KN
Kjell Nikus
Author with expertise in Genomic Studies and Association Analyses
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
9
(56% Open Access)
Cited by:
2,261
h-index:
48
/
i10-index:
144
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Randomized Study on Simple Versus Complex Stenting of Coronary Artery Bifurcation Lesions

Terje Steigen et al.Oct 24, 2006
The optimal stenting strategy in coronary artery bifurcation lesions is unknown. In the present study, a strategy of stenting both the main vessel and the side branch (MV+SB) was compared with a strategy of stenting the main vessel only, with optional stenting of the side branch (MV), with sirolimus-eluting stents.A total of 413 patients with a bifurcation lesion were randomized. The primary end point was a major adverse cardiac event: cardiac death, myocardial infarction, target-vessel revascularization, or stent thrombosis after 6 months. At 6 months, there were no significant differences in rates of major adverse cardiac events between the groups (MV+SB 3.4%, MV 2.9%; P=NS). In the MV+SB group, there were significantly longer procedure and fluoroscopy times, higher contrast volumes, and higher rates of procedure-related increases in biomarkers of myocardial injury. A total of 307 patients had a quantitative coronary assessment at the index procedure and after 8 months. The combined angiographic end point of diameter stenosis >50% of main vessel and occlusion of the side branch after 8 months was found in 5.3% in the MV group and 5.1% in the MV+SB group (P=NS).Independent of stenting strategy, excellent clinical and angiographic results were obtained with percutaneous treatment of de novo coronary artery bifurcation lesions with sirolimus-eluting stents. The simple stenting strategy used in the MV group was associated with reduced procedure and fluoroscopy times and lower rates of procedure-related biomarker elevation. Therefore, this strategy can be recommended as the routine bifurcation stenting technique.
57

A multi-layer functional genomic analysis to understand noncoding genetic variation in lipids

Shweta Ramdas et al.Dec 8, 2021
Abstract A major challenge of genome-wide association studies (GWAS) is to translate phenotypic associations into biological insights. Here, we integrate a large GWAS on blood lipids involving 1.6 million individuals from five ancestries with a wide array of functional genomic datasets to discover regulatory mechanisms underlying lipid associations. We first prioritize lipid-associated genes with expression quantitative trait locus (eQTL) colocalizations, and then add chromatin interaction data to narrow the search for functional genes. Polygenic enrichment analysis across 697 annotations from a host of tissues and cell types confirms the central role of the liver in lipid levels, and highlights the selective enrichment of adipose-specific chromatin marks in high-density lipoprotein cholesterol and triglycerides. Overlapping transcription factor (TF) binding sites with lipid-associated loci identifies TFs relevant in lipid biology. In addition, we present an integrative framework to prioritize causal variants at GWAS loci, producing a comprehensive list of candidate causal genes and variants with multiple layers of functional evidence. Two prioritized genes, CREBRF and RRBP1 , show convergent evidence across functional datasets supporting their roles in lipid biology.
57
Citation1
0
Save
0

Multi-ancestry GWAS of the electrocardiographic PR interval identifies 210 loci underlying cardiac conduction

Ιωάννα Ντάλλα et al.Jul 24, 2019
The electrocardiographic PR interval reflects atrioventricular conduction, and is associated with conduction abnormalities, pacemaker implantation, atrial fibrillation (AF), and cardiovascular mortality[1][1],[2][2]. We performed multi-ancestry (N=293,051) and European only (N=271,570) genome-wide association (GWAS) meta-analyses for the PR interval, discovering 210 loci of which 149 are novel. Variants at all loci nearly doubled the percentage of heritability explained, from 33.5% to 62.6%. We observed enrichment for genes involved in cardiac muscle development/contraction and the cytoskeleton highlighting key regulation processes for atrioventricular conduction. Additionally, 19 novel loci harbour genes underlying inherited monogenic heart diseases suggesting the role of these genes in cardiovascular pathology in the general population. We showed that polygenic predisposition to PR interval duration is an endophenotype for cardiovascular disease risk, including distal conduction disease, AF, atrioventricular pre-excitation, non-ischemic cardiomyopathy, and coronary heart disease. These findings advance our understanding of the polygenic basis of cardiac conduction, and the genetic relationship between PR interval duration and cardiovascular disease. [1]: #ref-1 [2]: #ref-2
0

Brugada syndrome, early repolarization syndrome/j-wave syndromes, and a subtype of idiopathic ventricular fibrillation: microstructural cardiomyopathies

