Type II cryoglobulinemia is a vasculitis characterized by cryoglobulins consisting of complexes of polyclonal IgG and monoclonal IgM rheumatoid factors, the cause of these immune complexes is unknown, though both the hepatitis B (HBV) and C (HCV) viruses have been suspected.

Although hepatitis C virus (HCV) infection is very common, identification of patients during acute infection is rare. Consequently, little is known about the immune response during this critical stage of the disease. We analyzed the T lymphocyte response during and after acute resolving HCV infection in three persons, using interferon (IFN)-γ enzyme-linked immunospot (ELISPOT) and human histocompatibility leukocyte antigen (HLA) peptide tetramer assays. Acute infection was associated with a broadly directed T helper and cytotoxic T lymphocyte (CTL) response, which persisted after resolution of clinical hepatitis and clearance of viremia. At the earliest time point studied, highly activated CTL populations were observed that temporarily failed to secrete IFN-γ, a “stunned” phenotype, from which they recovered as viremia declined. In long-term HCV-seropositive persons, CTL responses were more common in persons who had cleared viremia compared with those with persistent viremia, although the frequencies of HCV-specific CTLs were lower than those found in persons during and after resolution of acute HCV infection. These studies demonstrate a strong and persistent CTL response in resolving acute HCV infection, and provide rationale to explore immune augmentation as a therapeutic intervention in chronic HCV infection.

Fecal microbiota transplantation (FMT) is an emerging therapy for recurrent or refractory Clostridioides difficile infection and is being actively investigated for other conditions. We describe two patients in whom extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli bacteremia occurred after they had undergone FMT in two independent clinical trials; both cases were linked to the same stool donor by means of genomic sequencing. One of the patients died. Enhanced donor screening to limit the transmission of microorganisms that could lead to adverse infectious events and continued vigilance to define the benefits and risks of FMT across different patient populations are warranted.

Hepatitis C virus (HCV) has emerged as an important etiologic agent of liver injury and failure in patients infected with human immunodeficiency virus (HIV). The prevalence and characteristics of HCV in a representative cohort of HIV-infected patients have not been described. Therefore, a representative sample of 1687 HIV-infected patients was studied; a 213-sample subcohort was selected by use of risk-based sampling from 2 large prospective US Adult AIDS Clinical Trials Group clinical trials. HCV prevalence, HCV RNA level, and genotype were determined. The weighted overall estimate of HCV prevalence in the study cohort was 16.1% (95% weighted confidence interval, 14.3%-17.8%), with significant variability depending on risk factors and HIV RNA levels. Among patients defined as being "at risk", 72.7% were HCV positive, whereas, among low-risk patients, the positivity rate was 3.5%. Genotype 1 was found in 83.3% of infected patients. Median HCV RNA level was 6.08x106 IU/mL. High virus loads and genotype 1 prevalence may be important to interferon-based antiviral response rates among coinfected patients.

Recognizing the importance of timely guidance regarding the rapidly evolving field of hepatitis C management, the American Association for the Study of Liver Diseases (AASLD) and the Infectious Diseases Society of America (IDSA) developed a web-based process for the expeditious formulation and dissemination of evidence-based recommendations. Launched in 2014, the hepatitis C virus (HCV) guidance website undergoes periodic updates as necessitated by availability of new therapeutic agents and/or research data. A major update was released electronically in September 2017, prompted primarily by approval of new direct-acting antiviral agents and expansion of the guidance's scope. This update summarizes the latest release of the HCV guidance and focuses on new or amended recommendations since the previous September 2015 print publication. The recommendations herein were developed by volunteer hepatology and infectious disease experts representing AASLD and IDSA and have been peer reviewed and approved by each society's governing board.

Transcription activator-like effector nucleases (TALENs) are a new class of engineered nucleases that are easier to design to cleave at desired sites in a genome than previous types of nucleases. We report here the use of TALENs to rapidly and efficiently generate mutant alleles of 15 genes in cultured somatic cells or human pluripotent stem cells, the latter for which we differentiated both the targeted lines and isogenic control lines into various metabolic cell types. We demonstrate cell-autonomous phenotypes directly linked to disease—dyslipidemia, insulin resistance, hypoglycemia, lipodystrophy, motor-neuron death, and hepatitis C infection. We found little evidence of TALEN off-target effects, but each clonal line nevertheless harbors a significant number of unique mutations. Given the speed and ease with which we were able to derive and characterize these cell lines, we anticipate TALEN-mediated genome editing of human cells becoming a mainstay for the investigation of human biology and disease.

