SJ
Silvia Jesús
Author with expertise in Genomic Studies and Association Analyses
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(60% Open Access)
Cited by:
121
h-index:
24
/
i10-index:
52
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

Genome‐wide association analysis of dementia and its clinical endophenotypes reveal novel loci associated with Alzheimer's disease and three causality networks: The GR@ACE project

Itziar Rojas et al.Aug 28, 2019
Large variability among Alzheimer's disease (AD) cases might impact genetic discoveries and complicate dissection of underlying biological pathways.Genome Research at Fundacio ACE (GR@ACE) is a genome-wide study of dementia and its clinical endophenotypes, defined based on AD's clinical certainty and vascular burden. We assessed the impact of known AD loci across endophenotypes to generate loci categories. We incorporated gene coexpression data and conducted pathway analysis per category. Finally, to evaluate the effect of heterogeneity in genetic studies, GR@ACE series were meta-analyzed with additional genome-wide association study data sets.We classified known AD loci into three categories, which might reflect the disease clinical heterogeneity. Vascular processes were only detected as a causal mechanism in probable AD. The meta-analysis strategy revealed the ANKRD31-rs4704171 and NDUFAF6-rs10098778 and confirmed SCIMP-rs7225151 and CD33-rs3865444.The regulation of vasculature is a prominent causal component of probable AD. GR@ACE meta-analysis revealed novel AD genetic signals, strongly driven by the presence of clinical heterogeneity in the AD series.
1
Citation114
0
Save
6

Long runs of homozygosity are associated with Alzheimer’s disease

María Fernández et al.Feb 24, 2021
Long runs of homozygosity (ROH) are contiguous stretches of homozygous genotypes, which are a footprint of inbreeding and recessive inheritance. The presence of recessive loci is suggested for Alzheimer's disease (AD); however, their search has been poorly assessed to date. To investigate homozygosity in AD, here we performed a fine-scale ROH analysis using 10 independent cohorts of European ancestry (11,919 AD cases and 9181 controls.) We detected an increase of homozygosity in AD cases compared to controls [βAVROH (CI 95%) = 0.070 (0.037-0.104); P = 3.91 × 10-5; βFROH (CI95%) = 0.043 (0.009-0.076); P = 0.013]. ROHs increasing the risk of AD (OR > 1) were significantly overrepresented compared to ROHs increasing protection (p < 2.20 × 10-16). A significant ROH association with AD risk was detected upstream the HS3ST1 locus (chr4:11,189,482‒11,305,456), (β (CI 95%) = 1.09 (0.48 ‒ 1.48), p value = 9.03 × 10-4), previously related to AD. Next, to search for recessive candidate variants in ROHs, we constructed a homozygosity map of inbred AD cases extracted from an outbred population and explored ROH regions in whole-exome sequencing data (N = 1449). We detected a candidate marker, rs117458494, mapped in the SPON1 locus, which has been previously associated with amyloid metabolism. Here, we provide a research framework to look for recessive variants in AD using outbred populations. Our results showed that AD cases have enriched homozygosity, suggesting that recessive effects may explain a proportion of AD heritability.
6
Citation6
0
Save
0

Combined Physiotherapy and Cognitive Behavioral Therapy for Functional Movement Disorders

