Non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) is one of the most common liver diseases, but its underlying mechanism is poorly understood. Here we show that hepatocyte nuclear factor 4α (HNF4α), a liver-enriched nuclear hormone receptor, is markedly inhibited, whereas miR-34a is highly induced in patients with non-alcoholic steatohepatitis, diabetic mice and mice fed a high-fat diet. miR-34a is essential for HNF4α expression and regulates triglyceride accumulation in human and murine hepatocytes. miR-34a inhibits very low-density lipoprotein secretion and promotes liver steatosis and hypolipidemia in an HNF4α-dependent manner. As a result, increased miR-34a or reduced HNF4α expression in the liver attenuates the development of atherosclerosis in Apoe−/− or Ldlr−/− mice. These data indicate that the miR-34a-HNF4α pathway is activated under common conditions of metabolic stress and may have a role in the pathogenesis of NAFLD and in regulating plasma lipoprotein metabolism. Targeting this pathway may represent a novel approach for the treatment of NAFLD. The nuclear hormone receptor HNF4α is important for liver function. Here, Xu et al.show that miR-34a regulates expression of HNF4α and is increased under conditions of metabolic stress, suggesting miR-34a promotes the development of non-alcoholic fatty liver disease.

To assess whether the integration of PD-1 inhibitor with total neoadjuvant therapy (iTNT) can lead to an improvement in complete responses (CRs) and favors a watch-and-wait (WW) strategy in patients with proficient mismatch repair or microsatellite stable (pMMR/MSS) locally advanced rectal cancer (LARC).

Abstract Reactive oxygen species (ROS) can act as second messengers for various signaling pathways, and abnormal oxidation contributes to multiple diseases, including cancer. Detecting and quantifying protein oxidation is crucial for a detailed understanding of redox signaling. We developed an Activated Thiol Sepharose (ATS)-based proteomic approach (ATSP) to globally quantify protein oxidation. ATSP can enrich for H 2 O 2 -sensitive thiol peptides, which are more likely to contain reactive cysteines involved in redox signaling. We applied our approach to analyze hereditary leiomyomatosis and renal cell carcinoma (HLRCC), a type of kidney cancer that harbors fumarate hydratase ( FH )-inactivating mutations and has elevated ROS levels. Multiple proteins were oxidized in FH-deficient cells, including many metabolic proteins, such as the M2 isoform of pyruvate kinase (PKM2). Treatment of HLRCC cells with dimethyl fumarate (DMF) or PKM2 activators alter PKM2 oxidation levels. This newly developed redox proteomics method can globally detect oxidation of reactive cysteines and can be employed to analyze multiple physiological and pathological conditions.

Hereditary Leiomyomatosis and Renal Cell Cancer (HLRCC) is an inherited cancer syndrome associated with a highly aggressive form of type 2 papillary renal cell carcinoma (PRCC). Germ line inactivating alterations in Fumarate Hydratase (FH) cause HLRCC, and result in elevated levels of reactive oxygen species (ROS). Recent work indicates that FH -/- PRCC cells have increased ABL1 activation, which promotes tumor growth, but how ABL1 is activated remained unclear. Oxidation can regulate protein-tyrosine phosphatase (PTP) catalytic activity; conceivably, ROS-catalyzed inactivation of an ABL-directed PTP might account for ABL1 activation in this malignancy. Previously, our group developed q-oxPTPome, a method that can globally monitor the oxidation of classical PTPs. We have now refined the q-oxPTPome approach, increasing its sensitivity by >10X. Applying q-oxPTPome to FH-deficient cell models shows that multiple PTPs are either highly oxidized (including PTPN12) or overexpressed. In general, highly oxidized PTPs were those that have relatively high sensitivity to exogenous H2O2. Most PTP oxidation in FH-deficient cells is reversible, although nearly 40% of PTPN13 is oxidized irreversibly to the sulfonic acid state. Using substrate-trapping mutants, we mapped PTPs to their putative substrates, and found that only PTPN12 could target ABL1. Furthermore, knockdown experiments identify PTPN12 as the major ABL1 phosphatase in HLRCC. Overall, our results show that ROS-induced PTPN12 oxidation accounts for ABL1 phosphorylation in HLRCC-associated PRCC, reveal a novel mechanism for inactivating a tumor suppressor gene product, and establish a direct link between pathological PTP oxidation and neoplastic disease.

