wild tomato species can provide protection against a wide variety of organisms. In addition, the availability of the genes encoding the enzymes for the pathway of 7- epi -zingiberene derivatives makes it possible to introduce this trait in cultivated tomato by precision breeding.
0
Citation2
0
Save
17

Bacterial-type plant ferroxidases tune local phosphate sensing in root development

Ryno Naudé et al.Mar 21, 2021
Abstract Fluctuating bioavailability of inorganic phosphate (Pi), often caused by complex Pi-metal interactions, guide root tip growth and root system architecture for maximizing the foraged soil volume. Two interacting genes in Arabidopsis thaliana , PDR2 (P5-type ATPase) and LPR1 (multicopper oxidase), are central to external Pi monitoring by root tips, which is modified by iron (Fe) co-occurrence. Upon Pi deficiency, the PDR2-LPR1 module facilitates cell type-specific Fe accumulation and cell wall modifications in root meristems, inhibiting intercellular communication and thus root growth. LPR1 executes local Pi sensing, whereas PDR2 restricts LPR1 function. We show that native LPR1 displays specific ferroxidase activity and requires a conserved acidic triad motif for high-affinity Fe 2+ binding and root growth inhibition under limiting Pi. Our data indicate that substrate availability tunes LPR1 function and implicate PDR2 in maintaining Fe homeostasis. LPR1 represents the prototype of an ancient ferroxidase family, which evolved very early upon bacterial colonization of land. During plant terrestrialization, horizontal gene transfer transmitted LPR1-type ferroxidase from soil bacteria to the common ancestor of Zygnematophyceae algae and embryophytes, a hypothesis supported by homology modeling, phylogenomics, and activity assays of bacterial LPR1-type multicopper oxidases.
17
Citation1
0
Save