Daniel Macías‐García et al.Aug 5, 2024
Importance Functional movement disorders (FMDs) are frequent and disabling neurological disorders with a substantial socioeconomic impact. Few randomized studies have analyzed the effectiveness of combined physiotherapy and psychotherapy in patients’ quality of life. Objective To assess the efficacy of multidisciplinary treatment (physiotherapy plus cognitive behavioral therapy) in FMDs. Design, Setting, and Participants This was a parallel, rater-blinded, single-center, randomized clinical trial. Recruitment took place from June 2022 to April 2023, and follow-up visits were performed at months 3 and 5, concluding in October 2023. Participants were recruited from a national referral center for movement disorders: the Movement Disorders Unit from the Hospital Universitario Virgen Rocio in Seville, Spain. Patients had to be 18 years or older with a confirmed FMD diagnosis and capable of giving consent to participate. Patients who did not meet eligibility criteria or refused to participate were excluded. Any uncontrolled psychiatric disorder was considered an exclusion criterion. Interventions Patients were randomly assigned, in a ratio of 1:1 to multidisciplinary treatment (physiotherapy plus cognitive behavioral therapy), or a control intervention (psychological support intervention). Main Outcomes and Measures Primary outcomes: between-group differences in changes from baseline to month 3 and month 5 in patients’ quality of life (EQ-5D-5L score: EQ Index and EQ visual analog scale [EQ VAS]; and 36-Item Short-Form Survey Physical Component Summary [SF-36 PCS] and SF-36 Mental Component Summary [MCS]). Linear mixed models were applied, controlling by baseline severity and applying Bonferroni correction. Results Of 70 patients screened with an FMD, 40 were enrolled (mean [SD] age, 43.5 [12.8] years; age range, 18-66 years; 32 female [80%]; mean [SD] age at FMD onset, 38.4 [12.1] years), and 38 completed all the follow-up visits and were included in the analysis for primary outcomes. Multidisciplinary treatment improved SF-36 PCS with a mean between-group difference at 3 months of 4.23 points (95% CI, −0.9 to 9.4 points; P = .11) and a significant mean between-group difference at 5 months of 5.62 points (95% CI, 2.3-8.9 points; P &amp;lt; .001), after multiple-comparisons adjustment. There were no significant differences in other quality-of-life outcomes such as SF-36 MCS (mean between-group difference at 3 and 5 months: 0.72 points; 95% CI, −5.5 to 7.0 points; P = .82 and 0.69 points; 95% CI, 2.3-8.9 points; P = .83, respectively), EQ VAS (9.34 points; 95% CI, −0.6 to 19.3 points; P = .07 and 13.7 points; 95% CI, −1.7 to 29.0 points; P = .09, respectively) and EQ Index (0.001 point; 95% CI, −0.1 to 0.1 point; P = .98 and 0.08 points; 95% CI, 0-0.2 points; P = .13, respectively). At months 3 and 5, 42% and 47% of patients, respectively, in the multidisciplinary group reported improved health using the EQ-5D system, compared with 26% and 16% of patients, respectively, in the control group. Conclusions and Relevance Results show that multidisciplinary treatment (physiotherapy plus cognitive behavioral therapy) effectively improves FMD symptoms and physical aspects of patients’ quality of life. Further studies must be performed to evaluate the potential cost-effectiveness of this approach in FMD. Trial Registration ClinicalTrials.gov Identifier: NCT05634486
0
Citation1
0
Save
0

The genetic architecture of Parkinson disease in Spain: characterizing population-specific risk, differential haplotype structures, and providing etiologic insight

Sara Bandrés‐Ciga et al.Apr 18, 2019
Background: The Iberian peninsula stands out as having variable levels of population admixture and isolation, making Spain an interesting setting for studying the genetic architecture of neurodegenerative diseases. Objectives: To perform the largest Parkinson disease (PD) genome-wide association study (GWAS) restricted to a single country. Methods: We performed a GWAS for both risk of PD and age at onset (AAO) in 7,849 Spanish individuals. Further analyses included population-specific risk haplotype assessments, polygenic risk scoring through machine learning, Mendelian randomization of expression and methylation data to gain insight into disease-associated loci, heritability estimates, genetic correlations and burden analyses. Results: We identified a novel population-specific GWAS signal at PARK2 associated with AAO. We replicated four genome-wide independent signals associated with PD risk, including SNCA, LRRK2, KANSL1/MAPT and HLA-DQB1. A significant trend for smaller risk haplotypes at known loci was found compared to similar studies of non-Spanish origin. Seventeen PD-related genes showed functional consequence via two-sample Mendelian randomization in expression and methylation datasets. Long runs of homozygosity at 28 known genes/loci were found to be enriched in cases versus controls. Conclusions: Our data demonstrate the utility of the Spanish risk haplotype substructure for future fine-mapping efforts, showing how leveraging unique and diverse population histories can benefit genetic studies of complex diseases. The present study points to PARK2 as a major hallmark of PD etiology in Spain.