Panzootic chytrid fungus out of Asia Species in the fungal genus Batrachochytrium are responsible for severe declines in the populations of amphibians globally. The sources of these pathogens have been uncertain. O'Hanlon et al. used genomics on a panel of more than 200 isolates to trace the source of the frog pathogen B. dendrobatidis to a hyperdiverse hotspot in the Korean peninsula (see the Perspective by Lips). Over the past century, the trade in amphibian species has accelerated, and now all lineages of B. dendrobatidis occur in traded amphibians; the fungus has become ubiquitous and is diversifying rapidly. Science , this issue p. 621 ; see also p. 604

ABSTRACT Parasitic chytrid fungi have emerged as a significant threat to amphibian species worldwide, necessitating the development of techniques to isolate these pathogens into sterile culture for research purposes. However, early methods of isolating chytrids from their hosts relied on killing amphibians. We modified a pre-existing protocol for isolating chytrids from infected animals to use toe clips and biopsies from toe webbing rather than euthanizing hosts, and distributed the protocol to interested researchers worldwide as part of the BiodivERsA project RACE – here called the RML protocol. In tandem, we developed a lethal procedure for isolating chytrids from tadpole mouthparts. Reviewing a database of use a decade after their inception, we find that these methods have been widely applied across at least 5 continents, 23 countries and in 62 amphibian species, and have been successfully used to isolate chytrids in remote field locations. Isolation of chytrids by the non-lethal RML protocol occured in 18% of attempts with 207 fungal isolates and three species of chytrid being recovered. Isolation of chytrids from tadpoles occured in 43% of attempts with 334 fungal isolates of one species ( Batrachochytrium dendrobatidis ) being recovered. Together, these methods have resulted in a significant reduction and refinement of our use of threatened amphibian species and have improved our ability to work with this important group of emerging fungal pathogens.

Abstract The good functioning of aquatic ecosystems is essential for providing diverse ecosystem services that benefit humans. The degradation of ecosystem health due to continuous stressors, such as climate change or water pollution, is leading to an increase in human health risks and well-being. Indicators have been developed to determine human health risks from recreational and drinking water. Still, a general application to aquatic ecosystems linking ecosystem health and human health risks has not been done. We here reviewed indicators and indices applied to assess the health of aquatic ecosystems and their links with human health risk and well-being. We evaluated the extent to which indicators can witness a risk to human health and well-being. A total of 245 articles were reviewed, consisting of 185 on the assessment of aquatic ecosystem health and 60 linking ecosystem health and human health or well-being. Out of the 65 indices described, we evaluated the use of several parameters and their relevance to evaluate human health risks, including physico-chemical parameters, bioindicators, contaminants, and pathogens, therefore covering the various sources of ecosystem disturbance. Based on our assessment, we propose a set of indicators that would allow for the inclusion of risks for human health and well-being in the assessment of ecosystem health (e.g. coliforms, algae, pH, nutrients, chemical compounds, and ecosystem services). Measuring these parameters should be incorporated into future studies to allow an understanding of the linkage of ecosystem and human health.