The human virome plays important roles in health and immunity. However, current methods for detecting viral infections and antiviral responses have limited throughput and coverage. Here, we present VirScan, a high-throughput method to comprehensively analyze antiviral antibodies using immunoprecipitation and massively parallel DNA sequencing of a bacteriophage library displaying proteome-wide peptides from all human viruses. We assayed over 10(8) antibody-peptide interactions in 569 humans across four continents, nearly doubling the number of previously established viral epitopes. We detected antibodies to an average of 10 viral species per person and 84 species in at least two individuals. Although rates of specific virus exposure were heterogeneous across populations, antibody responses targeted strongly conserved "public epitopes" for each virus, suggesting that they may elicit highly similar antibodies. VirScan is a powerful approach for studying interactions between the virome and the immune system.

Mitochondrial DNA (mtDNA) is a critical activator of inflammation and the innate immune system. However, mtDNA level has not been tested for its role as a biomarker in the intensive care unit (ICU). We hypothesized that circulating cell-free mtDNA levels would be associated with mortality and improve risk prediction in ICU patients.Analyses of mtDNA levels were performed on blood samples obtained from two prospective observational cohort studies of ICU patients (the Brigham and Women's Hospital Registry of Critical Illness [BWH RoCI, n = 200] and Molecular Epidemiology of Acute Respiratory Distress Syndrome [ME ARDS, n = 243]). mtDNA levels in plasma were assessed by measuring the copy number of the NADH dehydrogenase 1 gene using quantitative real-time PCR. Medical ICU patients with an elevated mtDNA level (≥3,200 copies/µl plasma) had increased odds of dying within 28 d of ICU admission in both the BWH RoCI (odds ratio [OR] 7.5, 95% CI 3.6-15.8, p = 1×10(-7)) and ME ARDS (OR 8.4, 95% CI 2.9-24.2, p = 9×10(-5)) cohorts, while no evidence for association was noted in non-medical ICU patients. The addition of an elevated mtDNA level improved the net reclassification index (NRI) of 28-d mortality among medical ICU patients when added to clinical models in both the BWH RoCI (NRI 79%, standard error 14%, p<1×10(-4)) and ME ARDS (NRI 55%, standard error 20%, p = 0.007) cohorts. In the BWH RoCI cohort, those with an elevated mtDNA level had an increased risk of death, even in analyses limited to patients with sepsis or acute respiratory distress syndrome. Study limitations include the lack of data elucidating the concise pathological roles of mtDNA in the patients, and the limited numbers of measurements for some of biomarkers.Increased mtDNA levels are associated with ICU mortality, and inclusion of mtDNA level improves risk prediction in medical ICU patients. Our data suggest that mtDNA could serve as a viable plasma biomarker in medical ICU patients.

Abstract Although the serum-abundant metal-binding protein transferrin (encoded by the Trf gene) is synthesized primarily in the liver, its function in the liver is largely unknown. Here, we generated hepatocyte-specific Trf knockout mice (Trf-LKO), which are viable and fertile but have impaired erythropoiesis and altered iron metabolism. Moreover, feeding Trf-LKO mice a high-iron diet increased their susceptibility to developing ferroptosis-induced liver fibrosis. Importantly, we found that treating Trf-LKO mice with the ferroptosis inhibitor ferrostatin-1 potently rescued liver fibrosis induced by either high dietary iron or carbon tetrachloride (CCl4) injections. In addition, deleting hepatic Slc39a14 expression in Trf-LKO mice significantly reduced hepatic iron accumulation, thereby reducing ferroptosis-mediated liver fibrosis induced by either a high-iron diet or CCl4 injections. Finally, we found that patients with liver cirrhosis have significantly lower levels of serum transferrin and hepatic transferrin, as well as higher levels of hepatic iron and lipid peroxidation, compared with healthy control subjects. Taken together, these data indicate that hepatic transferrin plays a protective role in maintaining liver function, providing a possible therapeutic target for preventing ferroptosis-induced liver fibrosis.