Introduction This study aims to evaluate the efficacy of a computer vision system in guiding exercise management for patients with knee osteoarthritis (OA) by comparing functional improvement between a tele-rehabilitation versus an outpatient intervention program. Methods and analysis This is a prospective, single-blind, randomised controlled trial of 60 patients with knee OA who will be randomly assigned to exercise therapy (n=30) or control (n=30) . Both groups will receive treatment two times per week for 12 weeks. The primary outcome of the study will be assessed using the University of Western Ontario and McMaster University Osteoarthritis Index (WOMAC). The Knee Injury and Osteoarthritis Outcome Score will be assessed, as well as the visual analogue scale, quality of life score and physical fitness score. All observations will be collected at baseline and at weeks 4, 8 and 12 during the intervention period, as well as at weeks 4, 8, 12 and 24 during the follow-up visits after the end of the intervention. Ethics and dissemination This evaluator-blinded, prospective, randomised controlled study was approved by the Biomedical Ethics Review Committee of West China Hospital of Sichuan University. Trial registration number ChiCTR2300070319.

Understanding how incipient species are maintained with gene flow is a fundamental question in evolutionary biology. Whole genome sequencing of multiple individuals holds great potential to illustrate patterns of genomic differentiation as well as the associated evolutionary histories. Kentish (Charadrius alexandrinus) and the white-faced (C. dealbatus) plovers, which differ in their phenotype, ecology and behaviour, are two incipient species and parapatrically distributed in East Asia. Previous studies show evidence of genetic diversification with gene flow between the two plovers. Under this scenario, it is of great importance to explore the patterns of divergence at the genomic level and to determine whether specific regions are involved in reproductive isolation and local adaptation. Here we present the first population genomic analysis of the two incipient species based on the de novo Kentish plover reference genome and resequenced populations. We show that the two plover lineages are distinct in both nuclear and mitochondrial genomes. Using model-based coalescence analysis, we found that population sizes of Kentish plover increased whereas white-faced plovers declined during the Last Glaciation Period. Moreover, the two plovers diverged allopatrically, with gene flow occurring after secondary contact. This has resulted in low levels of genome-wide differentiation, although we found evidence of a few highly differentiated genomic regions in both the autosomes and the Z-chromosome. This study illustrates that incipient shorebird species with gene flow after secondary contact can exhibit discrete divergence at specific genomic regions and provides basis to further exploration on the genetic basis of relevant phenotypic traits.

The microstructure of the electrocatalyst plays a critical role in the reaction efficiency and stability during electrochemical water splitting. Designing an efficient and stable electrocatalyst, further clarifying the synthesis mechanism, is still an important problem to be solved urgently. Inspired by the copper pyrometallurgy theory, an exceptionally active NiMo/CF(N) electrode, consisting of an ant-nest-like copper foam substrate (defined as CF(N)) and deposited NiMo layer, was fabricated for the alkaline hydrogen evolution reaction (HER). Our findings expounded the structure construction mechanism and highlighted the pivotal role of the spatial occupancy of sulfur atoms in the construction of the ant-nest-like structure. The NiMo/CF(N) composite, characterized by channels with a 2 μm diameter, showcases strong electronic interactions, increased catalytic active sites, enhanced electron/ion transport, and facilitated gas release during HER. Remarkably, NiMo/CF(N) demonstrates ultralow overpotentials of 21 mV to deliver a current density of 10 mA cm