RD
Rachel Diner
Author with expertise in Dynamics and Pathogenesis of Cholera Bacteria
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(67% Open Access)
Cited by:
540
h-index:
10
/
i10-index:
10
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Biological Impacts of the 2013–2015 Warm-Water Anomaly in the Northeast Pacific: Winners, Losers, and the Future

Letícia Cavole et al.Jan 1, 2016
+9
R
A
L
beaches along the central and southern coast of California.Bluefin tuna appeared in record numbers in California waters.Such shifts in migration of this scale had not been previously observed for nektonic species (Table 1).The consequences of the WWA were far-reaching, and may presage future ecological shifts as global temperatures rise.FIGURE 1. Sea surface temperature (SST) anomalies showing the progression of the warm water anomaly (WWA) from December 2013 through January 2016 in the northeastern Pacific Ocean.
0
Paper
Citation539
0
Save
12

Host and Water Microbiota are Differentially Linked to Potential Human Pathogen Accumulation in Oysters

Rachel Diner et al.Oct 11, 2022
+7
E
A
R
Abstract Oysters play an important role in coastal ecology and are a globally popular seafood source. However, their filter feeding lifestyle enables coastal pathogens, toxins, and pollutants to accumulate in their tissues, potentially endangering human health. For example, bacterial pathogens from both marine and terrestrial sources concentrate in oysters and can cause human illness when oysters are consumed raw. While pathogen concentrations in coastal waters are often linked to environmental conditions and runoff events, these do not always correlate with pathogen concentrations in oysters. Additional factors related to oyster hosts and the microbial ecology of pathogenic bacteria likely play a role in accumulation but are poorly understood. In this study, we investigated whether microbial communities in water and oysters were linked to accumulation of fecal indicators, Vibrio parahaemolyticus , and Vibrio vulnificus . Site-specific environmental conditions significantly influenced the composition and diversity of water microbial communities, which were linked to the highest concentrations of both Vibrio spp. and fecal indicator bacteria. Oyster microbial communities, however, were less impacted by environmental variability and exhibited less variability in microbial community diversity and accumulation of target bacteria. Instead, changes in specific microbial taxa in oyster and water samples, particularly in oyster digestive glands, were linked to elevated potential pathogens in oysters, especially V. parahaemolyticus . This included an increase in cyanobacteria in both water and oyster digestive gland microbial communities, which could represent an environmental vector for Vibrio spp. transport and decreased relative abundance of Mycoplasma and other key members of the oyster digestive gland microbiota. These findings suggest that host and microbial factors, in addition to environmental variables, may influence pathogen accumulation in oysters.
12
Citation1
0
Save
0

Diatom Centromeres Suggest a Novel Mechanism for Nuclear Gene Acquisition

Rachel Diner et al.Dec 22, 2016
+12
N
C
R
Centromeres are essential for cell division and growth in all eukaryotes, and knowledge of their sequence and structure guides the development of artificial chromosomes for functional cellular biology studies. Centromeric proteins are conserved among eukaryotes; however, centromeric DNA sequences are highly variable. We combined forward and reverse genetic approaches with chromatin immunoprecipitation to identify centromeres of the model diatom Phaeodactylum tricornutum. Diatom centromere sequences contain low GC content regions and an abundance of long contiguous AT windows, but lack repeats or other conserved sequence features. Native and foreign sequences of similar GC content can maintain episomes and recruit the diatom centromeric histone protein CENP-A, suggesting non-native sequences can also function as diatom centromeres. Thus, simple sequence requirements enable DNA from foreign sources to incorporate into the nuclear genome repertoire as stable extra-chromosomal episomes, revealing a potential mechanism for bacterial and foreign eukaryotic DNA acquisition.