At least 25% of patients with positive Candida albicans bloodstream infection also have one or more bacterial species associated with the infection. These polymicrobial infections are usually caused by coagulase-negative staphylococci, most commonly Staphylococcus epidermidis and are associated with significantly worse clinical outcomes as compared to monomicrobial infections. Here we show bacteria are present in C. albicans cultures started from isolated single colony platting. These co-evolving bacteria can only be detected by the use of specific selective medium and/or long periods of incubation from 8 days up to 48 weeks (approximately 4,000 generations), used in experimental evolution methods. The detection of these co-evolving bacteria is highly dependent on the type of enzyme used for 16S rRNA gene amplification and is often missed in clinical laboratory analysis because of short incubation periods, media and temperatures, used in mycology clinical routine, that are unfavorable for bacterial growth. In this study, we identified bacteria in cultures of different C. albicans isolates from long term, continuous growth by molecular analysis and microscopy. Also, we confirmed the presence of these co-evolving bacteria by identification of S. epidermidis genome segments in sequencing reads of the C. albicans reference strain SC5314 genome sequencing project raw data deposited in GenBank. This result rules out the possibility of laboratory specific contamination. Also, we show that the presence of associated bacteria correlates with antifungal resistance alterations observed in growth under hypoxia. Our findings show the intense interaction between C. albicans yeasts and bacteria and have direct implications in yeast clinical procedures, especially concerning patient treatment.

Genetic contributions of Neandertals to the modern human genome have been evidenced by comparative analyses of present day human genomes and paleogenomes. The current data indicates that Neandertal introgression is higher in Asians and Europeans and lower in African lines of descent. Neandertal signatures in extant human genomes are attributed to intercrosses between Neandertals and ancient Homo sapiens lineages, or archaic Anatomically Modern Humans (AMH) that migrated from Africa into the Middle East and Europe in the last 50,000 years. It has been proposed however that there is no contribution of Neandertal mitochondrial DNA to contemporary human genomes. Here we show that the modern human mitochondrial genome might contain potential 66 Neandertal signatures, or Neandertal single nucleotide variants (N-SNVs) of which 7 are associated with traits such as cycling vomiting syndrome and Alzheimers' and Parkinsons' diseases and 2 N-SNVs associated with intelligence quotient. Principal component analysis and bootscan tests suggest rare recombination events. Also, contrary to what is observed in the nuclear genome, African mitochondrial haplogoups have more potential Neandertal signatures than Asian and European haplogroups. Based on our results we hypothesize that although most intercrosses occurred between Neandertal males and archaic AMH females, crosses between archaic AMH males and Neandertal females were extremely rare and with rare recombination events thus leaving few marks (66 out of 16,569bp) in present day mitochondrial genomes of human populations.