Klebsiella pneumoniae is recognised as a major threat to public health, with increasing emergence of multidrug-resistant lineages including strains resistant to all available antibiotics. We present an in-depth analysis of 178 extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing Klebsiella strains, with a high background diversity and two dominant lineages, as well as several equally resistant lineages with less prevalence. Neither the overall resistance profile nor the virulence factors explain the prevalence of some lineages; we observe several putative hypervirulence factors across the population, including a reduced virulence plasmid, but this does not correlate with expansion of one or few highly virulent and resistant lineages. Phenotypic analysis of the profiles of resistance traits shows that the vast majority of the phenotypic resistance profiles can be explained by detailed genetic analyses. The main discrepancies are observed for beta-lactams combined with beta-lactamase inhibitors, where most, but not all, resistant strains carry a carbapenemase or ampC. Complete genomes for six selected strains, including three of the 21 carbapenem-resistant ones, are reported, which give detailed insights into the early evolution of the bla-NDM-1 enzyme, a carbapenemase that was first reported in 2009 and is now globally distributed. Whole-genome based high-resolution analyses of the dominant lineages suggests a very dynamic picture of gene transfer and selection, with phenotypic changes due to plasmid acquisition and chromosomal changes, and emphasize the need to monitor the bacteria at high resolution to understand the rise of high-risk clones, which cannot be explained by obvious differences in resistance profiles or virulence factors.

The global spread of extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing and carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) poses a significant concern. Acquisition of antimicrobial resistance genes leads to resistance against several antibiotics, limiting treatment options. We aimed to study ESBL-producing and CRE transmission in clinical settings.

Resistance to current antimalarial drugs is steadily increasing, and new drugs are required. Drug efficacy trials remain the gold standard to assess the effectiveness of a given drug. The World Health Organization (WHO)’s recommendation for the optimal duration of follow-up for assessing antimalarial efficacy is a minimum of 28 days. However, assessing antimalarial drug efficacy in highly endemic regions can be challenging due to the potential risks of acquiring a new infection in the follow-up period, and thus, it may underestimate the efficacy of the given drugs. A new treatment should be introduced if treatment failure rates exceed 10%. Overestimation occurs as a result of retaining a drug with a clinical efficacy of less than 90% with increases in morbidity and mortality, while underestimation may occur due to a misclassification of new infections as treatment failures with tremendous clinical and economic implications. Therefore, molecular genotyping is necessary to distinguish true new infections from treatment failures to ensure accuracy in determining antimalarial efficacy. There are three genetic markers that are commonly used in antimalarial efficiency trials to discriminate between treatment failures and new infections. These include merozoite surface protein 1 (msp-1), merozoite surface protein 2 (msp-2), and glutamate-rich protein (glurp). The genotyping of P. falciparum by nested polymerase chain reaction (n-PCR) targeting these markers is discussed with the inherent limitations and uncertainties associated with the PCR technique and limitations enforced by the parasite’s biology itself.

Silver nanoparticles (Ag-NPs) have wide applicability as antimicrobial, biomedical, and anti-cancer drug delivery systems. This study aimed to synthesize Ag-NPs using green methodology to assess their antimicrobial properties and toxicity. Ag-NPs were prepared using doxycycline, an antibiotic serving as a reducing and capping agent. The synthesized Ag-NPs were characterized by ultraviolet-visible spectrophotometry, X-ray diffraction, scanning electron microscopy, and Fourier-transform infrared spectrometry. The antimicrobial efficacy of doxycycline-mediated Ag-NPs was assessed on Candida species in vitro and for toxicity in male albino mice in vivo. The Ag-NPs showed a surface plasmon resonance at 411 nm, indicating a 90 nm average size and spherical shape. Toxicity was tested on mouse organs (liver, kidney, spleen, heart and stomach) using three Ag-NP doses (50, 100, 200 mg/kg) over 14 days. The synthesized Ag-NPs produced large inhibition zones against two well-known fungal species, C. albicans and C. tropicalis, demonstrating their antimicrobial potential. The Ag-NPs showed varying degrees of toxicity in different mouse organs, depending on the administered dose, with more pronounced adverse effects observed at higher concentrations. Periodic administration of Ag-NPs at low-dose volumes holds promise as a safe approach to their use as antimicrobial agents. Low-dose Ag-NPs are minimally toxic and show strong antimicrobial efficacy.