ABSTRACT Immune evasion is indispensable for cancer initiation and progression, although its underlying mechanisms in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) remain elusive. Here, we unveiled a cancer cell-autonomous function of PGRN in driving immune evasion in primary PDAC. Tumor- but not macrophage-derived PGRN was associated with poor overall survival in PDAC. Multiplex immunohistochemistry revealed low MHC class I (MHCI) expression and lack of CD8+ T cells infiltration in PGRN-high tumors. Inhibition of PGRN abrogated autophagy-dependent MHCI degradation and restored MHCI expression on PDAC cells. Antibody-based blockade of PGRN in a genetic PDAC mouse model remarkably decelerated tumor initiation and progression. Notably, tumors expressing LCMV-gp33 as model antigen were sensitized towards cytotoxic gp33-TCR transgenic T cells upon anti-PGRN antibody treatment. Overall, our study uncovered an unprecedented role of tumor-derived PGRN in regulating immunogenicity of primary PDAC. STATEMENT OF SIGNIFICANCE Immune evasion is a key property of PDAC, rendering it refractory to immunotherapy. Here we demonstrate that tumor-derived PGRN promotes autophagy-dependent MHCI degradation, while anti-PGRN increases intratumoral CD8 infiltration and blocks tumor progression. With recent advances in T cell-mediated approaches, PGRN represents a pivotal target to enhance tumor antigen-specific cytotoxicity.

Abstract Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is an aggressive cancer with poor prognosis. Drug resistance is the major cause for therapeutic failure in PDAC patients with progressive disease. The mechanisms underlying resistance formation are complex and remain poorly understood. To gain insights into molecular changes during the formation of resistance to oncogenic MAPK pathway inhibition we utilized short-term passaged primary tumor cells from ten PDACs of genetically engineered mice. We followed gain and loss of resistance upon MEK i exposure and withdrawal by longitudinal integrative analysis of whole genome sequencing, whole genome bisulfite sequencing, RNA-sequencing and mass spectrometry data. We found that resistant cell populations under increasing MEK i treatment evolved by the expansion of a single clone but were not a direct consequence of known resistance-conferring mutations. Rather, resistant cells showed adaptive DNA hypermethylation of 209 and hypomethylation of 8 genomic sites, most of which overlap with regulatory elements known to be active in murine PDAC cells. Both DNA methylation changes and MEK i resistance were transient and reversible upon drug withdrawal. The effector caspase CASP3 is one of the 114 genes for which transcriptional downregulation inversely correlated with the methylation status of the associated DNA region. CASP3 inactivation in resistant cells led to attenuation of drug-induced apoptosis which could be reversed by DNA methyltransferase inhibition with remarkable sensitivity exclusively in the resistant cells. Overall, our data provide a context for characterization and targeting of epigenetically mediated resistance mechanisms in PDAC.

Biliary tract cancers (BTCs) exhibit high mortality rates and significant heterogeneity in both clinical and molecular characteristics. This study aims to molecularly characterize a cohort of patients with BTC, with a specific focus on genomic alterations within homologous recombination repair (HRR) genes in a real-world setting.