Andrés Pérez‐Riera et al.Jul 31, 2024
Brugada Syndrome is an inherited cardiac channelopathy with a high incidence of ventricular fibrillation and sudden cardiac death in patients with structurally normal hearts. Diagnosis is based on a characteristic electrocardiographic pattern (coved type ST-segment elevation ≥2 mm followed by a negative T-wave in ≥1 in the right precordial leads V1-V2) combined with an absence of gross structural abnormalities and several other criteria. The cornerstone of BrS diagnosis and definition, is its characteristic ECG pattern that can be present spontaneously or unmasked by drugs. This entity was described by the Brugada brothers in 1992 and belongs to a group of diseases known as inherited primary arrhythmia syndromes. The prevalence varies among regions and ethnicities, affecting mostly males. Despite several genes identified, SCN5A seems to be the most affected gene related BrS (≈ 30% of patients). The current main therapy is an implantable cardioverter-defibrillator, but radiofrequency catheter ablation has been recently reported as an effective new treatment.
0

Exome chip meta-analysis elucidates the genetic architecture of rare coding variants in smoking and drinking behavior

Dajiang Liu et al.Sep 12, 2017
Background: Smoking and alcohol use behaviors in humans have been associated with common genetic variants within multiple genomic loci. Investigation of rare variation within these loci holds promise for identifying causal variants impacting biological mechanisms in the etiology of disordered behavior. Microarrays have been designed to genotype rare nonsynonymous and putative loss of function variants. Such variants are expected to have greater deleterious consequences on gene function than other variants, and significantly contribute to disease risk. Methods: In the present study, we analyzed ~250,000 rare variants from 17 independent studies. Each variant was tested for association with five addiction-related phenotypes: cigarettes per day, pack years, smoking initiation, age of smoking initiation, and alcoholic drinks per week. We conducted single variant tests of all variants, and gene-based burden tests of nonsynonymous or putative loss of function variants with minor allele frequency less than 1%. Results: Meta-analytic sample sizes ranged from 70,847 to 164,142 individuals, depending on the phenotype. Known loci tagged by common variants replicated, but there was no robust evidence for individually associated rare variants, either in gene based or single variant tests. Using a modified method-of-moment approach, we found that all low frequency coding variants, in aggregate, contributed 1.7% to 3.6% of the phenotypic variation for the five traits (p<.05). Conclusions: The findings indicate that rare coding variants contribute to phenotypic variation, but that much larger samples and/or denser genotyping of rare variants will be required to successfully identify associations with these phenotypes, whether individual variants or gene- based associations.
0

The cardioprotective effects of adenosine-induced cardioplegic arrest versus saline in aortic valve replacement patients: A randomized controlled trial

Mikko Mattila et al.Sep 5, 2024
Background and aims: Adenosine is a widely used potent cardioprotective drug, but the effect of an adenosine bolus in initial cardioplegia on cardioprotection in aortic valve replacement (AVR) patients has not been demonstrated. The aim of this double-blind randomized clinical trial was to compare intra-aortic adenosine bolus with saline on the postoperative myocardial function in patients undergoing AVR. Methods: Aortic valve stenosis patients scheduled for elective or urgent AVR surgery were randomized to receive either a 20 mg (4 mL) single dose of adenosine or a saline into the ascending aorta during the first cardioplegia infusion. The primary outcome was cardiac index (CI (L/min/m 2 ) at four timepoints (before incision, after weaning from cardiopulmonary bypass (CPB), at 7 p.m. on the operation day, and at 6 a.m. the next morning). Secondary outcomes included left ventricular stroke work index, right ventricular stroke work index, and myocardial biomarkers at the same timepoints. Results: Between November 2015 and March 2018, 45 patients were recruited, 23 in the adenosine group and 22 in the placebo group. The last follow-up date was 17 March 2018. There were no statistically significant differences in CI (mean differences with 95% confidence interval (95% CI): 0.09 L/min/m 2 at baseline (−0.20 to 0.38), −1.39 L/min/m 2 (−3.47 to 0.70) at post-CPB, −0.39 L/min/m 2 (−0.78 to 0.004) at 7 p.m., and −0.32 L/min/m 2 (−0.68 to 0.05) at 6 a.m., ( p = 0.066)), right ventricular stroke work index, ( p = 0.24), or cardiac biomarkers between the groups. Left ventricular stroke work index was lower in the adenosine group (−3.66 gm/m 2 (−11.13 to 3.81) at baseline, −17.42 gm/m 2 (−37.81 to 2.98) at post-CPB, −3.36 gm/m 2 (−11.10 to 4.38) at 7 p.m., and −3.77 gm/m 2 (−10.19 to 2.66) at 6 a.m. ( p = 0.021)). Conclusions: There were no differences between 20 mg adenosine bolus and saline in the first cardioplegia infusion in CI improvement in AVR surgery for aortic valve stenosis. EudraCT number: 2014-001382-26.