PS
Peng Song
Author with expertise in Radiomics in Medical Imaging Analysis
Achievements
This user has not unlocked any achievements yet.
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(20% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
20
/
i10-index:
38
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

TESMIN is a Prognostic Biomarker Associated with Immunosuppression and Activated Cell Cycle in Lung Adenocarcinoma

Zhiyuan Yao et al.Sep 3, 2024
Background: The Testis Expressed Metallothionein Like Protein (TESMIN) gene encodes highly conserved, cysteine-rich, low-molecular proteins that are activated by and have an affinity for heavy metal ions. Previous literature has shown its association with cancer. Nevertheless, no thorough bioinformatics analysis of TESMIN has been done yet in lung adenocarcinoma (LUAD). Methods: Differential expression of TESMIN between cancer and normal tissues was confirmed by analyzing databases and immunohistochemistry staining. Enrichment analysis was adopted to explore biological functions. The relationship of TESMIN with immune infiltration was evaluated by ssGSVA, with immunotherapy response predicted by TCIA and TIDE tools, with mutational traits analyzed by R software. Drug sensitivity analysis was implemented via GSCA tool, pRRophetic algorithms, and CellMiner database. Results: The results demonstrated that TESMIN expression was upregulated in tumor tissue and related to Ki67. TESMIN was associated with poor survival and significantly related to age, gender, N stage, M stage, pathological stage, and survival status. TESMIN- related genes (TRGs) were primarily involved in cell division and cancer-related enrichment pathways. TESMIN was associated with high frequencies of somatic mutations and an immunosuppressive tumor microenvironment. Interestingly, patients with elevated levels of TESMIN expression benefited more from commonly used chemotherapy drugs such as cisplatin, paclitaxel, vinorelbine, and docetaxel, whereas those with low levels of TESMIN expression showed favorable clinical responses to immunotherapy. Conclusion: As a prognostic biomarker associated with the cell cycle and immune infiltration, TESMIN may serve as an effective target for predicting the sensitivity to immunotherapy and chemotherapy.
0

Cardiac computer tomography-derived radiomics in assessing myocardial characteristics at the connection between the left atrial appendage and the left atrium in atrial fibrillation patients

Xiaoxuan Wei et al.Jan 13, 2025
Objectives To evaluate the feasibility of utilizing cardiac computer tomography (CT) images for extracting the radiomic features of the myocardium at the junction between the left atrial appendage (LAA) and the left atrium (LA) in patients with atrial fibrillation (AF) and to evaluate its asscociation with the risk of AF. Methods A retrospective analysis was conducted on 82 cases of AF and 56 cases in the control group who underwent cardiac CT at our hospital from May 2022 to May 2023, with recorded clinical information. The morphological parameters of the LAA were measured. A radiomics model, a clincal feature model and a model combining radiomics and clinical features were constructed. The radiomics model was built by extracting radiomic features of the myocardial tissue using Pyradiomics, and employing Least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) method for feature selection, combining random forest with support vector machine (SVM) classifier. Results There were 82 cases in the AF group [44 males, 65.00 (59, 70)], and 56 cases in the control group (21 males, 61.09 ± 7.18). Age, BMI, hypertension, CHA2DS-VASC score, neutrophil to lymphocyte ratio (NLR), LAA volume, LA volume, the myocardial thickness at the junction of LAA and LA, the area, circumference, short diameter, and long diameter of the LAA opening, were significantly different between the AF group and the control group ( P &lt; 0.05). After conducting multivariate logistic regression analysis, it was found that BMI, the myocardial thickness at the junction of the LAA and the LA, LA volume, NLR and CHA2DS-VASC score were related to AF. 12 radiomics features of the myocardium at the junction of the LAA and the LA were extracted and identified. ROC curve analysis confirmed that the nomogram based on radiomics scores and clinical factors can effectively predict AF (AUC 0.869). Conclusion Radiomics enables the extraction of the myocardial characteristics at the junction of the LAA and the LA, which are related with AF, facilitating the assessment of its relationship with the risk of AF. The combination of radiomics with clinical characteristics enhances the evaluation capabilities significantly.